264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3548 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  100 
 
 		 299 aa  591  1e-168  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  42.71 
 
 		 323 aa  236  2e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  43.54 
 
 		 291 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  42.96 
 
 		 360 aa  223  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  42.18 
 
 		 306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  41.16 
 
 		 424 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  43.33 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  41.61 
 
 		 307 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  39.46 
 
 		 322 aa  209  7e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  39.31 
 
 		 305 aa  208  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  38.15 
 
 		 300 aa  202  6e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  36.45 
 
 		 317 aa  200  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  39.13 
 
 		 347 aa  192  7e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  37.41 
 
 		 324 aa  190  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  36.1 
 
 		 316 aa  188  9e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  34.01 
 
 		 321 aa  187  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  36.82 
 
 		 370 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  39.45 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  38.69 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  32.39 
 
 		 321 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  37.06 
 
 		 427 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  34.43 
 
 		 304 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  36.86 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  35.44 
 
 		 321 aa  169  7e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  36.02 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  39.04 
 
 		 326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  35.74 
 
 		 324 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  31.8 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  34.41 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  30.22 
 
 		 341 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  32.18 
 
 		 314 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  32.18 
 
 		 314 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  29.45 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  35.36 
 
 		 393 aa  159  5e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  28.18 
 
 		 310 aa  158  9e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  28.18 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  35.56 
 
 		 329 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  34.06 
 
 		 329 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  35.56 
 
 		 329 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  36.64 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  30.48 
 
 		 443 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  29.69 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  28.52 
 
 		 436 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  36.49 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  29.64 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  29.64 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  29.64 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  29.64 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  29.64 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  29.25 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  34.93 
 
 		 306 aa  143  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  34.96 
 
 		 292 aa  142  6e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  38.36 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  30.47 
 
 		 411 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  32.86 
 
 		 314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  28.16 
 
 		 324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  34.16 
 
 		 334 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  29.45 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  26.87 
 
 		 311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4026  ribonuclease BN  30.14 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.194003 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  33.71 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  28.47 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  25.96 
 
 		 306 aa  115  8.999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  28.62 
 
 		 322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  28.62 
 
 		 322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  31.52 
 
 		 321 aa  112  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  25.56 
 
 		 307 aa  108  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  30.48 
 
 		 309 aa  108  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  25.83 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  34.5 
 
 		 305 aa  102  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  34.5 
 
 		 305 aa  102  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  27.34 
 
 		 305 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  22.79 
 
 		 294 aa  93.2  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  25.17 
 
 		 306 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  26.67 
 
 		 368 aa  85.9  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1406  ribonuclease BN  25.38 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.573356  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0901  tRNA-processing RNAse BN  26.39 
 
 		 433 aa  76.3  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562692  decreased coverage  0.000000115397 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3484  ribonuclease BN  27.54 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  23.83 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01081  serum resistance locus BrkB-like protein  23.67 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1463  serum resistance locus BrkB-like protein  23.94 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01651  serum resistance locus BrkB-like protein  23.94 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.596268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  26.37 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  24.66 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  28.92 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  31.11 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  23.55 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  28.78 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  28.78 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  28.78 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  28.29 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0716  ribonuclease BN/unknown domain fusion protein  25.09 
 
 		 424 aa  63.2  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603481  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  28.3 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1997  ribonuclease BN  21.77 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  30 
 
 		 337 aa  62.4  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  29.19 
 
 		 337 aa  62.4  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3782  putative ribonuclease BN  25.48 
 
 		 417 aa  62  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.747411  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  30 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  26.92 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  21.95 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>