153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12721 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12721  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  644    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.662031  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2180  ribonuclease BN  72.94 
 
 
321 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2226  ribonuclease BN  72.94 
 
 
321 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2169  ribonuclease BN  72.94 
 
 
321 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000149157  hitchhiker  0.00191818 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2454  ribonuclease BN  71.61 
 
 
344 aa  381  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.458983 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3945  ribonuclease BN  72.79 
 
 
323 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1838  ribonuclease BN  53.82 
 
 
404 aa  240  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0195892  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1501  ribonuclease BN  50.87 
 
 
431 aa  236  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.639318  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24410  predicted membrane protein  52.36 
 
 
402 aa  232  7.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2241  ribonuclease BN  51.2 
 
 
426 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1038  ribonuclease BN  47.9 
 
 
355 aa  219  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3555  ribonuclease BN  43.37 
 
 
354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.862191  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3775  ribonuclease BN  41.95 
 
 
356 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00242423  normal  0.45335 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0518  ribonuclease BN  43.82 
 
 
298 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1249  ribonuclease BN  36.03 
 
 
360 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00563624  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3495  ribonuclease BN  38.1 
 
 
342 aa  159  9e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.385493 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2354  ribonuclease BN  32.51 
 
 
327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2813  ribonuclease BN  34.18 
 
 
336 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.934919 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1789  ribonuclease BN  30.18 
 
 
300 aa  136  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00331025  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6692  membrane protein-like protein  32.63 
 
 
324 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.291028 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1887  hypothetical protein  33.09 
 
 
433 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.321613  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3072  ribonuclease BN  31.62 
 
 
361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1751  ribonuclease BN  30.99 
 
 
355 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.807347  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  26.01 
 
 
316 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  30.69 
 
 
323 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  29.36 
 
 
321 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  27.24 
 
 
331 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  28.92 
 
 
414 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  26.06 
 
 
374 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  26.72 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  23.15 
 
 
341 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  27.54 
 
 
328 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  28.64 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  28.64 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  28.64 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  25.29 
 
 
392 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  24.11 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  25 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  27.14 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  26.13 
 
 
349 aa  65.9  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  24.91 
 
 
351 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  23.81 
 
 
320 aa  64.3  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  25.35 
 
 
322 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  25.71 
 
 
328 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  23.81 
 
 
347 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  28.72 
 
 
289 aa  65.1  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  19.87 
 
 
288 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  24.05 
 
 
276 aa  64.3  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  21 
 
 
286 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  19.87 
 
 
288 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  23.86 
 
 
356 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  23.9 
 
 
299 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  23.9 
 
 
299 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  19.87 
 
 
289 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  19.87 
 
 
289 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  19.87 
 
 
289 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  19.87 
 
 
289 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  19.87 
 
 
289 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  21.69 
 
 
283 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  25.43 
 
 
377 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  26.79 
 
 
377 aa  62.4  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  26.52 
 
 
401 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  24.73 
 
 
317 aa  62.4  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  20.53 
 
 
289 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  19.87 
 
 
289 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3115  ribonuclease BN  23.18 
 
 
321 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985292  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  26.42 
 
 
322 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  25.09 
 
 
402 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  25.99 
 
 
322 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  23.32 
 
 
334 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  25.91 
 
 
313 aa  60.8  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  22.79 
 
 
283 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  26.13 
 
 
388 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19220  predicted membrane protein  24.36 
 
 
463 aa  59.7  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.234203  normal  0.518782 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  25.51 
 
 
301 aa  59.3  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  26.7 
 
 
352 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  20.07 
 
 
289 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  23.47 
 
 
317 aa  58.9  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  27.11 
 
 
333 aa  58.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  25.7 
 
 
367 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  25.78 
 
 
388 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  22.42 
 
 
291 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  23.79 
 
 
348 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  24.2 
 
 
310 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  26.69 
 
 
328 aa  57.4  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1381  putative ribonuclease BN  28.9 
 
 
296 aa  57.8  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.528846  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  25.63 
 
 
330 aa  57.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  24.83 
 
 
365 aa  57  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1074  hypothetical protein  22.51 
 
 
313 aa  57  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177301  normal  0.340121 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  29.69 
 
 
371 aa  56.2  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  27.08 
 
 
350 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  27.08 
 
 
350 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  27.08 
 
 
350 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4768  ribonuclease BN  25.08 
 
 
307 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211591  normal  0.0891393 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  25.48 
 
 
351 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  24.84 
 
 
386 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  25 
 
 
367 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  21.21 
 
 
363 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3487  putative ribonuclease BN  22.69 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  26.92 
 
 
381 aa  55.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>