224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1249 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1249  ribonuclease BN  100 
 
 		 360 aa  689    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00563624  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3495  ribonuclease BN  79.71 
 
 		 342 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.385493 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2354  ribonuclease BN  45.32 
 
 		 327 aa  232  6e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1789  ribonuclease BN  46.15 
 
 		 300 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00331025  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3555  ribonuclease BN  45.58 
 
 		 354 aa  211  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.862191  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6692  membrane protein-like protein  43.58 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.291028 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3775  ribonuclease BN  38.74 
 
 		 356 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00242423  normal  0.45335 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2241  ribonuclease BN  44.44 
 
 		 426 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1501  ribonuclease BN  40.94 
 
 		 431 aa  189  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.639318  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2813  ribonuclease BN  43.1 
 
 		 336 aa  185  9e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.934919 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24410  predicted membrane protein  40.73 
 
 		 402 aa  180  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1038  ribonuclease BN  42.91 
 
 		 355 aa  177  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1887  hypothetical protein  43.62 
 
 		 433 aa  176  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.321613  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0518  ribonuclease BN  38.49 
 
 		 298 aa  175  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1838  ribonuclease BN  39.13 
 
 		 404 aa  175  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0195892  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1751  ribonuclease BN  44.71 
 
 		 355 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3072  ribonuclease BN  41.54 
 
 		 361 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3945  ribonuclease BN  37.04 
 
 		 323 aa  153  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2180  ribonuclease BN  35.71 
 
 		 321 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2226  ribonuclease BN  35.71 
 
 		 321 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2169  ribonuclease BN  35.71 
 
 		 321 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000149157  hitchhiker  0.00191818 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2454  ribonuclease BN  35.69 
 
 		 344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458983 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12721  hypothetical protein  35.49 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.662031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  28.57 
 
 		 351 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  28.52 
 
 		 386 aa  100  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19220  predicted membrane protein  28.37 
 
 		 463 aa  98.2  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.234203  normal  0.518782 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  28.52 
 
 		 341 aa  95.9  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  29.65 
 
 		 321 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  31.45 
 
 		 320 aa  95.1  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  27.5 
 
 		 318 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  30.28 
 
 		 323 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  27.5 
 
 		 318 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  27.3 
 
 		 316 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  30.33 
 
 		 321 aa  92.8  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  27.36 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  27.7 
 
 		 396 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  27.36 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  27.08 
 
 		 319 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  29.17 
 
 		 356 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  29.2 
 
 		 352 aa  89.4  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  26.52 
 
 		 283 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  26.14 
 
 		 283 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  27.78 
 
 		 322 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  26.81 
 
 		 392 aa  87.4  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  27.15 
 
 		 317 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  30.88 
 
 		 328 aa  87  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  27.76 
 
 		 384 aa  87  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  28.16 
 
 		 386 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  26.37 
 
 		 299 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  28.62 
 
 		 386 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  28.11 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  29.81 
 
 		 289 aa  85.9  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  26.37 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  32.32 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  29.75 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  29.89 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  28.4 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  26.88 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0529  YihY family protein  27.51 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  28.16 
 
 		 347 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  26.98 
 
 		 328 aa  82.8  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  29.01 
 
 		 386 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  26.67 
 
 		 291 aa  82.4  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  29.48 
 
 		 331 aa  82.4  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4670  ribonuclease BN, putative  29.35 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  29.39 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  28.62 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  30.43 
 
 		 363 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0504  ribonuclease BN  24.36 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0979638  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  27.48 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  30.15 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2494  ribonuclease BN  29 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12214  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  28.83 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  27.82 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  27.68 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  28.2 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  27.82 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  27.82 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  29.25 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1381  putative ribonuclease BN  27.19 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.528846  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  27.83 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  25.57 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  25.67 
 
 		 276 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  26.87 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  26.87 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  26.87 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  26.87 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  26.87 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  26.87 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  27.07 
 
 		 322 aa  75.1  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  28.18 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3558  ribonuclease BN, putative  27.98 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  24.54 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  26.79 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  26.79 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5235  ribonuclease BN  27.53 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.192166  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  30.48 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  27.21 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0750  ribonuclease BN  26.86 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3115  ribonuclease BN  26.69 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985292  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>