96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0950 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0950  ribonuclease  100 
 
 		 332 aa  660    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  47.02 
 
 		 346 aa  295  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  48.18 
 
 		 339 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  48.18 
 
 		 339 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  49 
 
 		 347 aa  279  6e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1240  putative ribonuclease  46.03 
 
 		 343 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35918 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1769  ribonuclease BN  41.04 
 
 		 377 aa  236  4e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  38.37 
 
 		 339 aa  220  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13368  integral membrane protein  40.81 
 
 		 289 aa  199  6e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05300  ribonuclease, putative  38.55 
 
 		 366 aa  197  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4744  putative ribonuclease  33.68 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3725  putative ribonuclease  34.49 
 
 		 337 aa  169  7e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0195  ribonuclease  34.49 
 
 		 337 aa  169  7e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03323  hypothetical protein  34.49 
 
 		 337 aa  169  7e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3826  putative ribonuclease  34.49 
 
 		 337 aa  169  7e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.135959 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03370  conserved inner membrane protein  34.49 
 
 		 337 aa  169  7e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0191  ribonuclease  34.49 
 
 		 337 aa  169  7e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4010  putative ribonuclease  34.49 
 
 		 337 aa  169  8e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4885  putative ribonuclease  34.49 
 
 		 337 aa  169  8e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3927  putative ribonuclease  34.49 
 
 		 337 aa  169  8e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1295  ribonuclease  35.65 
 
 		 361 aa  166  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  32.27 
 
 		 361 aa  165  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  32.27 
 
 		 366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  32.27 
 
 		 357 aa  162  6e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3919  putative ribonuclease  32.4 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  32.59 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  32.34 
 
 		 338 aa  152  8e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3886  ribonuclease  31.56 
 
 		 332 aa  149  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  31.76 
 
 		 341 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4073  ribonuclease  31.96 
 
 		 328 aa  145  9e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3924  putative ribonuclease  31.71 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3880  putative ribonuclease  31.71 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3802  putative ribonuclease  31.71 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3815  putative ribonuclease  31.71 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3983  putative ribonuclease  31.71 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.344715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  31.02 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0671  ribonuclease BN  33.69 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.157242 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0663  ribonuclease BN  30.36 
 
 		 411 aa  100  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362248  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3957  ribonuclease BN  27.49 
 
 		 374 aa  99.4  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4405  ribonuclease BN  30.51 
 
 		 343 aa  92.4  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5966  ribonuclease BN  26.81 
 
 		 390 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0799  ribonuclease BN  29.62 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0743  ribonuclease BN  27.78 
 
 		 307 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183226  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0898  ribonuclease BN  24.91 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0551761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5550  membrane protein-like protein  32 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.989573  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4548  ribonuclease BN  24.18 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  25.17 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  24.72 
 
 		 360 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  21.5 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0653  ribonuclease BN  23.24 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  21.33 
 
 		 299 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  25.18 
 
 		 363 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  24.65 
 
 		 324 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  29.6 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  24.83 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  19.37 
 
 		 291 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  24.09 
 
 		 370 aa  53.1  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1012  ribonuclease BN  24.07 
 
 		 344 aa  52.8  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  24.38 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  23.21 
 
 		 368 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1422  putative ribonuclease BN transmembrane protein  23.08 
 
 		 416 aa  51.2  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00924301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  23.53 
 
 		 321 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3967  ribonuclease BN  25.68 
 
 		 357 aa  51.2  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.565971 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  22.74 
 
 		 311 aa  50.1  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5841  ribonuclease BN  22.57 
 
 		 290 aa  49.7  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  19.39 
 
 		 347 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0362  ribonuclease BN  28.23 
 
 		 387 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  20.28 
 
 		 321 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0014  putative ribonuclease BN  24.26 
 
 		 450 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0143  hypothetical protein  26.4 
 
 		 266 aa  48.1  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23892  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0352  ribonuclease BN  28.23 
 
 		 387 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.062974  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0341  ribonuclease BN  28.23 
 
 		 387 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  25.98 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  22.18 
 
 		 314 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  21.45 
 
 		 308 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  22.18 
 
 		 314 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  26.9 
 
 		 349 aa  47  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  20.14 
 
 		 341 aa  47  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  19.78 
 
 		 312 aa  46.6  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  19.66 
 
 		 310 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1997  ribonuclease BN  24.55 
 
 		 350 aa  46.2  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  24.15 
 
 		 300 aa  46.2  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  23.51 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  27.16 
 
 		 347 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25840  predicted membrane protein  25.44 
 
 		 375 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  19.66 
 
 		 310 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  20.98 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  20.95 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1119  ribonuclease BN  23.3 
 
 		 429 aa  43.9  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695932  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1200  putative ribonuclease BN  22.94 
 
 		 429 aa  43.1  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530131  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  23.45 
 
 		 444 aa  43.1  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  24.9 
 
 		 365 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  21.12 
 
 		 307 aa  42.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  26.35 
 
 		 401 aa  42.7  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  22.59 
 
 		 384 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  26.03 
 
 		 329 aa  42.4  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>