More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3922 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  100 
 
 
370 aa  734    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  42.76 
 
 
306 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  43.45 
 
 
291 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  39.13 
 
 
347 aa  215  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  37.86 
 
 
307 aa  210  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  35.41 
 
 
317 aa  209  7e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  39.5 
 
 
360 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  38.78 
 
 
305 aa  204  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  34.97 
 
 
424 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  38.98 
 
 
299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  37.63 
 
 
321 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  41.55 
 
 
300 aa  195  9e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  36.07 
 
 
324 aa  189  8e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  36.72 
 
 
304 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  35.39 
 
 
322 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  37.22 
 
 
316 aa  180  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  35.56 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  37.29 
 
 
427 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  36.81 
 
 
298 aa  166  6.9999999999999995e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  38.81 
 
 
299 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  40.14 
 
 
326 aa  165  9e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  36.27 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  36.82 
 
 
299 aa  162  6e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  33.54 
 
 
393 aa  160  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  33.57 
 
 
321 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  34.32 
 
 
311 aa  154  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  36.7 
 
 
306 aa  153  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  38.6 
 
 
321 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  32.82 
 
 
341 aa  149  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  33.21 
 
 
443 aa  146  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  36.17 
 
 
329 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  36.17 
 
 
329 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  34.53 
 
 
324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  31.8 
 
 
311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  31.8 
 
 
308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  31.8 
 
 
314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  31.8 
 
 
314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  31.29 
 
 
436 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  33.72 
 
 
325 aa  139  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  30.22 
 
 
310 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  33.46 
 
 
337 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  30.07 
 
 
310 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  33.46 
 
 
307 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  33.46 
 
 
307 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  33.46 
 
 
307 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  33.46 
 
 
307 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  33.46 
 
 
304 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  32.76 
 
 
312 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  35.66 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  38.57 
 
 
303 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  33.86 
 
 
411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  29.89 
 
 
324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  28.62 
 
 
311 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  30 
 
 
302 aa  123  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  31.27 
 
 
305 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  32.34 
 
 
292 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  31.7 
 
 
305 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  32.34 
 
 
292 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  33.1 
 
 
314 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  30.03 
 
 
320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  28.21 
 
 
276 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  31.5 
 
 
294 aa  107  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4026  ribonuclease BN  28.62 
 
 
302 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.194003 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  29.33 
 
 
331 aa  97.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  29.53 
 
 
368 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  25 
 
 
306 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  29.05 
 
 
321 aa  95.1  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  31.06 
 
 
309 aa  94.4  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  25.23 
 
 
322 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  25.23 
 
 
322 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1406  ribonuclease BN  24.62 
 
 
320 aa  93.6  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.573356  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  27.8 
 
 
317 aa  89  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  30.62 
 
 
334 aa  88.2  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  26.59 
 
 
320 aa  87.8  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  26.56 
 
 
306 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  25.15 
 
 
392 aa  83.2  0.000000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  28.32 
 
 
349 aa  82.4  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  25.22 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  30.82 
 
 
411 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  26.58 
 
 
330 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  31.11 
 
 
411 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  23.18 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  28.77 
 
 
408 aa  80.1  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  28.85 
 
 
328 aa  79.3  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  27.89 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  25.61 
 
 
374 aa  79.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  27.72 
 
 
402 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  33.73 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  33.73 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  24.24 
 
 
299 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  25.72 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  25.55 
 
 
334 aa  76.3  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  27.59 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  26.02 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  23.94 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  28.67 
 
 
445 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1577  ribonuclease BN  28.01 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.274703  normal  0.013095 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  24.68 
 
 
525 aa  74.3  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  28.35 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  25.07 
 
 
317 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>