56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0817 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0817  ribonuclease BN  100 
 
 		 315 aa  618  1e-176  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25840  predicted membrane protein  42.99 
 
 		 375 aa  221  9e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2955  ribonuclease BN  42.14 
 
 		 389 aa  205  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00451533  decreased coverage  0.000148448 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1012  ribonuclease BN  43.61 
 
 		 344 aa  203  3e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0986  ribonuclease BN  42.55 
 
 		 288 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14240  predicted membrane protein  34.07 
 
 		 352 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00629012  normal  0.0181744 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3967  ribonuclease BN  31.93 
 
 		 357 aa  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.565971 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1124  ribonuclease BN  29.07 
 
 		 329 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1198  ribonuclease BN  28.81 
 
 		 324 aa  95.9  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000216425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  26.92 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  29.58 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3957  ribonuclease BN  27.48 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0143  hypothetical protein  26.39 
 
 		 266 aa  68.9  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23892  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5966  ribonuclease BN  26.99 
 
 		 390 aa  65.9  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172061 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0671  ribonuclease BN  29.72 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.157242 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  26.55 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  27 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  24.92 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1769  ribonuclease BN  23.59 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0950  ribonuclease  27.45 
 
 		 332 aa  57  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05300  ribonuclease, putative  25.55 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  25.58 
 
 		 316 aa  55.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  25.43 
 
 		 347 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  23.34 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  26.32 
 
 		 310 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  25.98 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  26.32 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  27.18 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4405  ribonuclease BN  24.08 
 
 		 343 aa  50.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  24.01 
 
 		 341 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  24.24 
 
 		 339 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  24.24 
 
 		 339 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  24.52 
 
 		 338 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  25.96 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  25.81 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  24.48 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  24.48 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  24.13 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0663  ribonuclease BN  23.55 
 
 		 411 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362248  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  23.53 
 
 		 307 aa  47  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1295  ribonuclease  25.51 
 
 		 361 aa  46.2  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1240  putative ribonuclease  23.67 
 
 		 343 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35918 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  24.07 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  20.4 
 
 		 323 aa  45.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13368  integral membrane protein  26.74 
 
 		 289 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  23.31 
 
 		 366 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  23.45 
 
 		 357 aa  43.9  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  23.88 
 
 		 325 aa  43.9  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  25.95 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  24.81 
 
 		 337 aa  43.1  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0653  ribonuclease BN  24.62 
 
 		 294 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  23.31 
 
 		 361 aa  43.1  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  24.74 
 
 		 436 aa  42.7  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4073  ribonuclease  24.1 
 
 		 328 aa  42.4  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  23.75 
 
 		 360 aa  42.4  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3429  ribonuclease BN  32.94 
 
 		 320 aa  42.4  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>