113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1769 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1769  ribonuclease BN  100 
 
 		 377 aa  747    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  42.02 
 
 		 346 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  43.18 
 
 		 347 aa  249  5e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  38.33 
 
 		 339 aa  246  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  40.13 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  40.13 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1240  putative ribonuclease  41.61 
 
 		 343 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35918 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0950  ribonuclease  41.04 
 
 		 332 aa  236  5.0000000000000005e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05300  ribonuclease, putative  39.7 
 
 		 366 aa  219  5e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13368  integral membrane protein  40.78 
 
 		 289 aa  195  9e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4744  putative ribonuclease  33.62 
 
 		 339 aa  172  9e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3919  putative ribonuclease  32.82 
 
 		 341 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431008  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03370  conserved inner membrane protein  34.44 
 
 		 337 aa  168  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0191  ribonuclease  34.44 
 
 		 337 aa  168  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3725  putative ribonuclease  34.44 
 
 		 337 aa  168  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0195  ribonuclease  34.44 
 
 		 337 aa  168  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03323  hypothetical protein  34.44 
 
 		 337 aa  168  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4010  putative ribonuclease  34.63 
 
 		 337 aa  166  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3927  putative ribonuclease  34.63 
 
 		 337 aa  166  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4885  putative ribonuclease  34.63 
 
 		 337 aa  166  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3826  putative ribonuclease  34.63 
 
 		 337 aa  166  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3802  putative ribonuclease  32.24 
 
 		 342 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3880  putative ribonuclease  32.24 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3924  putative ribonuclease  32.24 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3815  putative ribonuclease  32.24 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3983  putative ribonuclease  32.24 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.344715 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  33.79 
 
 		 357 aa  159  6e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  30.58 
 
 		 338 aa  159  9e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  32.81 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  30.67 
 
 		 338 aa  158  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  33.57 
 
 		 361 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4073  ribonuclease  34.89 
 
 		 328 aa  152  8.999999999999999e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1295  ribonuclease  31.66 
 
 		 361 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3886  ribonuclease  32.36 
 
 		 332 aa  143  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  28.67 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  30.24 
 
 		 311 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3957  ribonuclease BN  28.47 
 
 		 374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0671  ribonuclease BN  30.5 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.157242 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0663  ribonuclease BN  27.86 
 
 		 411 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362248  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0898  ribonuclease BN  28.5 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0551761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5966  ribonuclease BN  27.44 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172061 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4405  ribonuclease BN  25.52 
 
 		 343 aa  79.7  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14240  predicted membrane protein  26.27 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00629012  normal  0.0181744 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25840  predicted membrane protein  24.26 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4548  ribonuclease BN  25.73 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2955  ribonuclease BN  24.36 
 
 		 389 aa  62.8  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00451533  decreased coverage  0.000148448 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0799  ribonuclease BN  25.83 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5550  membrane protein-like protein  23.62 
 
 		 302 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.989573  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  25.62 
 
 		 525 aa  60.1  0.00000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  24.54 
 
 		 538 aa  60.1  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  25.53 
 
 		 525 aa  59.7  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1198  ribonuclease BN  25.75 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000216425 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  25.81 
 
 		 347 aa  57  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3967  ribonuclease BN  23.55 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.565971 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1124  ribonuclease BN  23.59 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  22.76 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  23.5 
 
 		 405 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  24.65 
 
 		 499 aa  53.5  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1012  ribonuclease BN  25.47 
 
 		 344 aa  53.1  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0743  ribonuclease BN  24.91 
 
 		 307 aa  52.8  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183226  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3865  ribonuclease BN  24.31 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.769033  normal  0.0435739 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4086  putative ribonuclease BN  24.24 
 
 		 487 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1346  ribonuclease BN  25.95 
 
 		 268 aa  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0352  ribonuclease BN  25.27 
 
 		 387 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.062974  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0362  ribonuclease BN  25.27 
 
 		 387 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1225  YihY family protein  25.95 
 
 		 268 aa  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.308333  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  24.45 
 
 		 451 aa  50.1  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0341  ribonuclease BN  25.27 
 
 		 387 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0518  YihY family protein  25.95 
 
 		 276 aa  49.7  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0775636  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  24.44 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  25 
 
 		 437 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1519  ribonuclease BN  25.32 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  25 
 
 		 437 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  25 
 
 		 437 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0692  ribonuclease BN  24.55 
 
 		 266 aa  48.5  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.139852  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  25 
 
 		 437 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  25 
 
 		 437 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  23.94 
 
 		 411 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0693  ribonuclease BN  22.12 
 
 		 288 aa  47.8  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  24.15 
 
 		 444 aa  47  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  23.94 
 
 		 411 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  25.52 
 
 		 442 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  25.68 
 
 		 442 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4966  ribonuclease BN  25.08 
 
 		 448 aa  46.2  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0732  ribonuclease BN  25.29 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119651  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2618  YihY family protein  25.2 
 
 		 437 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  25.52 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  26.19 
 
 		 443 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0406  ribonuclease BN  25 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0756  tRNA-processing ribonuclease BN  25 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902171  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  26.19 
 
 		 443 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2773  ribonuclease BN  24.91 
 
 		 437 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  23.55 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  24.62 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  25.29 
 
 		 443 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  24.91 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  26.54 
 
 		 447 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0817  ribonuclease BN  24.06 
 
 		 315 aa  44.7  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0979  putative ribonuclease BN  23.48 
 
 		 282 aa  44.3  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4111  ribonuclease BN  23.4 
 
 		 290 aa  43.9  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>