194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0750 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0750  ribonuclease BN  100 
 
 
297 aa  586  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3484  ribonuclease BN  90.91 
 
 
297 aa  538  9.999999999999999e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4883  ribonuclease BN  81.36 
 
 
297 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178095  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1137  ribonuclease BN-like family transmembrane protein  78.45 
 
 
301 aa  472  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0816  ribonuclease BN  80.13 
 
 
297 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.941783  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0927  ribonuclease BN  80.68 
 
 
297 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5235  ribonuclease BN  77.63 
 
 
297 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.192166  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0308  putative ribonuclease BN  58.09 
 
 
300 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.686269  normal  0.0663425 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3250  ribonuclease BN  51.6 
 
 
302 aa  271  8.000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0280  ribonuclease BN  53.93 
 
 
288 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4509  ribonuclease BN  50.55 
 
 
293 aa  258  7e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581699  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4573  ribonuclease BN  48.62 
 
 
293 aa  256  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101037  hitchhiker  0.00311377 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3028  putative ribonuclease BN  48.93 
 
 
283 aa  243  3e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2377  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1004  putative ribonuclease BN  47.84 
 
 
288 aa  237  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1978  ribonuclease BN, putative  47.12 
 
 
286 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1903  YihY family protein  47.12 
 
 
286 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2527  putative ribonuclease BN  43.96 
 
 
290 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.322273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4347  ribonuclease BN  50 
 
 
295 aa  229  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2188  ribonuclease BN  48.06 
 
 
317 aa  228  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.811945  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2506  ribonuclease BN  48.58 
 
 
315 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000575853  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2230  ribonuclease BN  48.58 
 
 
315 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.956243  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3849  ribonuclease BN  43.97 
 
 
307 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3556  ribonuclease BN  44.33 
 
 
307 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176466  normal  0.953277 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0051  YihY family protein  41.16 
 
 
285 aa  206  3e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4005  ribonuclease transmembrane protein  43.26 
 
 
298 aa  206  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1180  ribonuclease BN, putative  34.89 
 
 
288 aa  126  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.012264  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  33.92 
 
 
316 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  32.17 
 
 
392 aa  112  6e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  33.1 
 
 
299 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  33.1 
 
 
299 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  29.52 
 
 
289 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  27.17 
 
 
276 aa  105  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  27.76 
 
 
283 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  29.2 
 
 
288 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  29.2 
 
 
288 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  27.76 
 
 
283 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  28.41 
 
 
289 aa  102  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  28.04 
 
 
289 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  28.04 
 
 
289 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  28.04 
 
 
289 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  28.04 
 
 
289 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  28.04 
 
 
289 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  28.04 
 
 
289 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  26.74 
 
 
286 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  32.88 
 
 
321 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  32.47 
 
 
323 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  29.77 
 
 
328 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  30.71 
 
 
289 aa  91.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0529  YihY family protein  27.17 
 
 
274 aa  91.3  2e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0504  ribonuclease BN  25.87 
 
 
279 aa  89.7  6e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0979638  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1292  ribonuclease BN family protein  26.95 
 
 
271 aa  87.4  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  34.62 
 
 
319 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  34.62 
 
 
318 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  34.62 
 
 
318 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  26.71 
 
 
377 aa  85.5  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  26.97 
 
 
277 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  25.88 
 
 
341 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  33.49 
 
 
317 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  27.7 
 
 
349 aa  79.7  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  25.68 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  29.93 
 
 
401 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1844  ribonuclease BN  25 
 
 
330 aa  78.2  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00339541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  30.39 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  30.39 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  30.39 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0656  ribonuclease BN  28.96 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.173698 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  25.85 
 
 
316 aa  77  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  27.96 
 
 
363 aa  76.3  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3487  putative ribonuclease BN  22.9 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  27.3 
 
 
402 aa  73.6  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  27.15 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5015  ribonuclease BN  26.32 
 
 
310 aa  72.4  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778134  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0050  ribonuclease BN  29.24 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  25 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4768  ribonuclease BN  28.08 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211591  normal  0.0891393 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  29.01 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  26.09 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  25.57 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  26.46 
 
 
359 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1616  ribonuclease BN  26.4 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119172  normal  0.116701 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5922  ribonuclease BN  23.39 
 
 
323 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  0.574915 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  29.56 
 
 
445 aa  67.4  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1937  putative ribonuclease BN  30 
 
 
405 aa  67.4  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.666523  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1971  putative ribonuclease BN  30 
 
 
405 aa  67.4  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.493707  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0395  YihY family protein  22.34 
 
 
279 aa  67  0.0000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1249  ribonuclease BN  27.2 
 
 
360 aa  66.2  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00563624  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  24.81 
 
 
320 aa  65.1  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  25.89 
 
 
328 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  27.21 
 
 
347 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  24.9 
 
 
356 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08426  Ribonuclease BN  24.8 
 
 
307 aa  63.9  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.724596  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3115  ribonuclease BN  24.81 
 
 
321 aa  63.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985292  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3495  ribonuclease BN  29.33 
 
 
342 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.385493 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  24.41 
 
 
351 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  25.77 
 
 
319 aa  63.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  30.25 
 
 
333 aa  63.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  29.34 
 
 
371 aa  63.2  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  26.27 
 
 
360 aa  63.2  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  26.82 
 
 
283 aa  63.2  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  23.75 
 
 
317 aa  62.4  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>