119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1213 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  666    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  100 
 
 		 339 aa  666    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1240  putative ribonuclease  76.33 
 
 		 343 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35918 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  65.98 
 
 		 346 aa  437  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  67.85 
 
 		 347 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13368  integral membrane protein  55.91 
 
 		 289 aa  294  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0950  ribonuclease  48.18 
 
 		 332 aa  283  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05300  ribonuclease, putative  46.15 
 
 		 366 aa  255  7e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  43.07 
 
 		 339 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1769  ribonuclease BN  40.25 
 
 		 377 aa  241  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  37.46 
 
 		 366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03370  conserved inner membrane protein  36.39 
 
 		 337 aa  183  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0191  ribonuclease  36.39 
 
 		 337 aa  183  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  37.8 
 
 		 361 aa  184  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3725  putative ribonuclease  36.39 
 
 		 337 aa  183  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4010  putative ribonuclease  36.39 
 
 		 337 aa  183  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0195  ribonuclease  36.39 
 
 		 337 aa  183  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3927  putative ribonuclease  36.39 
 
 		 337 aa  183  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4885  putative ribonuclease  36.39 
 
 		 337 aa  183  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03323  hypothetical protein  36.39 
 
 		 337 aa  183  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3826  putative ribonuclease  36.71 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  34.69 
 
 		 357 aa  181  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  36 
 
 		 338 aa  179  7e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4744  putative ribonuclease  38.49 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  37.25 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3919  putative ribonuclease  34.62 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3886  ribonuclease  35.29 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4073  ribonuclease  37.63 
 
 		 328 aa  170  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3880  putative ribonuclease  33.92 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3924  putative ribonuclease  33.92 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3802  putative ribonuclease  33.92 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3815  putative ribonuclease  33.92 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3983  putative ribonuclease  33.92 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.344715 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1295  ribonuclease  32.69 
 
 		 361 aa  155  8e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  33.8 
 
 		 341 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0663  ribonuclease BN  32.14 
 
 		 411 aa  120  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362248  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5966  ribonuclease BN  32.26 
 
 		 390 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  31.9 
 
 		 311 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3957  ribonuclease BN  32.53 
 
 		 374 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4405  ribonuclease BN  32.78 
 
 		 343 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0671  ribonuclease BN  31.69 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.157242 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0898  ribonuclease BN  27.99 
 
 		 307 aa  97.1  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0551761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5550  membrane protein-like protein  30.9 
 
 		 302 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.989573  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3967  ribonuclease BN  27.89 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.565971 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4548  ribonuclease BN  30.68 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0743  ribonuclease BN  27.48 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183226  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  25.33 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0143  hypothetical protein  25.28 
 
 		 266 aa  65.5  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23892  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  25.09 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  25.85 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0799  ribonuclease BN  29.78 
 
 		 367 aa  62.4  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  25.42 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  24.63 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0409  ribonuclease BN  27.88 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1765  YihY family protein  27.88 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0693  ribonuclease BN  26.64 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0014  putative ribonuclease BN  25.6 
 
 		 450 aa  57.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25840  predicted membrane protein  23.22 
 
 		 375 aa  57  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2955  ribonuclease BN  24.33 
 
 		 389 aa  57  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00451533  decreased coverage  0.000148448 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  25.32 
 
 		 386 aa  56.2  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0653  ribonuclease BN  27.42 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  27.06 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1198  ribonuclease BN  23.93 
 
 		 324 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000216425 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1124  ribonuclease BN  23.78 
 
 		 329 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  21.53 
 
 		 347 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1012  ribonuclease BN  24.77 
 
 		 344 aa  52.8  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  22.26 
 
 		 360 aa  52.8  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  24.45 
 
 		 298 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  25.16 
 
 		 368 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  26.45 
 
 		 396 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2460  ribonuclease BN, putative  25.71 
 
 		 397 aa  49.7  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  29.03 
 
 		 367 aa  49.7  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  26.18 
 
 		 437 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  26.18 
 
 		 437 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  33.02 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  26.18 
 
 		 437 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  26.18 
 
 		 437 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  26.18 
 
 		 437 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  21.33 
 
 		 324 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2618  YihY family protein  26.61 
 
 		 437 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1360  ribonuclease BN  29.2 
 
 		 406 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116545  normal  0.0156446 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  23 
 
 		 320 aa  47  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  20.07 
 
 		 321 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14240  predicted membrane protein  23.59 
 
 		 352 aa  47  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00629012  normal  0.0181744 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  26.71 
 
 		 322 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  25.09 
 
 		 375 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  21.86 
 
 		 304 aa  46.2  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  23.1 
 
 		 374 aa  46.6  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02750  YihY family protein  27.89 
 
 		 360 aa  46.2  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0406  ribonuclease BN  26.18 
 
 		 436 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0756  tRNA-processing ribonuclease BN  26.18 
 
 		 436 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902171  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  23.88 
 
 		 401 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  26.83 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20430  predicted membrane protein  25.48 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0112406  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  27.27 
 
 		 445 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  29.69 
 
 		 352 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  29.79 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  26.67 
 
 		 447 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  22.37 
 
 		 397 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  22.37 
 
 		 397 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>