164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3945 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3945  ribonuclease BN  100 
 
 		 323 aa  648    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2454  ribonuclease BN  86.38 
 
 		 344 aa  511  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2180  ribonuclease BN  76.32 
 
 		 321 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2226  ribonuclease BN  76.32 
 
 		 321 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2169  ribonuclease BN  76.32 
 
 		 321 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000149157  hitchhiker  0.00191818 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12721  hypothetical protein  72.79 
 
 		 324 aa  376  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.662031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1501  ribonuclease BN  50.67 
 
 		 431 aa  249  5e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.639318  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1838  ribonuclease BN  52.46 
 
 		 404 aa  240  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0195892  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24410  predicted membrane protein  49.16 
 
 		 402 aa  238  9e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1038  ribonuclease BN  51.03 
 
 		 355 aa  237  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2241  ribonuclease BN  47.08 
 
 		 426 aa  223  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3775  ribonuclease BN  44 
 
 		 356 aa  216  5e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00242423  normal  0.45335 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0518  ribonuclease BN  46.4 
 
 		 298 aa  203  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3555  ribonuclease BN  42.18 
 
 		 354 aa  203  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.862191  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1249  ribonuclease BN  37.08 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00563624  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3495  ribonuclease BN  38.97 
 
 		 342 aa  161  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.385493 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2354  ribonuclease BN  35.98 
 
 		 327 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2813  ribonuclease BN  36.33 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.934919 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1789  ribonuclease BN  30.85 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00331025  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6692  membrane protein-like protein  33.46 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.291028 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1887  hypothetical protein  33.11 
 
 		 433 aa  129  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.321613  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3072  ribonuclease BN  31.82 
 
 		 361 aa  116  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1751  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  25.27 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  24.91 
 
 		 341 aa  82.8  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  25.44 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  24.65 
 
 		 317 aa  75.9  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  26.51 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  23.89 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  28.44 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1381  putative ribonuclease BN  26.39 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.528846  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  23.78 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  29.41 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  25.7 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  29.12 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  25.17 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  26.58 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  24.74 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  23.45 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  24 
 
 		 322 aa  67  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  26.24 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  27.85 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  22.38 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  26.32 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  22.26 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  25.34 
 
 		 322 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  22.26 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  19.7 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  25.4 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  23.47 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  24.2 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  23.47 
 
 		 397 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  28.77 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5015  ribonuclease BN  28.57 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  22.26 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  24.42 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  26.24 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  28.77 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  28.77 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  19.63 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  24.14 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  27.24 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1252  ribonuclease BN  20.54 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  22.97 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  25.16 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1074  hypothetical protein  23.7 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177301  normal  0.340121 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  21.55 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  21.55 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  21.55 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  21.55 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  21.55 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  26.07 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  21.55 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  24.25 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  23.51 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  22.84 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  27.12 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3115  ribonuclease BN  24.38 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2494  ribonuclease BN  25.27 
 
 		 332 aa  57  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12214  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  28.63 
 
 		 359 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  26.69 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  24.92 
 
 		 349 aa  57  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  20.49 
 
 		 289 aa  57  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  23.28 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  26.5 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  24.84 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1180  ribonuclease BN, putative  25.53 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.012264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  26.13 
 
 		 371 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1616  ribonuclease BN  21.11 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119172  normal  0.116701 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4573  ribonuclease BN  26.91 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101037  hitchhiker  0.00311377 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  25.14 
 
 		 360 aa  54.3  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  28.5 
 
 		 289 aa  54.3  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  23.38 
 
 		 316 aa  53.5  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4768  ribonuclease BN  25.55 
 
 		 307 aa  53.1  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211591  normal  0.0891393 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  25.91 
 
 		 388 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0750  ribonuclease BN  23.33 
 
 		 297 aa  52.8  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  22.94 
 
 		 299 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  23.18 
 
 		 328 aa  52  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  23.37 
 
 		 291 aa  52  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  36.46 
 
 		 381 aa  52  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>