146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1887 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1887  hypothetical protein  100 
 
 		 433 aa  850    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.321613  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2813  ribonuclease BN  60.75 
 
 		 336 aa  350  2e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.934919 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1789  ribonuclease BN  49.82 
 
 		 300 aa  237  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00331025  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2354  ribonuclease BN  41.2 
 
 		 327 aa  218  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6692  membrane protein-like protein  45.96 
 
 		 324 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.291028 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1249  ribonuclease BN  43.62 
 
 		 360 aa  205  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00563624  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1751  ribonuclease BN  41.04 
 
 		 355 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3495  ribonuclease BN  42.07 
 
 		 342 aa  176  7e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.385493 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3072  ribonuclease BN  42.07 
 
 		 361 aa  167  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3555  ribonuclease BN  37.23 
 
 		 354 aa  147  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.862191  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1501  ribonuclease BN  34.26 
 
 		 431 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.639318  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24410  predicted membrane protein  32.2 
 
 		 402 aa  144  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1038  ribonuclease BN  38.06 
 
 		 355 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3945  ribonuclease BN  32.76 
 
 		 323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2180  ribonuclease BN  32.76 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2226  ribonuclease BN  32.76 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2169  ribonuclease BN  32.76 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000149157  hitchhiker  0.00191818 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2454  ribonuclease BN  33.58 
 
 		 344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458983 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1838  ribonuclease BN  32.85 
 
 		 404 aa  120  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0195892  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2241  ribonuclease BN  32.31 
 
 		 426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12721  hypothetical protein  32.97 
 
 		 324 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.662031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0518  ribonuclease BN  30.94 
 
 		 298 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19220  predicted membrane protein  28.96 
 
 		 463 aa  109  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.234203  normal  0.518782 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3775  ribonuclease BN  29.18 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00242423  normal  0.45335 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  24.76 
 
 		 392 aa  87  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  30.3 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  34.62 
 
 		 313 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  32.95 
 
 		 322 aa  79.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  28.57 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  30.68 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  35.87 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  28.78 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  28.35 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  32.32 
 
 		 367 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  29.78 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  30.15 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  26.82 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  27.5 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  25.99 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  26.53 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  29.62 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  25.93 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  23.82 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  26.76 
 
 		 396 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  23.4 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  28.38 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  30.45 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  28.08 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  26.86 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  27.96 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  27.96 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  26.16 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  27.99 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  24.55 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  25.91 
 
 		 386 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  28.73 
 
 		 347 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  25.6 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  29.55 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  27.55 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  22.99 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  27.93 
 
 		 386 aa  67  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  28.08 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  26.12 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  28.26 
 
 		 318 aa  65.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  29.09 
 
 		 350 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  29.09 
 
 		 350 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  29.09 
 
 		 350 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  29.17 
 
 		 388 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3558  ribonuclease BN, putative  31.32 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  27.15 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  25.6 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  28.41 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  28.41 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  24.12 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2212  ribonuclease BN, putative  28.16 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.601428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  27.18 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  25.22 
 
 		 445 aa  63.9  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  29.52 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  26.17 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  26.17 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  26.17 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  26.17 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  26.17 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  26.17 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  23.44 
 
 		 277 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  27.72 
 
 		 363 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  24.03 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2494  ribonuclease BN  28.83 
 
 		 332 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12214  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  27.32 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  27.38 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  22.81 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  25.84 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  25.84 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  30.05 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  23.91 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  25.37 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  23.91 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  23.84 
 
 		 291 aa  59.3  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  23.91 
 
 		 318 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  27.11 
 
 		 330 aa  59.3  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>