162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2530 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  100 
 
 
337 aa  674    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0352  ribonuclease BN  51.64 
 
 
387 aa  315  7e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.062974  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0362  ribonuclease BN  51.64 
 
 
387 aa  315  7e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0341  ribonuclease BN  51.64 
 
 
387 aa  315  7e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4548  ribonuclease BN  48.67 
 
 
349 aa  295  8e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2292  ribonuclease BN  53.73 
 
 
328 aa  288  6e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1862  ribonuclease BN  49.08 
 
 
351 aa  270  2.9999999999999997e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0591139  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3865  ribonuclease BN  51.27 
 
 
341 aa  264  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.769033  normal  0.0435739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  43.54 
 
 
546 aa  255  6e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3429  ribonuclease BN  42.68 
 
 
320 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1654  ribonuclease BN  40.76 
 
 
345 aa  187  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00658785  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5288  ribonuclease BN  39.34 
 
 
316 aa  178  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.795849  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0653  ribonuclease BN  37.91 
 
 
294 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1997  ribonuclease BN  34.38 
 
 
350 aa  172  5e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  27.49 
 
 
347 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05300  ribonuclease, putative  28.97 
 
 
366 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1240  putative ribonuclease  24.67 
 
 
343 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35918 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  26.71 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  27.02 
 
 
339 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  24.41 
 
 
346 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  25.33 
 
 
339 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  25.33 
 
 
339 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3484  ribonuclease BN  28.62 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  24.56 
 
 
361 aa  66.2  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  24.56 
 
 
366 aa  65.9  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  23.08 
 
 
392 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  25.27 
 
 
357 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  27.59 
 
 
316 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  25.94 
 
 
338 aa  62  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0950  ribonuclease  25.17 
 
 
332 aa  60.8  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  25 
 
 
328 aa  60.1  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  25.94 
 
 
338 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  26.54 
 
 
499 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3886  ribonuclease  26.44 
 
 
332 aa  57.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1295  ribonuclease  25.56 
 
 
361 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3957  ribonuclease BN  24.19 
 
 
374 aa  57.4  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  23.05 
 
 
324 aa  57.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  26.22 
 
 
401 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4010  putative ribonuclease  23.47 
 
 
337 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3826  putative ribonuclease  23.47 
 
 
337 aa  57  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3927  putative ribonuclease  23.47 
 
 
337 aa  56.6  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4885  putative ribonuclease  23.47 
 
 
337 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03370  conserved inner membrane protein  23.47 
 
 
337 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0191  ribonuclease  23.47 
 
 
337 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03323  hypothetical protein  23.47 
 
 
337 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3725  putative ribonuclease  23.47 
 
 
337 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0195  ribonuclease  23.47 
 
 
337 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119003  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  27.3 
 
 
349 aa  56.6  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1769  ribonuclease BN  22.76 
 
 
377 aa  56.2  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  29.23 
 
 
330 aa  56.2  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3919  putative ribonuclease  22.74 
 
 
341 aa  55.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431008  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4744  putative ribonuclease  24.39 
 
 
339 aa  55.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  24.33 
 
 
321 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  26.39 
 
 
347 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  28.36 
 
 
300 aa  55.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  26.25 
 
 
322 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  26.64 
 
 
317 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1457  ribonuclease BN  24.16 
 
 
484 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  25.38 
 
 
359 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  28.74 
 
 
322 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  27.51 
 
 
360 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20430  predicted membrane protein  23.16 
 
 
388 aa  53.5  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0112406  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3967  ribonuclease BN  25.73 
 
 
357 aa  53.1  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.565971 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  24.9 
 
 
328 aa  53.1  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  33.63 
 
 
377 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  26.17 
 
 
359 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25840  predicted membrane protein  28.48 
 
 
375 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200788  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  27.59 
 
 
356 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  25.83 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  22.51 
 
 
319 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5966  ribonuclease BN  25.47 
 
 
390 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.172061 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  25 
 
 
388 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  23.83 
 
 
289 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  26.02 
 
 
374 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  24.12 
 
 
328 aa  51.2  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  24.42 
 
 
320 aa  51.2  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  24.52 
 
 
276 aa  50.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  24.22 
 
 
288 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  24.73 
 
 
386 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1631  ribonuclease BN  26.85 
 
 
397 aa  51.2  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  24.22 
 
 
288 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  25 
 
 
388 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1422  putative ribonuclease BN transmembrane protein  25.7 
 
 
416 aa  50.4  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00924301 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  26.94 
 
 
367 aa  50.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  25.57 
 
 
307 aa  50.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  23.28 
 
 
375 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0799  ribonuclease BN  29.41 
 
 
367 aa  49.7  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13368  integral membrane protein  26.64 
 
 
289 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  23.97 
 
 
386 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0663  ribonuclease BN  26.83 
 
 
411 aa  49.3  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362248  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19220  predicted membrane protein  25.19 
 
 
463 aa  49.3  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.234203  normal  0.518782 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  23.74 
 
 
289 aa  49.3  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  25.26 
 
 
445 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0638  putative ribonuclease BN  21.93 
 
 
449 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00048226  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  25.29 
 
 
331 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2359  ribonuclease BN  29 
 
 
437 aa  48.9  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.389707  normal  0.121008 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  22.37 
 
 
347 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  23.44 
 
 
289 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  23.44 
 
 
289 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  21.92 
 
 
363 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>