158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3201 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  100 
 
 		 309 aa  604  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  72.55 
 
 		 321 aa  403  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  57.57 
 
 		 331 aa  299  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  61.01 
 
 		 305 aa  268  5.9999999999999995e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  61.68 
 
 		 305 aa  268  5.9999999999999995e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  56.77 
 
 		 334 aa  267  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  39.03 
 
 		 300 aa  169  7e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  34.47 
 
 		 291 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  34.05 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  33.11 
 
 		 307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  34.07 
 
 		 321 aa  145  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  30.69 
 
 		 424 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  34.06 
 
 		 347 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  31.95 
 
 		 360 aa  142  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  30.88 
 
 		 317 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  37.28 
 
 		 294 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  31.72 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  32.74 
 
 		 312 aa  134  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  32.6 
 
 		 321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  32.71 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  31.27 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  32 
 
 		 321 aa  129  6e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  32.03 
 
 		 326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  34.59 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  31.47 
 
 		 329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  31.47 
 
 		 329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  34.56 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  31.32 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  35.37 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  34.96 
 
 		 307 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  35.43 
 
 		 308 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  34.65 
 
 		 341 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  35.43 
 
 		 314 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  35.43 
 
 		 314 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  34.73 
 
 		 311 aa  122  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  33.86 
 
 		 443 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  31.54 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  34.48 
 
 		 427 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  30.38 
 
 		 324 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  34.16 
 
 		 337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  34.55 
 
 		 307 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  34.55 
 
 		 307 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  34.55 
 
 		 307 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  28.41 
 
 		 324 aa  119  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  34.55 
 
 		 304 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  34.77 
 
 		 411 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  31.34 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  31.8 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  30.18 
 
 		 322 aa  116  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  30.83 
 
 		 370 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  29.41 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  31.25 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  30.48 
 
 		 299 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  23.94 
 
 		 306 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  27.08 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  34.45 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  32.48 
 
 		 436 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  30.74 
 
 		 301 aa  106  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  29.72 
 
 		 302 aa  100  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  32.34 
 
 		 314 aa  97.8  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  35.97 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  35.98 
 
 		 306 aa  93.6  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  33.1 
 
 		 292 aa  92.4  9e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  33.1 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  31.25 
 
 		 393 aa  90.5  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  30.45 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  22.93 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  29.17 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1406  ribonuclease BN  22.39 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.573356  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4026  ribonuclease BN  23.26 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.194003 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  27.21 
 
 		 538 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  24.13 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0363  serum resistance locus BrkB-like  24.5 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  20.36 
 
 		 307 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  21.11 
 
 		 306 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  23.15 
 
 		 338 aa  52  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  23.6 
 
 		 316 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  20.28 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  20.28 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  24.11 
 
 		 375 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  24.75 
 
 		 285 aa  50.4  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0931  putative ribonuclease BN  22.61 
 
 		 459 aa  50.4  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  21.97 
 
 		 392 aa  50.1  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  22.3 
 
 		 277 aa  49.7  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  24.91 
 
 		 341 aa  49.7  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  24.22 
 
 		 328 aa  49.7  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  25 
 
 		 525 aa  49.7  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  26.45 
 
 		 298 aa  49.7  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01081  serum resistance locus BrkB-like protein  23.42 
 
 		 313 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  24.91 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  24.62 
 
 		 525 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1606  putative ribonuclease BN  24.14 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.945482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1463  serum resistance locus BrkB-like protein  24.48 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01651  serum resistance locus BrkB-like protein  24.48 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.596268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02291  serum resistance locus BrkB-like protein  28.95 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  21.96 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4744  putative ribonuclease  23.44 
 
 		 339 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  24.42 
 
 		 286 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  22.03 
 
 		 361 aa  47  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>