102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0362 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0352  ribonuclease BN  100 
 
 
387 aa  768    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.062974  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0362  ribonuclease BN  100 
 
 
387 aa  768    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0341  ribonuclease BN  100 
 
 
387 aa  768    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3865  ribonuclease BN  64.97 
 
 
341 aa  366  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.769033  normal  0.0435739 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  51.64 
 
 
337 aa  340  2.9999999999999998e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4548  ribonuclease BN  46.24 
 
 
349 aa  276  4e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2292  ribonuclease BN  55.91 
 
 
328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  50.16 
 
 
546 aa  258  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1862  ribonuclease BN  47.95 
 
 
351 aa  241  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0591139  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1654  ribonuclease BN  42 
 
 
345 aa  188  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00658785  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3429  ribonuclease BN  43.26 
 
 
320 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1997  ribonuclease BN  33.76 
 
 
350 aa  156  6e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5288  ribonuclease BN  38 
 
 
316 aa  155  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.795849  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0653  ribonuclease BN  36.33 
 
 
294 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  31.8 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  26.35 
 
 
347 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  25.18 
 
 
339 aa  73.2  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  28.04 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3957  ribonuclease BN  25.97 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  24.36 
 
 
392 aa  67  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1240  putative ribonuclease  26.07 
 
 
343 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35918 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  26.92 
 
 
401 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  28.46 
 
 
349 aa  64.7  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  26.25 
 
 
377 aa  63.5  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1769  ribonuclease BN  25.27 
 
 
377 aa  63.2  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05300  ribonuclease, putative  25.32 
 
 
366 aa  62.4  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  28.46 
 
 
445 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  27.07 
 
 
360 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  25.71 
 
 
361 aa  61.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  26.22 
 
 
363 aa  60.5  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  25.71 
 
 
366 aa  60.1  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  29.21 
 
 
350 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  29.21 
 
 
350 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  29.21 
 
 
350 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  25.91 
 
 
370 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  27.84 
 
 
311 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  27.07 
 
 
328 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0671  ribonuclease BN  29.02 
 
 
315 aa  58.9  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.157242 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  28.47 
 
 
300 aa  57  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3967  ribonuclease BN  27.55 
 
 
357 aa  57  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.565971 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  26.16 
 
 
339 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  26.16 
 
 
339 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  25 
 
 
357 aa  55.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  23.75 
 
 
321 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0950  ribonuclease  22.96 
 
 
332 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  25.64 
 
 
316 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  28.68 
 
 
359 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  24.35 
 
 
402 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  31.06 
 
 
306 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  24.91 
 
 
338 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  24.65 
 
 
338 aa  53.9  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  28.69 
 
 
374 aa  54.3  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1295  ribonuclease  23.99 
 
 
361 aa  53.9  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4744  putative ribonuclease  23.4 
 
 
339 aa  52.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  25.74 
 
 
307 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  24.11 
 
 
321 aa  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  27.41 
 
 
330 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  27.44 
 
 
291 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3886  ribonuclease  22.99 
 
 
332 aa  51.6  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  25.64 
 
 
499 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  25.86 
 
 
347 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3484  ribonuclease BN  25.61 
 
 
378 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  28.24 
 
 
427 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  21.05 
 
 
276 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0927  ribonuclease BN  27.8 
 
 
297 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  26.52 
 
 
276 aa  51.2  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  25.66 
 
 
377 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0716  ribonuclease BN/unknown domain fusion protein  24.31 
 
 
424 aa  50.1  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603481  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  23.02 
 
 
317 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  29.01 
 
 
381 aa  49.3  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0663  ribonuclease BN  25.45 
 
 
411 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362248  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0816  ribonuclease BN  25.88 
 
 
297 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.941783  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3919  putative ribonuclease  21.9 
 
 
341 aa  47.8  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431008  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13368  integral membrane protein  28.8 
 
 
289 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4073  ribonuclease  24.56 
 
 
328 aa  47.4  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  29.34 
 
 
365 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  28.19 
 
 
367 aa  47.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  23.26 
 
 
286 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  27.01 
 
 
424 aa  47  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5966  ribonuclease BN  28.21 
 
 
390 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.172061 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  22.22 
 
 
289 aa  47  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3250  ribonuclease BN  26.22 
 
 
302 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5235  ribonuclease BN  25 
 
 
297 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.192166  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  23.41 
 
 
288 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  23.41 
 
 
288 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1631  ribonuclease BN  27.6 
 
 
397 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  24.89 
 
 
311 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  22.22 
 
 
289 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  22.22 
 
 
289 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  22.22 
 
 
289 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  22.22 
 
 
289 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  22.22 
 
 
289 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  26.25 
 
 
289 aa  44.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  22.22 
 
 
289 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0750  ribonuclease BN  25.19 
 
 
297 aa  43.9  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  24.81 
 
 
347 aa  44.3  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4883  ribonuclease BN  26.45 
 
 
297 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178095  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  24.12 
 
 
299 aa  43.9  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  29.1 
 
 
313 aa  43.5  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  24.24 
 
 
299 aa  43.5  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>