More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5015 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5015  ribonuclease BN  100 
 
 		 310 aa  616  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1616  ribonuclease BN  42.23 
 
 		 318 aa  215  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119172  normal  0.116701 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1074  hypothetical protein  36.68 
 
 		 313 aa  178  8e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177301  normal  0.340121 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1844  ribonuclease BN  37.21 
 
 		 330 aa  168  9e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00339541 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1095  hypothetical protein  38.28 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.377246 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3487  putative ribonuclease BN  31.77 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5922  ribonuclease BN  34.04 
 
 		 323 aa  150  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  0.574915 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2034  ribonuclease BN  29.87 
 
 		 303 aa  147  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  31.84 
 
 		 277 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  29.75 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  30.62 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  30.62 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  29.15 
 
 		 289 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  29.21 
 
 		 289 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  28.84 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  28.84 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  28.84 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  28.84 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  28.84 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  28.84 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  28.73 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  27.74 
 
 		 328 aa  126  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  30.63 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  31.44 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08426  Ribonuclease BN  29.01 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.724596  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  31.05 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  31.62 
 
 		 392 aa  120  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  25.91 
 
 		 316 aa  119  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  31.98 
 
 		 331 aa  119  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  28.52 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  28.16 
 
 		 299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  28.47 
 
 		 317 aa  116  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  28.34 
 
 		 341 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  27.13 
 
 		 283 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  27.13 
 
 		 283 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  29.01 
 
 		 283 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  29.37 
 
 		 351 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  29 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  33.03 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  27.08 
 
 		 386 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  26.88 
 
 		 363 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  30.05 
 
 		 333 aa  105  9e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  27.17 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  27.92 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  28.11 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2816  putative ribonuclease BN  31.01 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  28.52 
 
 		 386 aa  102  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  26.71 
 
 		 347 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  27.39 
 
 		 388 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  27.27 
 
 		 289 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  27.24 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  27.39 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  27.76 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  27.8 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  28.68 
 
 		 291 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  29.23 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  28.72 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  27.21 
 
 		 328 aa  100  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  27.91 
 
 		 397 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  28.11 
 
 		 347 aa  99  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  27.91 
 
 		 397 aa  99  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  28.11 
 
 		 347 aa  99  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  25.99 
 
 		 330 aa  99  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  28.91 
 
 		 318 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  26.72 
 
 		 402 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  31.78 
 
 		 318 aa  98.2  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  28.91 
 
 		 318 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  26.92 
 
 		 386 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  26.32 
 
 		 374 aa  97.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  28.68 
 
 		 360 aa  97.4  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  28.44 
 
 		 319 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  28.14 
 
 		 317 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3558  ribonuclease BN, putative  32.22 
 
 		 325 aa  96.3  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  30.22 
 
 		 375 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1381  putative ribonuclease BN  27.24 
 
 		 296 aa  95.9  7e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.528846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  25.39 
 
 		 371 aa  95.9  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  26.6 
 
 		 386 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  26.36 
 
 		 396 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  29.28 
 
 		 322 aa  94  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  26.15 
 
 		 377 aa  94  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  30.96 
 
 		 338 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  29.38 
 
 		 330 aa  93.6  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  26.15 
 
 		 352 aa  92.8  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  32.97 
 
 		 317 aa  92.8  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  28.07 
 
 		 338 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  28.07 
 
 		 338 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  25.99 
 
 		 317 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  25.87 
 
 		 351 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0927  ribonuclease BN  27.95 
 
 		 297 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  25.35 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2212  ribonuclease BN, putative  30.04 
 
 		 307 aa  90.1  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.601428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  27.03 
 
 		 359 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3115  ribonuclease BN  26.69 
 
 		 321 aa  89.4  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  27.32 
 
 		 445 aa  89.4  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4741  ribonuclease BN  25.35 
 
 		 359 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  25 
 
 		 401 aa  89  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  26.79 
 
 		 322 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  25.74 
 
 		 356 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0847  ribonuclease BN, putative  27.37 
 
 		 306 aa  85.9  8e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  27.27 
 
 		 313 aa  85.9  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>