94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1295 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1295  ribonuclease  100 
 
 		 361 aa  704    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3886  ribonuclease  43.81 
 
 		 332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  42.05 
 
 		 361 aa  232  8.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  41.72 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  39.7 
 
 		 338 aa  229  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  41.72 
 
 		 357 aa  228  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  40 
 
 		 338 aa  226  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4744  putative ribonuclease  41.22 
 
 		 339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4073  ribonuclease  42.39 
 
 		 328 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3919  putative ribonuclease  38.32 
 
 		 341 aa  210  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431008  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0191  ribonuclease  40.14 
 
 		 337 aa  209  5e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03323  hypothetical protein  40.14 
 
 		 337 aa  209  5e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0195  ribonuclease  40.14 
 
 		 337 aa  209  5e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3725  putative ribonuclease  40.14 
 
 		 337 aa  209  5e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03370  conserved inner membrane protein  40.14 
 
 		 337 aa  209  5e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3826  putative ribonuclease  40.14 
 
 		 337 aa  209  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4885  putative ribonuclease  40.14 
 
 		 337 aa  209  6e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4010  putative ribonuclease  40.14 
 
 		 337 aa  209  6e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3927  putative ribonuclease  40.14 
 
 		 337 aa  209  6e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05300  ribonuclease, putative  41.77 
 
 		 366 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  41.98 
 
 		 339 aa  203  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3924  putative ribonuclease  36.83 
 
 		 342 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3815  putative ribonuclease  36.83 
 
 		 342 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3983  putative ribonuclease  36.83 
 
 		 342 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.344715 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3880  putative ribonuclease  36.83 
 
 		 342 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3802  putative ribonuclease  38.31 
 
 		 342 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  34.16 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0950  ribonuclease  35.6 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  32.69 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  32.69 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  34.04 
 
 		 347 aa  150  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1769  ribonuclease BN  31.41 
 
 		 377 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1240  putative ribonuclease  29.77 
 
 		 343 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35918 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13368  integral membrane protein  32.13 
 
 		 289 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3957  ribonuclease BN  31.77 
 
 		 374 aa  113  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  31.65 
 
 		 341 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5966  ribonuclease BN  32.44 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172061 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0663  ribonuclease BN  33.57 
 
 		 411 aa  106  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362248  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  29.43 
 
 		 311 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1198  ribonuclease BN  31.35 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000216425 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0671  ribonuclease BN  32.85 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.157242 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4405  ribonuclease BN  32.28 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25840  predicted membrane protein  28.52 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3967  ribonuclease BN  29.58 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.565971 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0799  ribonuclease BN  31.25 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1012  ribonuclease BN  30.53 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14240  predicted membrane protein  26.07 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00629012  normal  0.0181744 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1124  ribonuclease BN  28.37 
 
 		 329 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0743  ribonuclease BN  28.77 
 
 		 307 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183226  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2955  ribonuclease BN  26.64 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00451533  decreased coverage  0.000148448 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4548  ribonuclease BN  26.82 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02750  YihY family protein  24.75 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  25.56 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0014  putative ribonuclease BN  24.73 
 
 		 450 aa  56.2  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  27.48 
 
 		 499 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  23.26 
 
 		 377 aa  53.5  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0898  ribonuclease BN  23.68 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0551761 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  24.34 
 
 		 328 aa  49.7  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  24.23 
 
 		 331 aa  49.7  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  24.73 
 
 		 363 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  25.27 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0362  ribonuclease BN  24.72 
 
 		 387 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0352  ribonuclease BN  24.72 
 
 		 387 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.062974  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0341  ribonuclease BN  24.72 
 
 		 387 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0986  ribonuclease BN  26.03 
 
 		 288 aa  47  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  24.36 
 
 		 316 aa  47  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  25.17 
 
 		 300 aa  46.2  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2446  ribonuclease BN  25.1 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.805614  hitchhiker  0.00565169 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2776  putative ribonuclease BN  32.67 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  22.87 
 
 		 370 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  21.91 
 
 		 360 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  21.69 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  24.37 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3064  ribonuclease BN, putative  37.5 
 
 		 473 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00183316  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  25.82 
 
 		 341 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0518  YihY family protein  26.45 
 
 		 276 aa  44.7  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0775636  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5550  membrane protein-like protein  27.05 
 
 		 302 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.989573  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1346  ribonuclease BN  26.45 
 
 		 268 aa  44.7  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1225  YihY family protein  26.45 
 
 		 268 aa  44.7  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.308333  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1313  ribonuclease BN  24.5 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0115904  normal  0.255561 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1819  putative ribonuclease BN  21.74 
 
 		 442 aa  43.9  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.10172  normal  0.193645 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  24.37 
 
 		 299 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2460  ribonuclease BN, putative  26.07 
 
 		 397 aa  44.3  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0143  hypothetical protein  25.98 
 
 		 266 aa  43.9  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23892  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2112  ribonuclease BN  27.31 
 
 		 425 aa  43.9  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181145  normal  0.117227 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  24.46 
 
 		 294 aa  43.5  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  25.85 
 
 		 350 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  25.85 
 
 		 350 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  25.85 
 
 		 350 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1514  ribonuclease BN  25.57 
 
 		 472 aa  43.1  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.258349  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  23.86 
 
 		 299 aa  43.1  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  21.67 
 
 		 316 aa  43.1  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  21.83 
 
 		 289 aa  42.7  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  22.04 
 
 		 324 aa  42.7  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>