87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1997 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1997  ribonuclease BN  100 
 
 		 350 aa  680    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1654  ribonuclease BN  44.71 
 
 		 345 aa  251  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00658785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5288  ribonuclease BN  43.99 
 
 		 316 aa  216  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.795849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0653  ribonuclease BN  39.79 
 
 		 294 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  34.38 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  34.36 
 
 		 546 aa  176  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3429  ribonuclease BN  37.88 
 
 		 320 aa  169  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0352  ribonuclease BN  34.08 
 
 		 387 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.062974  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0362  ribonuclease BN  34.08 
 
 		 387 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0341  ribonuclease BN  34.08 
 
 		 387 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2292  ribonuclease BN  38.41 
 
 		 328 aa  149  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4548  ribonuclease BN  31.52 
 
 		 349 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3865  ribonuclease BN  32.86 
 
 		 341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.769033  normal  0.0435739 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1862  ribonuclease BN  35.28 
 
 		 351 aa  130  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0591139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  26.39 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  25.38 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  22.61 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05300  ribonuclease, putative  27.51 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  25.38 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  25.38 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  28.04 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  24 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  25.18 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3919  putative ribonuclease  21.58 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1240  putative ribonuclease  22.59 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35918 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3880  putative ribonuclease  22.34 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3924  putative ribonuclease  22.34 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3983  putative ribonuclease  22.34 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.344715 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3815  putative ribonuclease  22.34 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0195  ribonuclease  22.3 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03323  hypothetical protein  22.3 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  20.06 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0191  ribonuclease  22.3 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3725  putative ribonuclease  22.3 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03370  conserved inner membrane protein  22.3 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4010  putative ribonuclease  22.3 
 
 		 337 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4885  putative ribonuclease  22.3 
 
 		 337 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  23.43 
 
 		 341 aa  59.3  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3826  putative ribonuclease  22.3 
 
 		 337 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3927  putative ribonuclease  22.3 
 
 		 337 aa  59.3  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3802  putative ribonuclease  22.22 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  21.89 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4744  putative ribonuclease  22.35 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3484  ribonuclease BN  25.16 
 
 		 378 aa  54.3  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  28.72 
 
 		 367 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  27.34 
 
 		 300 aa  53.5  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0950  ribonuclease  23.13 
 
 		 332 aa  52.8  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  24.91 
 
 		 370 aa  53.1  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  26.98 
 
 		 347 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  26.57 
 
 		 349 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  24.66 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  24.28 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1295  ribonuclease  25.65 
 
 		 361 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3957  ribonuclease BN  22.4 
 
 		 374 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  22.07 
 
 		 525 aa  51.2  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  22.41 
 
 		 424 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3886  ribonuclease  25 
 
 		 332 aa  50.8  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  27.34 
 
 		 301 aa  50.8  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  23.44 
 
 		 276 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  23.27 
 
 		 311 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  26.64 
 
 		 316 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  27.05 
 
 		 298 aa  50.4  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  23.99 
 
 		 307 aa  49.7  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  23.66 
 
 		 347 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  22.26 
 
 		 525 aa  49.7  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  21.76 
 
 		 338 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1457  ribonuclease BN  25.26 
 
 		 484 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  24.43 
 
 		 374 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  21.76 
 
 		 338 aa  47  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1769  ribonuclease BN  21.15 
 
 		 377 aa  47  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  26.21 
 
 		 328 aa  46.6  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  22.18 
 
 		 277 aa  46.6  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  25.1 
 
 		 341 aa  46.6  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  24.86 
 
 		 402 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  26.24 
 
 		 445 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  22.83 
 
 		 427 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  24.29 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0671  ribonuclease BN  24.48 
 
 		 315 aa  44.3  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.157242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  22.59 
 
 		 347 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  21.63 
 
 		 339 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  21.63 
 
 		 339 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  25.09 
 
 		 377 aa  43.5  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  25.09 
 
 		 328 aa  43.1  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2446  ribonuclease BN  26.78 
 
 		 263 aa  42.7  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.805614  hitchhiker  0.00565169 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  24.55 
 
 		 393 aa  42.7  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0535  putative ribonuclease BN  24.78 
 
 		 329 aa  42.7  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  21.72 
 
 		 321 aa  42.7  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>