102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0663 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0663  ribonuclease BN  100 
 
 		 411 aa  798    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362248  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5966  ribonuclease BN  69.53 
 
 		 390 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172061 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  42.44 
 
 		 341 aa  209  6e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3957  ribonuclease BN  46.13 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  43.96 
 
 		 311 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0671  ribonuclease BN  49.64 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.157242 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03370  conserved inner membrane protein  33.22 
 
 		 337 aa  155  9e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0191  ribonuclease  33.22 
 
 		 337 aa  155  9e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3725  putative ribonuclease  33.22 
 
 		 337 aa  155  9e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0195  ribonuclease  33.22 
 
 		 337 aa  155  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03323  hypothetical protein  33.22 
 
 		 337 aa  155  9e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4010  putative ribonuclease  33.22 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3826  putative ribonuclease  32.9 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3927  putative ribonuclease  33.22 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4885  putative ribonuclease  33.22 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4744  putative ribonuclease  32.37 
 
 		 339 aa  153  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3919  putative ribonuclease  31.92 
 
 		 341 aa  151  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05300  ribonuclease, putative  38.08 
 
 		 366 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  32.43 
 
 		 366 aa  146  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  32.43 
 
 		 361 aa  146  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  32.14 
 
 		 339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  32.14 
 
 		 339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3886  ribonuclease  34.29 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  34.64 
 
 		 339 aa  139  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  32.5 
 
 		 338 aa  139  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  32.03 
 
 		 338 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3802  putative ribonuclease  30.7 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3880  putative ribonuclease  30.7 
 
 		 342 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3924  putative ribonuclease  30.7 
 
 		 342 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3815  putative ribonuclease  30.7 
 
 		 342 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3983  putative ribonuclease  30.7 
 
 		 342 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.344715 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  32.32 
 
 		 357 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1295  ribonuclease  31.47 
 
 		 361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0950  ribonuclease  30.36 
 
 		 332 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  30.5 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4073  ribonuclease  33.33 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  28.78 
 
 		 346 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1769  ribonuclease BN  27.61 
 
 		 377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5550  membrane protein-like protein  34.42 
 
 		 302 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.989573  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1240  putative ribonuclease  28.83 
 
 		 343 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35918 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0799  ribonuclease BN  29.52 
 
 		 367 aa  97.4  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4405  ribonuclease BN  33.55 
 
 		 343 aa  96.7  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3967  ribonuclease BN  32.2 
 
 		 357 aa  95.1  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.565971 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13368  integral membrane protein  26.18 
 
 		 289 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0898  ribonuclease BN  30.4 
 
 		 307 aa  89.7  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0551761 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0743  ribonuclease BN  29.92 
 
 		 307 aa  87  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183226  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1198  ribonuclease BN  29.08 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000216425 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2955  ribonuclease BN  31.48 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00451533  decreased coverage  0.000148448 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1012  ribonuclease BN  28.1 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14240  predicted membrane protein  31.87 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00629012  normal  0.0181744 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0143  hypothetical protein  27.63 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23892  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25840  predicted membrane protein  27.54 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1124  ribonuclease BN  28.09 
 
 		 329 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1654  ribonuclease BN  31.36 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00658785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  27.57 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  24.55 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1997  ribonuclease BN  24.82 
 
 		 350 aa  59.3  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  28.36 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  25.42 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  27.44 
 
 		 446 aa  57  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  22.54 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  25.34 
 
 		 538 aa  55.8  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0653  ribonuclease BN  25.09 
 
 		 294 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  26.78 
 
 		 324 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5288  ribonuclease BN  26.28 
 
 		 316 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.795849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  26.41 
 
 		 446 aa  54.3  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000174757 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  27.34 
 
 		 546 aa  53.9  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  23 
 
 		 525 aa  52.8  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2779  ribonuclease BN  30.89 
 
 		 453 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00809939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  23 
 
 		 525 aa  52.4  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4548  ribonuclease BN  30.77 
 
 		 349 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0352  ribonuclease BN  25.38 
 
 		 387 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.062974  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0362  ribonuclease BN  25.38 
 
 		 387 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0341  ribonuclease BN  25.38 
 
 		 387 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0014  putative ribonuclease BN  26.86 
 
 		 450 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0986  ribonuclease BN  24.72 
 
 		 288 aa  49.3  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  22.87 
 
 		 370 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  22.99 
 
 		 299 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  26.46 
 
 		 330 aa  47.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  26.42 
 
 		 320 aa  47.4  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0818  ribonuclease BN  23.19 
 
 		 405 aa  47  0.0006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0711  ribonuclease BN, putative  25.93 
 
 		 422 aa  46.6  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0788126  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  26.15 
 
 		 307 aa  46.6  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  26.84 
 
 		 447 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  26.79 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  26.79 
 
 		 323 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  26.79 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  25.61 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0901  tRNA-processing RNAse BN  23.46 
 
 		 433 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562692  decreased coverage  0.000000115397 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  26.43 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  26.46 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  26.42 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  25.65 
 
 		 337 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  27.98 
 
 		 300 aa  44.7  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  25.67 
 
 		 321 aa  44.3  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  26.25 
 
 		 337 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1514  ribonuclease BN  25.59 
 
 		 472 aa  44.3  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.258349  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2776  putative ribonuclease BN  27.49 
 
 		 417 aa  43.9  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  23.83 
 
 		 336 aa  43.5  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  22.68 
 
 		 424 aa  43.1  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>