155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2813 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2813  ribonuclease BN  100 
 
 		 336 aa  647    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.934919 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1887  hypothetical protein  60.75 
 
 		 433 aa  325  7e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.321613  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1789  ribonuclease BN  50.92 
 
 		 300 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00331025  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6692  membrane protein-like protein  48.9 
 
 		 324 aa  209  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.291028 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2354  ribonuclease BN  41.2 
 
 		 327 aa  208  9e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1249  ribonuclease BN  43.43 
 
 		 360 aa  195  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00563624  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3495  ribonuclease BN  43.43 
 
 		 342 aa  190  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.385493 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3072  ribonuclease BN  42.86 
 
 		 361 aa  162  7e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3555  ribonuclease BN  35.83 
 
 		 354 aa  161  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.862191  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1751  ribonuclease BN  42.96 
 
 		 355 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1038  ribonuclease BN  40.49 
 
 		 355 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1501  ribonuclease BN  37.68 
 
 		 431 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.639318  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24410  predicted membrane protein  36.42 
 
 		 402 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3945  ribonuclease BN  36.33 
 
 		 323 aa  136  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2454  ribonuclease BN  36.46 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458983 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3775  ribonuclease BN  32.67 
 
 		 356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00242423  normal  0.45335 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2180  ribonuclease BN  33.9 
 
 		 321 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2226  ribonuclease BN  33.9 
 
 		 321 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2169  ribonuclease BN  33.9 
 
 		 321 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000149157  hitchhiker  0.00191818 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0518  ribonuclease BN  33.21 
 
 		 298 aa  125  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1838  ribonuclease BN  36.43 
 
 		 404 aa  125  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0195892  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12721  hypothetical protein  34.18 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.662031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19220  predicted membrane protein  33.12 
 
 		 463 aa  122  8e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.234203  normal  0.518782 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2241  ribonuclease BN  34.72 
 
 		 426 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  33.57 
 
 		 313 aa  95.9  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  23.84 
 
 		 392 aa  90.1  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  28.77 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  27.76 
 
 		 386 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  30.66 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  29.89 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  25.9 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  30.36 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  31.55 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  25.16 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  30.04 
 
 		 375 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  30.43 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  27.46 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  29.87 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  25.08 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  26.71 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  26.77 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  28.32 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18670  YihY family protein  30.66 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0358035  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  24.75 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  28.83 
 
 		 367 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  26.28 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  27.54 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  24.51 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  27.72 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  27.05 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  26.71 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  27.63 
 
 		 388 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  24.24 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  27.36 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  27.63 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  27.09 
 
 		 351 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  24.61 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  27.49 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  26.01 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  26.01 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1381  putative ribonuclease BN  25.48 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.528846  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  28.53 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  25.77 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  28.52 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  25.24 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  25.94 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  27.43 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  27.18 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  28.78 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  26.86 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4670  ribonuclease BN, putative  27.84 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  27.31 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  26.01 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  24.66 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  24.66 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3558  ribonuclease BN, putative  27.36 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  25 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  25 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  26.9 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  22.1 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  25.65 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  21.15 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  25.26 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  25.26 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  25.26 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  25.26 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  25.26 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  25.46 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  25.26 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  25.34 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  27.74 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  27.74 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  28.47 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  25.34 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2212  ribonuclease BN, putative  25.55 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.601428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  25.34 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  27.53 
 
 		 381 aa  62.8  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  26.24 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  28.48 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  28.48 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>