69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13368 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13368  integral membrane protein  100 
 
 		 289 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1240  putative ribonuclease  61.97 
 
 		 343 aa  329  3e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35918 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  58.66 
 
 		 346 aa  326  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  56.79 
 
 		 339 aa  326  3e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  56.79 
 
 		 339 aa  326  3e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  59.93 
 
 		 347 aa  311  5.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0950  ribonuclease  42.29 
 
 		 332 aa  227  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1769  ribonuclease BN  41.24 
 
 		 377 aa  226  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  39.51 
 
 		 339 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05300  ribonuclease, putative  40.14 
 
 		 366 aa  187  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0195  ribonuclease  35.04 
 
 		 337 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3725  putative ribonuclease  35.04 
 
 		 337 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4010  putative ribonuclease  35.04 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03370  conserved inner membrane protein  35.04 
 
 		 337 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4885  putative ribonuclease  35.04 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3826  putative ribonuclease  35.04 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3927  putative ribonuclease  35.04 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03323  hypothetical protein  35.04 
 
 		 337 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0191  ribonuclease  35.04 
 
 		 337 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  35.17 
 
 		 361 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  35.17 
 
 		 366 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  35.34 
 
 		 357 aa  158  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4744  putative ribonuclease  36.86 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3919  putative ribonuclease  33.94 
 
 		 341 aa  154  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3886  ribonuclease  36.13 
 
 		 332 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  35 
 
 		 338 aa  149  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  34.68 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4073  ribonuclease  35.81 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3815  putative ribonuclease  33.21 
 
 		 342 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3802  putative ribonuclease  33.21 
 
 		 342 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3924  putative ribonuclease  33.21 
 
 		 342 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3983  putative ribonuclease  33.21 
 
 		 342 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.344715 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3880  putative ribonuclease  33.21 
 
 		 342 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1295  ribonuclease  32.87 
 
 		 361 aa  133  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  32.62 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  33.57 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0671  ribonuclease BN  30.56 
 
 		 315 aa  89.4  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.157242 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3957  ribonuclease BN  29.54 
 
 		 374 aa  87.4  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0663  ribonuclease BN  26.71 
 
 		 411 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362248  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5966  ribonuclease BN  26.18 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5550  membrane protein-like protein  28.15 
 
 		 302 aa  75.5  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.989573  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0898  ribonuclease BN  25.54 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0551761 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4405  ribonuclease BN  28 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0743  ribonuclease BN  28.2 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183226  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0799  ribonuclease BN  29.22 
 
 		 367 aa  69.3  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  29.33 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3967  ribonuclease BN  25.52 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.565971 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  25.66 
 
 		 337 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4548  ribonuclease BN  30.16 
 
 		 349 aa  50.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  33.05 
 
 		 445 aa  49.3  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0014  putative ribonuclease BN  24.09 
 
 		 450 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1198  ribonuclease BN  24.64 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000216425 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25840  predicted membrane protein  29.29 
 
 		 375 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  23.72 
 
 		 424 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1124  ribonuclease BN  28.99 
 
 		 329 aa  46.2  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0817  ribonuclease BN  25.73 
 
 		 315 aa  45.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  26.72 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0693  ribonuclease BN  23.18 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0362  ribonuclease BN  28.8 
 
 		 387 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0352  ribonuclease BN  28.8 
 
 		 387 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.062974  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0341  ribonuclease BN  28.8 
 
 		 387 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  29.66 
 
 		 347 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  20.5 
 
 		 360 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  23.08 
 
 		 291 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0986  ribonuclease BN  30.56 
 
 		 288 aa  43.5  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0653  ribonuclease BN  26.6 
 
 		 294 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  26.44 
 
 		 306 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1292  ribonuclease BN family protein  28.23 
 
 		 271 aa  42.4  0.008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  22.76 
 
 		 322 aa  42.7  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>