161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4548 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4548  ribonuclease BN  100 
 
 		 349 aa  692    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  48.67 
 
 		 337 aa  305  9.000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0352  ribonuclease BN  46.24 
 
 		 387 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.062974  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0362  ribonuclease BN  46.24 
 
 		 387 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0341  ribonuclease BN  46.24 
 
 		 387 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1862  ribonuclease BN  45.88 
 
 		 351 aa  247  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0591139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3865  ribonuclease BN  48.43 
 
 		 341 aa  238  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.769033  normal  0.0435739 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2292  ribonuclease BN  48.6 
 
 		 328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  43.45 
 
 		 546 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1654  ribonuclease BN  35.92 
 
 		 345 aa  166  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00658785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5288  ribonuclease BN  37.95 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.795849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0653  ribonuclease BN  36.59 
 
 		 294 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3429  ribonuclease BN  35.08 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1997  ribonuclease BN  30.33 
 
 		 350 aa  142  6e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  31 
 
 		 346 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  29.63 
 
 		 339 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  29.63 
 
 		 339 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  30.86 
 
 		 347 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1769  ribonuclease BN  25.73 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1240  putative ribonuclease  30.62 
 
 		 343 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35918 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05300  ribonuclease, putative  31.73 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1295  ribonuclease  26.82 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  29.37 
 
 		 347 aa  69.7  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  26.17 
 
 		 328 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0950  ribonuclease  26.28 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  27.78 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  23.86 
 
 		 363 aa  67  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  26.28 
 
 		 384 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  26.26 
 
 		 322 aa  67  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  23.63 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  25.28 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  22.88 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  27.95 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3957  ribonuclease BN  34.72 
 
 		 374 aa  62.8  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  26.74 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  30.04 
 
 		 331 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  25.68 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  28.25 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  26.39 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  21.13 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3919  putative ribonuclease  23.72 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  23.71 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  23.71 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  25.75 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  26.09 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  28.52 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0799  ribonuclease BN  26.91 
 
 		 367 aa  57  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  24.84 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  27.21 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  23.89 
 
 		 396 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03370  conserved inner membrane protein  23.32 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0191  ribonuclease  23.32 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  29.2 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03323  hypothetical protein  23.32 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4885  putative ribonuclease  23.22 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  25.1 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3725  putative ribonuclease  23.32 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4010  putative ribonuclease  23.22 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  21.97 
 
 		 357 aa  55.1  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0195  ribonuclease  23.32 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3826  putative ribonuclease  23.22 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  25.51 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3927  putative ribonuclease  23.22 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  27.7 
 
 		 313 aa  53.9  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0671  ribonuclease BN  29.87 
 
 		 315 aa  53.5  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.157242 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  27.46 
 
 		 360 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  26.37 
 
 		 334 aa  53.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4741  ribonuclease BN  23.41 
 
 		 359 aa  52.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  21.91 
 
 		 361 aa  53.1  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5966  ribonuclease BN  25.37 
 
 		 390 aa  52.8  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172061 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  21.91 
 
 		 338 aa  52  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  25.29 
 
 		 374 aa  52.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3886  ribonuclease  26.24 
 
 		 332 aa  52.4  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4744  putative ribonuclease  22.3 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  24.84 
 
 		 445 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  21.4 
 
 		 366 aa  52.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4073  ribonuclease  25.75 
 
 		 328 aa  51.2  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  26.25 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  23.84 
 
 		 386 aa  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  22.35 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  24.41 
 
 		 386 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  23.91 
 
 		 352 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  27.06 
 
 		 317 aa  50.8  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  24.13 
 
 		 319 aa  50.8  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13368  integral membrane protein  30.16 
 
 		 289 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  24.14 
 
 		 324 aa  50.1  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  23.66 
 
 		 317 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  26.32 
 
 		 300 aa  50.1  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  26.09 
 
 		 306 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  24.41 
 
 		 386 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4883  ribonuclease BN  32.17 
 
 		 297 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  26.02 
 
 		 321 aa  49.7  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  25.1 
 
 		 328 aa  49.3  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  28.08 
 
 		 424 aa  49.3  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  23.42 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  26.43 
 
 		 289 aa  48.9  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1137  ribonuclease BN-like family transmembrane protein  27.87 
 
 		 301 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3983  putative ribonuclease  25 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.344715 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3880  putative ribonuclease  25 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3924  putative ribonuclease  25 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>