120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_05300 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_05300  ribonuclease, putative  100 
 
 		 366 aa  706    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  54.9 
 
 		 339 aa  339  5e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  46.05 
 
 		 339 aa  262  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  46.05 
 
 		 339 aa  262  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  41.09 
 
 		 346 aa  250  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1240  putative ribonuclease  42.68 
 
 		 343 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  41.16 
 
 		 347 aa  230  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1295  ribonuclease  41.77 
 
 		 361 aa  222  6e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1769  ribonuclease BN  38.48 
 
 		 377 aa  217  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  39.18 
 
 		 361 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  38.87 
 
 		 366 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  38.75 
 
 		 357 aa  211  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  40.35 
 
 		 338 aa  210  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  40.18 
 
 		 338 aa  208  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4744  putative ribonuclease  42.81 
 
 		 339 aa  206  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0950  ribonuclease  38.94 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3919  putative ribonuclease  35.83 
 
 		 341 aa  203  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3826  putative ribonuclease  39.15 
 
 		 337 aa  202  6e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.135959 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03370  conserved inner membrane protein  39.22 
 
 		 337 aa  202  8e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0191  ribonuclease  39.22 
 
 		 337 aa  202  8e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3725  putative ribonuclease  39.22 
 
 		 337 aa  202  8e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4010  putative ribonuclease  39.15 
 
 		 337 aa  202  8e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0195  ribonuclease  39.22 
 
 		 337 aa  202  8e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3927  putative ribonuclease  39.15 
 
 		 337 aa  202  8e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4885  putative ribonuclease  39.15 
 
 		 337 aa  202  8e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03323  hypothetical protein  39.22 
 
 		 337 aa  202  8e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3886  ribonuclease  39.93 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3880  putative ribonuclease  36.22 
 
 		 342 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3924  putative ribonuclease  36.22 
 
 		 342 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3983  putative ribonuclease  36.22 
 
 		 342 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.344715 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4073  ribonuclease  41.3 
 
 		 328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3802  putative ribonuclease  36.22 
 
 		 342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3815  putative ribonuclease  35.9 
 
 		 342 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13368  integral membrane protein  38.55 
 
 		 289 aa  179  8e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  39.29 
 
 		 341 aa  155  7e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3957  ribonuclease BN  39.21 
 
 		 374 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  33.58 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0663  ribonuclease BN  35.97 
 
 		 411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362248  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5966  ribonuclease BN  35.38 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172061 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4405  ribonuclease BN  34.92 
 
 		 343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5550  membrane protein-like protein  32.3 
 
 		 302 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.989573  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0671  ribonuclease BN  34.16 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.157242 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  28.62 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0898  ribonuclease BN  28.01 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0551761 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3967  ribonuclease BN  27.97 
 
 		 357 aa  75.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.565971 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1198  ribonuclease BN  29.19 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000216425 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4548  ribonuclease BN  32.47 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  26.84 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  27.67 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1997  ribonuclease BN  27.6 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0799  ribonuclease BN  28.68 
 
 		 367 aa  62.8  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25840  predicted membrane protein  28.26 
 
 		 375 aa  62.8  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200788  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1012  ribonuclease BN  28.53 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0743  ribonuclease BN  28.48 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183226  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0352  ribonuclease BN  27.06 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.062974  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0362  ribonuclease BN  27.06 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0341  ribonuclease BN  27.06 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  28.74 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1124  ribonuclease BN  28.38 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14240  predicted membrane protein  26.48 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00629012  normal  0.0181744 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  25.46 
 
 		 499 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0653  ribonuclease BN  24.47 
 
 		 294 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  25.85 
 
 		 324 aa  53.5  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  25.78 
 
 		 304 aa  53.1  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  27.86 
 
 		 300 aa  53.1  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3429  ribonuclease BN  27.46 
 
 		 320 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  24.19 
 
 		 321 aa  50.8  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  28.94 
 
 		 442 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  27.78 
 
 		 442 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  25 
 
 		 316 aa  50.1  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  27.04 
 
 		 442 aa  50.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  27.78 
 
 		 442 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  26.61 
 
 		 443 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02750  YihY family protein  30.89 
 
 		 360 aa  48.9  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  25.75 
 
 		 443 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  27.55 
 
 		 546 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  27.5 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  26.19 
 
 		 299 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  25.75 
 
 		 443 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  26.32 
 
 		 298 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  24.03 
 
 		 347 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  28.04 
 
 		 310 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2955  ribonuclease BN  24.31 
 
 		 389 aa  47.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00451533  decreased coverage  0.000148448 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  27.23 
 
 		 305 aa  47  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  27.8 
 
 		 310 aa  46.6  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  25.2 
 
 		 299 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2359  ribonuclease BN  28.14 
 
 		 437 aa  46.6  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.389707  normal  0.121008 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0901  tRNA-processing RNAse BN  27.91 
 
 		 433 aa  46.6  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562692  decreased coverage  0.000000115397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5288  ribonuclease BN  25.31 
 
 		 316 aa  46.6  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.795849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  28.48 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  27.39 
 
 		 445 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  23.91 
 
 		 538 aa  45.8  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1862  ribonuclease BN  29.12 
 
 		 351 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0591139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  24.92 
 
 		 368 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  26.29 
 
 		 439 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  29.95 
 
 		 446 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  22.76 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2776  putative ribonuclease BN  24.4 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0014  putative ribonuclease BN  23.98 
 
 		 450 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  22.92 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>