56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0898 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0898  ribonuclease BN  100 
 
 		 307 aa  608  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0551761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5550  membrane protein-like protein  44.25 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.989573  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0743  ribonuclease BN  41.64 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183226  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0799  ribonuclease BN  37.83 
 
 		 367 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  27.99 
 
 		 339 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  27.99 
 
 		 339 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  29.83 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  29.43 
 
 		 347 aa  102  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  27.37 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1240  putative ribonuclease  29.21 
 
 		 343 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  30.22 
 
 		 311 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3957  ribonuclease BN  32.03 
 
 		 374 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0950  ribonuclease  24.91 
 
 		 332 aa  91.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3826  putative ribonuclease  28.1 
 
 		 337 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  28.62 
 
 		 339 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03323  hypothetical protein  28.1 
 
 		 337 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4885  putative ribonuclease  28.1 
 
 		 337 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3927  putative ribonuclease  28.1 
 
 		 337 aa  90.9  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0191  ribonuclease  28.1 
 
 		 337 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0195  ribonuclease  28.1 
 
 		 337 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119003  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03370  conserved inner membrane protein  28.1 
 
 		 337 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3725  putative ribonuclease  28.1 
 
 		 337 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4010  putative ribonuclease  28.1 
 
 		 337 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1769  ribonuclease BN  24.22 
 
 		 377 aa  88.2  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  27.15 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  27.24 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  27.27 
 
 		 361 aa  82.8  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  27.27 
 
 		 366 aa  82.8  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0663  ribonuclease BN  29.82 
 
 		 411 aa  82.4  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362248  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3919  putative ribonuclease  26.32 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05300  ribonuclease, putative  27.97 
 
 		 366 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4744  putative ribonuclease  27.03 
 
 		 339 aa  82  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  27.9 
 
 		 338 aa  80.1  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5966  ribonuclease BN  28.57 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172061 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3886  ribonuclease  27.64 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3802  putative ribonuclease  28.36 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3924  putative ribonuclease  28.36 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3815  putative ribonuclease  28.36 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3983  putative ribonuclease  28.36 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.344715 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3880  putative ribonuclease  28.36 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4073  ribonuclease  30.51 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0671  ribonuclease BN  27.37 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.157242 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13368  integral membrane protein  24.35 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1295  ribonuclease  23.68 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  27.48 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2955  ribonuclease BN  26.14 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00451533  decreased coverage  0.000148448 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4405  ribonuclease BN  34.12 
 
 		 343 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  24.08 
 
 		 307 aa  49.3  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  22.78 
 
 		 347 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  22.96 
 
 		 538 aa  47  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  25.37 
 
 		 306 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  24.52 
 
 		 322 aa  46.2  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  26.15 
 
 		 324 aa  46.2  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  23.41 
 
 		 424 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  24.81 
 
 		 408 aa  42.7  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25840  predicted membrane protein  25.09 
 
 		 375 aa  42.4  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200788  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>