155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5288 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5288  ribonuclease BN  100 
 
 		 316 aa  617  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.795849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0653  ribonuclease BN  54.14 
 
 		 294 aa  303  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1997  ribonuclease BN  44.05 
 
 		 350 aa  224  1e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1654  ribonuclease BN  45.14 
 
 		 345 aa  205  9e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00658785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  39.34 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  41.42 
 
 		 546 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4548  ribonuclease BN  37.95 
 
 		 349 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3429  ribonuclease BN  37.25 
 
 		 320 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0352  ribonuclease BN  38 
 
 		 387 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.062974  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0362  ribonuclease BN  38 
 
 		 387 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0341  ribonuclease BN  38 
 
 		 387 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2292  ribonuclease BN  40.85 
 
 		 328 aa  149  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1862  ribonuclease BN  38.89 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0591139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3865  ribonuclease BN  37.42 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.769033  normal  0.0435739 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3957  ribonuclease BN  26.46 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  23.75 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  28.74 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  24.42 
 
 		 346 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  26.12 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  27.62 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  28.42 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  26.26 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  26.98 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  23.4 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05300  ribonuclease, putative  24.62 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  26.26 
 
 		 339 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  24.41 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  24.67 
 
 		 370 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  25.37 
 
 		 328 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  24.69 
 
 		 328 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  24.75 
 
 		 361 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  24.75 
 
 		 366 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  24.91 
 
 		 324 aa  53.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  25.99 
 
 		 444 aa  53.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  23.84 
 
 		 424 aa  53.5  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  23.99 
 
 		 414 aa  53.1  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  27.04 
 
 		 393 aa  52.4  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  23.05 
 
 		 316 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1200  putative ribonuclease BN  27.73 
 
 		 429 aa  52  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530131  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0950  ribonuclease  22.54 
 
 		 332 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1769  ribonuclease BN  23.19 
 
 		 377 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  22.92 
 
 		 322 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3919  putative ribonuclease  21.82 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  31.22 
 
 		 402 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0671  ribonuclease BN  29.33 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.157242 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  33.91 
 
 		 350 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1119  ribonuclease BN  27.34 
 
 		 429 aa  50.8  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695932  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  33.91 
 
 		 350 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1240  putative ribonuclease  22.41 
 
 		 343 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35918 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  33.91 
 
 		 350 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  24.75 
 
 		 388 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  24.16 
 
 		 291 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  23.18 
 
 		 338 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03370  conserved inner membrane protein  21.03 
 
 		 337 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0191  ribonuclease  21.03 
 
 		 337 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  31.43 
 
 		 377 aa  50.1  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  24.82 
 
 		 359 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3725  putative ribonuclease  21.03 
 
 		 337 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4885  putative ribonuclease  21.03 
 
 		 337 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4010  putative ribonuclease  21.03 
 
 		 337 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03323  hypothetical protein  21.03 
 
 		 337 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0195  ribonuclease  21.03 
 
 		 337 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3826  putative ribonuclease  21.03 
 
 		 337 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3927  putative ribonuclease  21.03 
 
 		 337 aa  50.1  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  26.24 
 
 		 289 aa  50.1  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  25.97 
 
 		 321 aa  49.7  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3967  ribonuclease BN  36.07 
 
 		 357 aa  49.7  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.565971 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  24.65 
 
 		 289 aa  49.7  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  25.35 
 
 		 286 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  24.41 
 
 		 388 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  21.32 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  24.41 
 
 		 386 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  26.59 
 
 		 324 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  23.27 
 
 		 447 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1454  putative ribonuclease BN  26.81 
 
 		 446 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1422  putative ribonuclease BN transmembrane protein  26.72 
 
 		 416 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00924301 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  24.61 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3886  ribonuclease  25.56 
 
 		 332 aa  47.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  23.55 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  22.48 
 
 		 311 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  23.05 
 
 		 291 aa  47  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  24.74 
 
 		 289 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  24.74 
 
 		 289 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  24.74 
 
 		 289 aa  46.6  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  24.74 
 
 		 289 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  24.74 
 
 		 289 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  24.74 
 
 		 289 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  22.5 
 
 		 451 aa  47  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  24.58 
 
 		 375 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  28.99 
 
 		 371 aa  46.6  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  23 
 
 		 338 aa  46.6  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  22.14 
 
 		 277 aa  46.6  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  22.37 
 
 		 525 aa  46.2  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  20.23 
 
 		 299 aa  46.2  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1119  hypothetical protein  27.15 
 
 		 325 aa  45.8  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0117194  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  23.97 
 
 		 363 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  22.04 
 
 		 525 aa  45.4  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1670  ribonuclease BN  24.31 
 
 		 403 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  32.46 
 
 		 347 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  25.38 
 
 		 347 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>