242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4670 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4670  ribonuclease BN, putative  100 
 
 
296 aa  595  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  32.13 
 
 
356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  30.03 
 
 
328 aa  109  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  30.48 
 
 
341 aa  105  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  29.29 
 
 
352 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  29.12 
 
 
351 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  27.24 
 
 
291 aa  99.8  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  30.08 
 
 
276 aa  99.4  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  26.58 
 
 
397 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  26.58 
 
 
397 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  29.53 
 
 
317 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  27.27 
 
 
299 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  28.09 
 
 
386 aa  95.9  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  26.25 
 
 
396 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  32.02 
 
 
321 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3115  ribonuclease BN  26.04 
 
 
321 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985292  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  26.89 
 
 
299 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  30.05 
 
 
323 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  25.94 
 
 
316 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  31.22 
 
 
289 aa  90.9  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  26.44 
 
 
330 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  23.26 
 
 
283 aa  90.5  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  25.45 
 
 
392 aa  89.7  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1844  ribonuclease BN  27.24 
 
 
330 aa  89.4  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00339541 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  27.21 
 
 
367 aa  89  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  27.24 
 
 
384 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  24.58 
 
 
349 aa  88.6  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  22.48 
 
 
283 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  30.51 
 
 
319 aa  87  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  26.95 
 
 
334 aa  86.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  25.75 
 
 
371 aa  85.9  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3495  ribonuclease BN  28.79 
 
 
342 aa  85.5  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.385493 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  24.91 
 
 
277 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1616  ribonuclease BN  27.11 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119172  normal  0.116701 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  25.24 
 
 
328 aa  82.8  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  30.51 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  27.24 
 
 
328 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  27.55 
 
 
360 aa  82  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  24.91 
 
 
386 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  25.91 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  24.25 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1249  ribonuclease BN  28.98 
 
 
360 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00563624  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  28.57 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  28.57 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  24.57 
 
 
374 aa  80.1  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  23.22 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  28.57 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  25.8 
 
 
289 aa  79  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  23.68 
 
 
377 aa  79.3  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1360  ribonuclease BN  27.48 
 
 
406 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116545  normal  0.0156446 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  27.69 
 
 
322 aa  78.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5015  ribonuclease BN  25 
 
 
310 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778134  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  26.97 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  25.8 
 
 
289 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  25.8 
 
 
289 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  25.8 
 
 
289 aa  77  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  25.8 
 
 
289 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  23.95 
 
 
414 aa  77  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  25.8 
 
 
289 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  25.8 
 
 
289 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  28.73 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  24.41 
 
 
386 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  30.05 
 
 
322 aa  76.6  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  28.73 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  28.73 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  28.33 
 
 
317 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  25.29 
 
 
289 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  25.72 
 
 
363 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  24.73 
 
 
288 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  24.73 
 
 
288 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  26.12 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  25.93 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  29.88 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  24.62 
 
 
386 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  24.16 
 
 
401 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  24.73 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  24.17 
 
 
367 aa  73.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0504  ribonuclease BN  25 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0979638  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  26.62 
 
 
316 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  26.89 
 
 
316 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  23.95 
 
 
322 aa  72.8  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  28.22 
 
 
338 aa  72.4  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  23.46 
 
 
375 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  27.14 
 
 
347 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  27.14 
 
 
347 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  35.92 
 
 
377 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0529  YihY family protein  24.21 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  25.38 
 
 
388 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  25.38 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1074  hypothetical protein  23.6 
 
 
313 aa  70.5  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177301  normal  0.340121 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  26.02 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  23.55 
 
 
359 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  27.72 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  27.72 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1789  ribonuclease BN  29.31 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00331025  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2354  ribonuclease BN  25 
 
 
327 aa  68.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2813  ribonuclease BN  28.52 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.934919 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  27.27 
 
 
445 aa  67.4  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  34.35 
 
 
365 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  23.86 
 
 
420 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>