More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2157 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  100 
 
 		 393 aa  765    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  38.98 
 
 		 360 aa  223  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  40.43 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  36.36 
 
 		 347 aa  196  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  39.05 
 
 		 317 aa  192  8e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  36.72 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  33.84 
 
 		 321 aa  189  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  32.65 
 
 		 424 aa  188  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  40 
 
 		 321 aa  186  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  38.08 
 
 		 299 aa  184  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  38.27 
 
 		 305 aa  184  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  39.93 
 
 		 321 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  39.15 
 
 		 427 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  35.03 
 
 		 322 aa  182  9.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  36.94 
 
 		 307 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  36.62 
 
 		 291 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  38.46 
 
 		 300 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  36.03 
 
 		 324 aa  177  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  37.05 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  38.46 
 
 		 312 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  38.91 
 
 		 303 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  37.68 
 
 		 299 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  35.49 
 
 		 299 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  37.92 
 
 		 298 aa  162  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  30.45 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  37.13 
 
 		 329 aa  155  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  37.46 
 
 		 326 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  37.19 
 
 		 324 aa  153  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  36.61 
 
 		 323 aa  149  7e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  36.2 
 
 		 329 aa  149  9e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  36.2 
 
 		 329 aa  149  9e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  36.15 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  32.78 
 
 		 443 aa  143  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  34.75 
 
 		 324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  34.48 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  34.66 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  34.66 
 
 		 310 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  34.35 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  34.35 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  34.73 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 311 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  32.82 
 
 		 436 aa  136  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  34.11 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  33.92 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  34.65 
 
 		 337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  34.65 
 
 		 307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  34.65 
 
 		 307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  34.65 
 
 		 304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  34.65 
 
 		 307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  34.78 
 
 		 307 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  32.4 
 
 		 311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  35.86 
 
 		 411 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  35.83 
 
 		 306 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  32.26 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  35 
 
 		 292 aa  116  6e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  33.9 
 
 		 305 aa  116  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  35 
 
 		 292 aa  116  6.9999999999999995e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  30.34 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  28.22 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  29.37 
 
 		 306 aa  103  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  27.07 
 
 		 276 aa  102  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  32.95 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  27.09 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  27.09 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  30.38 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  31.18 
 
 		 294 aa  99.8  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  30.25 
 
 		 368 aa  99.4  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  31.4 
 
 		 305 aa  94  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  31.46 
 
 		 321 aa  92.8  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  30.43 
 
 		 334 aa  91.3  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  31.35 
 
 		 309 aa  88.2  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  23.42 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4026  ribonuclease BN  29.09 
 
 		 302 aa  82.4  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.194003 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  32.03 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  32.03 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  27.39 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  27.8 
 
 		 439 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1406  ribonuclease BN  24.43 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.573356  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  25.28 
 
 		 447 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  28.1 
 
 		 300 aa  69.3  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  27.31 
 
 		 442 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0964  ribonuclease BN  27.34 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  25.91 
 
 		 442 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  25.91 
 
 		 442 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  25.91 
 
 		 442 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  26.92 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  25 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  25 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2618  YihY family protein  25.36 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  25 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3782  putative ribonuclease BN  29.78 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.747411  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  25 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  25 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  25.67 
 
 		 377 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1654  ribonuclease BN  28.99 
 
 		 345 aa  66.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00658785  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1559  putative ribonuclease BN transmembrane protein  24.47 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  24.91 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  26.74 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2773  ribonuclease BN  25.37 
 
 		 437 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1354  ribonuclease BN  24.18 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875268  normal  0.303489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>