78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_25840 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_25840  predicted membrane protein  100 
 
 		 375 aa  720    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2955  ribonuclease BN  49.67 
 
 		 389 aa  261  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00451533  decreased coverage  0.000148448 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1012  ribonuclease BN  53.4 
 
 		 344 aa  251  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0817  ribonuclease BN  42.99 
 
 		 315 aa  202  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0986  ribonuclease BN  43.66 
 
 		 288 aa  184  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14240  predicted membrane protein  34.8 
 
 		 352 aa  159  7e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00629012  normal  0.0181744 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1198  ribonuclease BN  32.06 
 
 		 324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000216425 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3967  ribonuclease BN  36.8 
 
 		 357 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.565971 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1124  ribonuclease BN  31.7 
 
 		 329 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  29.67 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0143  hypothetical protein  29.37 
 
 		 266 aa  90.5  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23892  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1295  ribonuclease  30.69 
 
 		 361 aa  87.4  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  28.9 
 
 		 311 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0671  ribonuclease BN  29.19 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.157242 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3957  ribonuclease BN  28.33 
 
 		 374 aa  72.8  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  25.56 
 
 		 338 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4744  putative ribonuclease  26.46 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  24.69 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  25.16 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  24.7 
 
 		 357 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1769  ribonuclease BN  24.32 
 
 		 377 aa  69.3  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05300  ribonuclease, putative  29.09 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5966  ribonuclease BN  27.47 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172061 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  24.92 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  24.92 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  23.53 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  23.53 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0663  ribonuclease BN  28.01 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362248  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  24.48 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  26.54 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  28.18 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3886  ribonuclease  23.2 
 
 		 332 aa  59.3  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3919  putative ribonuclease  24.6 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4010  putative ribonuclease  24.19 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  25.51 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3826  putative ribonuclease  24.19 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4885  putative ribonuclease  24.19 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3927  putative ribonuclease  24.19 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03323  hypothetical protein  24.19 
 
 		 337 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3725  putative ribonuclease  24.19 
 
 		 337 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03370  conserved inner membrane protein  24.19 
 
 		 337 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0195  ribonuclease  24.19 
 
 		 337 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119003  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0191  ribonuclease  24.19 
 
 		 337 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0743  ribonuclease BN  25.09 
 
 		 307 aa  53.5  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183226  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1240  putative ribonuclease  25 
 
 		 343 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35918 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3802  putative ribonuclease  22.15 
 
 		 342 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0950  ribonuclease  25.78 
 
 		 332 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3880  putative ribonuclease  21.82 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3983  putative ribonuclease  21.82 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.344715 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13368  integral membrane protein  27.43 
 
 		 289 aa  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3924  putative ribonuclease  21.82 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3815  putative ribonuclease  21.82 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  27.64 
 
 		 311 aa  50.1  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4073  ribonuclease  22.74 
 
 		 328 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3429  ribonuclease BN  38.89 
 
 		 320 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0931  putative ribonuclease BN  21.2 
 
 		 459 aa  47.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1631  ribonuclease BN  27.06 
 
 		 397 aa  47.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  23.24 
 
 		 360 aa  47  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0653  ribonuclease BN  28.06 
 
 		 294 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  25.27 
 
 		 291 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  23.73 
 
 		 349 aa  46.6  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  26.74 
 
 		 331 aa  46.6  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  27.68 
 
 		 334 aa  46.6  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  26.42 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  26.43 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  28.57 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  25.89 
 
 		 321 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4405  ribonuclease BN  35.54 
 
 		 343 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  30.1 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  28.17 
 
 		 309 aa  44.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  23.97 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0799  ribonuclease BN  23.17 
 
 		 367 aa  43.9  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  25 
 
 		 340 aa  43.9  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  24.5 
 
 		 301 aa  43.5  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  28.8 
 
 		 310 aa  43.5  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  24.22 
 
 		 347 aa  43.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  28.8 
 
 		 310 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2672  ribonuclease BN  26.62 
 
 		 266 aa  43.1  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.324554  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>