50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0143 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0143  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  517  1e-146  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23892  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2955  ribonuclease BN  30.53 
 
 
389 aa  97.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00451533  decreased coverage  0.000148448 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1124  ribonuclease BN  29.55 
 
 
329 aa  92.8  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  29.07 
 
 
341 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25840  predicted membrane protein  29.37 
 
 
375 aa  85.1  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200788  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1198  ribonuclease BN  29.06 
 
 
324 aa  82.4  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000216425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  29.96 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1012  ribonuclease BN  28.35 
 
 
344 aa  78.6  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0663  ribonuclease BN  27.06 
 
 
411 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362248  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  27.41 
 
 
339 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  27.41 
 
 
339 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4744  putative ribonuclease  23.13 
 
 
339 aa  72.4  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14240  predicted membrane protein  27.78 
 
 
352 aa  72  0.000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00629012  normal  0.0181744 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5966  ribonuclease BN  26.64 
 
 
390 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.172061 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3967  ribonuclease BN  29.86 
 
 
357 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.565971 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0743  ribonuclease BN  29.12 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183226  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  23.64 
 
 
366 aa  66.6  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  23.64 
 
 
361 aa  66.2  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  24.29 
 
 
338 aa  65.9  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  23.57 
 
 
338 aa  63.2  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  22.68 
 
 
357 aa  62.4  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0986  ribonuclease BN  29.3 
 
 
288 aa  62.4  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3886  ribonuclease  23.93 
 
 
332 aa  62  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0191  ribonuclease  23.21 
 
 
337 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4010  putative ribonuclease  23.21 
 
 
337 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03323  hypothetical protein  23.21 
 
 
337 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03370  conserved inner membrane protein  23.21 
 
 
337 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1240  putative ribonuclease  24.44 
 
 
343 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35918 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4885  putative ribonuclease  23.21 
 
 
337 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0671  ribonuclease BN  25.77 
 
 
315 aa  61.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.157242 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3725  putative ribonuclease  23.21 
 
 
337 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3927  putative ribonuclease  23.21 
 
 
337 aa  61.2  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3826  putative ribonuclease  23.21 
 
 
337 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0195  ribonuclease  23.21 
 
 
337 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119003  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3919  putative ribonuclease  22.89 
 
 
341 aa  58.5  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431008  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0817  ribonuclease BN  24.71 
 
 
315 aa  58.5  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  24.32 
 
 
346 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3957  ribonuclease BN  25.87 
 
 
374 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4073  ribonuclease  25 
 
 
328 aa  53.5  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3983  putative ribonuclease  23.38 
 
 
342 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.344715 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3815  putative ribonuclease  23.38 
 
 
342 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3924  putative ribonuclease  23.38 
 
 
342 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3880  putative ribonuclease  23.38 
 
 
342 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0799  ribonuclease BN  29.96 
 
 
367 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3802  putative ribonuclease  23.38 
 
 
342 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  24.91 
 
 
339 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1295  ribonuclease  27.05 
 
 
361 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4405  ribonuclease BN  26.79 
 
 
343 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0950  ribonuclease  21.9 
 
 
332 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  23.36 
 
 
347 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.285533 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>