261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1669 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  100 
 
 		 326 aa  640    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  54.02 
 
 		 316 aa  351  1e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  60.14 
 
 		 300 aa  349  4e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  55.69 
 
 		 321 aa  328  7e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  60.27 
 
 		 303 aa  310  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  55.74 
 
 		 427 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  49.48 
 
 		 291 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  50.52 
 
 		 299 aa  267  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  48.75 
 
 		 306 aa  261  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  48.25 
 
 		 321 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  45.68 
 
 		 360 aa  246  4.9999999999999997e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  49.12 
 
 		 324 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  47.35 
 
 		 312 aa  231  9e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  50.72 
 
 		 329 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  50.72 
 
 		 329 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  47.37 
 
 		 329 aa  225  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  40.5 
 
 		 317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  40.35 
 
 		 307 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  40.96 
 
 		 299 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  41.79 
 
 		 298 aa  207  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  41.13 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  42.03 
 
 		 347 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  38 
 
 		 424 aa  201  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  37.88 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  40.14 
 
 		 370 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  39.43 
 
 		 305 aa  194  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  42.55 
 
 		 325 aa  195  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  44.79 
 
 		 443 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  45.06 
 
 		 314 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  45.06 
 
 		 314 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  45.06 
 
 		 308 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  43.3 
 
 		 341 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  41.52 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  40.74 
 
 		 436 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  41.61 
 
 		 337 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  41.61 
 
 		 307 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  41.61 
 
 		 307 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  41.61 
 
 		 307 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  41.61 
 
 		 304 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  38.31 
 
 		 299 aa  189  5.999999999999999e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  41.61 
 
 		 307 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  45.02 
 
 		 310 aa  189  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  44.62 
 
 		 310 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  40.77 
 
 		 302 aa  186  4e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  44.76 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  39.66 
 
 		 304 aa  183  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  34.73 
 
 		 324 aa  182  7e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  40.07 
 
 		 301 aa  182  8.000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  33.88 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  38.44 
 
 		 324 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  41.72 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  35.14 
 
 		 323 aa  169  5e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  44 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  36.49 
 
 		 393 aa  166  6.9999999999999995e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  37.59 
 
 		 294 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  37.14 
 
 		 321 aa  143  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  38.03 
 
 		 305 aa  139  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  36.63 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  37.59 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  35.17 
 
 		 334 aa  134  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 292 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  32.27 
 
 		 320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  35.97 
 
 		 331 aa  129  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  33.63 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  33.59 
 
 		 314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  29.09 
 
 		 276 aa  122  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  27.46 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  27.46 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  37.69 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  37.69 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  27.04 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  30.94 
 
 		 368 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  25.19 
 
 		 306 aa  94.4  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4026  ribonuclease BN  29.15 
 
 		 302 aa  93.6  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.194003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  26.96 
 
 		 307 aa  93.6  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1406  ribonuclease BN  24.54 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.573356  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  30.86 
 
 		 411 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  30.86 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  25 
 
 		 538 aa  72  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  25.81 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  25.66 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  24.41 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  24.12 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  24.91 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  26.59 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  24.24 
 
 		 525 aa  67.4  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  24.24 
 
 		 525 aa  66.6  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  25.15 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  25.15 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  25.15 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  24.85 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  26.09 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0418  ribonuclease BN  27.03 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  30.65 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  27.18 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4416  ribonuclease BN  27.18 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4260  ribonuclease BN  27.18 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  27.18 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  27.18 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  29.78 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>