148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3072 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3072  ribonuclease BN  100 
 
 		 361 aa  689    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2354  ribonuclease BN  49.65 
 
 		 327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1789  ribonuclease BN  48.12 
 
 		 300 aa  225  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00331025  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6692  membrane protein-like protein  46.83 
 
 		 324 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.291028 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1249  ribonuclease BN  41.64 
 
 		 360 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00563624  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1751  ribonuclease BN  44.22 
 
 		 355 aa  192  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2813  ribonuclease BN  42.56 
 
 		 336 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.934919 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3495  ribonuclease BN  40.15 
 
 		 342 aa  176  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.385493 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1887  hypothetical protein  42.07 
 
 		 433 aa  169  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.321613  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3555  ribonuclease BN  35.47 
 
 		 354 aa  158  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.862191  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1501  ribonuclease BN  35.51 
 
 		 431 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.639318  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24410  predicted membrane protein  35.38 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3775  ribonuclease BN  31.46 
 
 		 356 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00242423  normal  0.45335 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1838  ribonuclease BN  34.39 
 
 		 404 aa  122  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0195892  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0518  ribonuclease BN  32.18 
 
 		 298 aa  122  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1038  ribonuclease BN  35.27 
 
 		 355 aa  119  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2241  ribonuclease BN  31.78 
 
 		 426 aa  115  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3945  ribonuclease BN  31.93 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2180  ribonuclease BN  32.01 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2226  ribonuclease BN  32.01 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2169  ribonuclease BN  32.01 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000149157  hitchhiker  0.00191818 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12721  hypothetical protein  31.76 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.662031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2454  ribonuclease BN  30.99 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458983 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19220  predicted membrane protein  28.38 
 
 		 463 aa  90.9  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.234203  normal  0.518782 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  28.76 
 
 		 313 aa  86.7  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  25.66 
 
 		 386 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  25.36 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  25.73 
 
 		 351 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  25.14 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  28.61 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  25.35 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  26.27 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  26.04 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  26.05 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  25 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  26.74 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  26.17 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  25.23 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  28.33 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  26.24 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  26.28 
 
 		 386 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  26.55 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  25.63 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  25.58 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  26.73 
 
 		 328 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  26.9 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  25.22 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  26.47 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  25.38 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3558  ribonuclease BN, putative  27.78 
 
 		 325 aa  62.4  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  23.78 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  26.04 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1457  ribonuclease BN  26.94 
 
 		 484 aa  60.5  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  21.92 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  29.65 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  22.95 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  25.88 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  25.19 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  26.28 
 
 		 351 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  28.18 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  24.08 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  23.24 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  24.91 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  23.77 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  24.68 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  24.91 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  25 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  25.56 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  27.52 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  28.62 
 
 		 445 aa  57  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  24.81 
 
 		 388 aa  57  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1994  ribonuclease BN  35.85 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4670  ribonuclease BN, putative  24.29 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  28.04 
 
 		 317 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  29.59 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  24.63 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  29.59 
 
 		 318 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0504  ribonuclease BN  23.99 
 
 		 279 aa  55.8  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0979638  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0656  ribonuclease BN  26.49 
 
 		 355 aa  55.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.173698 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  30.36 
 
 		 317 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  29.59 
 
 		 318 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  38.68 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  28.88 
 
 		 277 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3115  ribonuclease BN  24.21 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0529  YihY family protein  22.97 
 
 		 274 aa  55.1  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 365 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  27.08 
 
 		 316 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  27.37 
 
 		 328 aa  54.7  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  24.9 
 
 		 289 aa  54.3  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  25.42 
 
 		 347 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  25.42 
 
 		 347 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  24.19 
 
 		 363 aa  53.1  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  24.38 
 
 		 318 aa  53.1  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  30.21 
 
 		 283 aa  53.5  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  24.72 
 
 		 286 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1381  putative ribonuclease BN  23.08 
 
 		 296 aa  52.8  0.000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.528846  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  23.68 
 
 		 330 aa  52.8  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  26.09 
 
 		 333 aa  52  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  26.92 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  31.88 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>