124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1501 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1501  ribonuclease BN  100 
 
 		 431 aa  847    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.639318  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24410  predicted membrane protein  64.34 
 
 		 402 aa  391  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3945  ribonuclease BN  50 
 
 		 323 aa  251  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1038  ribonuclease BN  52.15 
 
 		 355 aa  251  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2454  ribonuclease BN  51.69 
 
 		 344 aa  249  5e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2180  ribonuclease BN  51.23 
 
 		 321 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2226  ribonuclease BN  51.23 
 
 		 321 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2169  ribonuclease BN  51.23 
 
 		 321 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000149157  hitchhiker  0.00191818 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1838  ribonuclease BN  51.23 
 
 		 404 aa  246  6e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0195892  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3775  ribonuclease BN  46.74 
 
 		 356 aa  244  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00242423  normal  0.45335 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3555  ribonuclease BN  47.23 
 
 		 354 aa  241  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.862191  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12721  hypothetical protein  50.34 
 
 		 324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.662031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2241  ribonuclease BN  50 
 
 		 426 aa  231  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0518  ribonuclease BN  48.75 
 
 		 298 aa  226  6e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1249  ribonuclease BN  41.03 
 
 		 360 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00563624  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3495  ribonuclease BN  40.29 
 
 		 342 aa  195  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.385493 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2354  ribonuclease BN  34.97 
 
 		 327 aa  182  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1789  ribonuclease BN  35.89 
 
 		 300 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00331025  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2813  ribonuclease BN  36.01 
 
 		 336 aa  156  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.934919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6692  membrane protein-like protein  34.55 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.291028 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1887  hypothetical protein  34.13 
 
 		 433 aa  145  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.321613  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3072  ribonuclease BN  34.77 
 
 		 361 aa  140  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1751  ribonuclease BN  35.07 
 
 		 355 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  25.18 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  30.35 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  26.7 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  26.7 
 
 		 323 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  27.48 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  26.54 
 
 		 321 aa  69.7  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  21.18 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  25.44 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  22.18 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  25.96 
 
 		 330 aa  67  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  27.08 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  25.44 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  28.16 
 
 		 318 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  28.16 
 
 		 319 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  23.61 
 
 		 331 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  28.16 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  26.74 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  25.73 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  23.44 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  24.71 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  24.83 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  25.18 
 
 		 328 aa  62.8  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  24.75 
 
 		 373 aa  63.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  25.25 
 
 		 324 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  22.01 
 
 		 351 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  26.87 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  23.96 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  27.12 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  27.86 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  23.61 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  23.24 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  24.7 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  26.51 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  23.4 
 
 		 341 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  21.15 
 
 		 283 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  23.48 
 
 		 367 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19220  predicted membrane protein  23.21 
 
 		 463 aa  59.7  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.234203  normal  0.518782 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  25.17 
 
 		 374 aa  59.7  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  21.82 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  21.82 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  24.37 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  21.94 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4670  ribonuclease BN, putative  37.18 
 
 		 296 aa  57  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  24.86 
 
 		 322 aa  57  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  20.28 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0656  ribonuclease BN  24.32 
 
 		 355 aa  56.2  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.173698 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  22.65 
 
 		 330 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  24.44 
 
 		 328 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  26.09 
 
 		 445 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  24.58 
 
 		 349 aa  56.2  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  22.68 
 
 		 402 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  30.43 
 
 		 317 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  22.91 
 
 		 322 aa  54.7  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  23.41 
 
 		 352 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  23.57 
 
 		 388 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  23.91 
 
 		 351 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  23.19 
 
 		 388 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2494  ribonuclease BN  24.11 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12214  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  28.18 
 
 		 331 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08810  predicted membrane protein  29.29 
 
 		 417 aa  52.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0487855  normal  0.0524825 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  21.43 
 
 		 276 aa  51.6  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  25.88 
 
 		 310 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  27.5 
 
 		 350 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  34.41 
 
 		 377 aa  51.2  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  27.5 
 
 		 350 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  27.5 
 
 		 350 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  27.2 
 
 		 367 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  23.6 
 
 		 371 aa  50.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  23.19 
 
 		 386 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  31.96 
 
 		 381 aa  50.4  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1381  putative ribonuclease BN  25.81 
 
 		 296 aa  50.1  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.528846  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0050  ribonuclease BN  27.49 
 
 		 344 aa  49.3  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  28.65 
 
 		 420 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  22.07 
 
 		 386 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  23.88 
 
 		 333 aa  48.9  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  28.44 
 
 		 356 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  32.98 
 
 		 365 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0964691 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>