68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5550 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5550  membrane protein-like protein  100 
 
 		 302 aa  582  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.989573  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0898  ribonuclease BN  44.25 
 
 		 307 aa  197  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0551761 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0743  ribonuclease BN  41.48 
 
 		 307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183226  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0799  ribonuclease BN  42.27 
 
 		 367 aa  149  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  32.12 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05300  ribonuclease, putative  33.33 
 
 		 366 aa  126  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  30.98 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  30.98 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  35.74 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0663  ribonuclease BN  35.21 
 
 		 411 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362248  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  31.37 
 
 		 339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0950  ribonuclease  28.1 
 
 		 332 aa  108  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5966  ribonuclease BN  33.44 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172061 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3957  ribonuclease BN  37.82 
 
 		 374 aa  105  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  29.39 
 
 		 346 aa  102  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1240  putative ribonuclease  28.38 
 
 		 343 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  31.29 
 
 		 347 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0671  ribonuclease BN  35.69 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.157242 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13368  integral membrane protein  28.52 
 
 		 289 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  28.47 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1769  ribonuclease BN  24.46 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  28.23 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3919  putative ribonuclease  25.52 
 
 		 341 aa  82.4  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  28.92 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  28.92 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03323  hypothetical protein  25.96 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4885  putative ribonuclease  25.96 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0191  ribonuclease  25.96 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3927  putative ribonuclease  25.96 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3826  putative ribonuclease  25.96 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0195  ribonuclease  25.96 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119003  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03370  conserved inner membrane protein  25.96 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3725  putative ribonuclease  25.96 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4010  putative ribonuclease  25.96 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  29.27 
 
 		 357 aa  79  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4405  ribonuclease BN  34.41 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4744  putative ribonuclease  27.05 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1295  ribonuclease  26.69 
 
 		 361 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3802  putative ribonuclease  27.87 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3880  putative ribonuclease  27.87 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3924  putative ribonuclease  27.87 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3983  putative ribonuclease  27.87 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.344715 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3815  putative ribonuclease  27.87 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3886  ribonuclease  27.6 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4073  ribonuclease  28.32 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  24.81 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  24.32 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2955  ribonuclease BN  26.18 
 
 		 389 aa  55.8  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00451533  decreased coverage  0.000148448 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3967  ribonuclease BN  24.91 
 
 		 357 aa  52.8  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.565971 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  24.34 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  27.38 
 
 		 411 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  27.38 
 
 		 411 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  27.3 
 
 		 294 aa  49.7  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  24.28 
 
 		 349 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5841  ribonuclease BN  27.57 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1012  ribonuclease BN  27.3 
 
 		 344 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  25 
 
 		 405 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  24.21 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  23.73 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  25.74 
 
 		 367 aa  46.2  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25840  predicted membrane protein  25.62 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  26.92 
 
 		 408 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  24.46 
 
 		 337 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0341  ribonuclease BN  27.84 
 
 		 387 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0362  ribonuclease BN  27.84 
 
 		 387 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0352  ribonuclease BN  27.84 
 
 		 387 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.062974  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.36 
 
 		 428 aa  44.3  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000260717  hitchhiker  0.000176219 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  24.53 
 
 		 304 aa  42.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>