More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1291 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  100 
 
 		 311 aa  610  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  62.37 
 
 		 324 aa  346  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  64.89 
 
 		 305 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  64.93 
 
 		 305 aa  292  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  58.36 
 
 		 436 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  53.07 
 
 		 310 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  56.58 
 
 		 341 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  52.43 
 
 		 310 aa  279  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  55.16 
 
 		 325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  57.53 
 
 		 308 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  57.53 
 
 		 314 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  57.53 
 
 		 314 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  55.91 
 
 		 443 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  54.39 
 
 		 311 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  54.32 
 
 		 337 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  54.95 
 
 		 307 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  54.95 
 
 		 307 aa  266  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  54.95 
 
 		 307 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  54.95 
 
 		 304 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  54.95 
 
 		 307 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  57.14 
 
 		 411 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  40.07 
 
 		 321 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  38.71 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  37.76 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  42.31 
 
 		 329 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  42.57 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  41.41 
 
 		 427 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 307 aa  170  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  34.96 
 
 		 360 aa  169  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  33.1 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  36.88 
 
 		 299 aa  165  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  32.45 
 
 		 324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  40.23 
 
 		 329 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  40.23 
 
 		 329 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  38.73 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  30.21 
 
 		 424 aa  159  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  38.46 
 
 		 312 aa  158  9e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  31 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  31.73 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  41.6 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  32.85 
 
 		 321 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  42.07 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  31.39 
 
 		 347 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  28.52 
 
 		 305 aa  147  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  41.72 
 
 		 326 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  32.08 
 
 		 322 aa  145  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  33.69 
 
 		 298 aa  142  6e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  32.06 
 
 		 299 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  32.86 
 
 		 292 aa  139  8.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  32.86 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  37.55 
 
 		 302 aa  136  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  29.89 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  33.59 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  33.67 
 
 		 320 aa  132  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  33.94 
 
 		 301 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  29.08 
 
 		 370 aa  129  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  32.22 
 
 		 314 aa  123  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  27.69 
 
 		 299 aa  122  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  32.75 
 
 		 393 aa  120  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  34.73 
 
 		 306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  32.71 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  31.53 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  31.58 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  23.44 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  30.88 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  34.06 
 
 		 305 aa  89.7  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  34.06 
 
 		 305 aa  89  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  31.97 
 
 		 334 aa  87.4  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  25.75 
 
 		 295 aa  86.3  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  27.03 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  25.26 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  26.64 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  26.64 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  26.77 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  25.51 
 
 		 323 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  25.51 
 
 		 323 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  25.51 
 
 		 323 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  25.17 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  27.21 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  27.78 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  27.12 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  26.09 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3484  ribonuclease BN  27.49 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  24.1 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  25.65 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  25.77 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  24.15 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  25.08 
 
 		 384 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  27.69 
 
 		 386 aa  72.4  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  25.26 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  24.25 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  22.3 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  25.58 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1670  ribonuclease BN  26.25 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1422  putative ribonuclease BN transmembrane protein  26.39 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00924301 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  27.17 
 
 		 447 aa  70.5  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  23.97 
 
 		 525 aa  70.1  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  23.97 
 
 		 525 aa  69.7  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  24.3 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  22.9 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>