190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2034 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_2034  ribonuclease BN  100 
 
 		 303 aa  593  1e-168  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08426  Ribonuclease BN  52.65 
 
 		 307 aa  291  1e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.724596  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3487  putative ribonuclease BN  46.03 
 
 		 307 aa  266  2.9999999999999995e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1844  ribonuclease BN  35.22 
 
 		 330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00339541 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5015  ribonuclease BN  30.1 
 
 		 310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1074  hypothetical protein  29.58 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177301  normal  0.340121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5922  ribonuclease BN  31.23 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  0.574915 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  30.28 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1616  ribonuclease BN  31.02 
 
 		 318 aa  102  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119172  normal  0.116701 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  23.85 
 
 		 288 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  23.85 
 
 		 288 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  24.69 
 
 		 316 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1095  hypothetical protein  28.98 
 
 		 295 aa  93.6  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.377246 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  24.81 
 
 		 289 aa  92.4  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  25.2 
 
 		 283 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  25.39 
 
 		 283 aa  90.1  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  23.08 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  23.08 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  23.08 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  23.08 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  23.08 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  23.08 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  27.34 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  23.46 
 
 		 289 aa  87.4  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  27.34 
 
 		 299 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  26.15 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  23.02 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  23.26 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  27.69 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  25.39 
 
 		 363 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  27.69 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  26.09 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  26.07 
 
 		 392 aa  80.1  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  24.29 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  26.09 
 
 		 321 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  25.69 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  25.97 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  23.88 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  24.11 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  26.34 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  26.64 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  26.52 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  24.12 
 
 		 328 aa  73.6  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  24.9 
 
 		 367 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  26.21 
 
 		 316 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  27.31 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  27.45 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  25.77 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  22.99 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  23.08 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  25.39 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  24.04 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  24.88 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  25.26 
 
 		 396 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  24.76 
 
 		 397 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  25.48 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  25.12 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  24.76 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  25.12 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  24.07 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  24.43 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  23.67 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  22.8 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  23.64 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  23.13 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  23.64 
 
 		 388 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  37.8 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  24.83 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4741  ribonuclease BN  22.96 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  22.96 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  39.56 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  39.56 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  24.9 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  26.15 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  24.29 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  23.74 
 
 		 386 aa  63.5  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  21.46 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5235  ribonuclease BN  24.23 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.192166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  21.86 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3250  ribonuclease BN  22.57 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  34.52 
 
 		 377 aa  62.8  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  23.2 
 
 		 414 aa  62.4  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3115  ribonuclease BN  22.44 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0927  ribonuclease BN  24.33 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  21.2 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  31.37 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  34.44 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  24.71 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3556  ribonuclease BN  25 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176466  normal  0.953277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  23.77 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0308  putative ribonuclease BN  22.83 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.686269  normal  0.0663425 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  23.56 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3558  ribonuclease BN, putative  24.21 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3849  ribonuclease BN  25 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  21.84 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4883  ribonuclease BN  25.19 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  22.31 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2527  putative ribonuclease BN  23.64 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.322273 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2623  putative ribonuclease BN  23.32 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1381  putative ribonuclease BN  22.85 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.528846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>