75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3802 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3880  putative ribonuclease  99.42 
 
 		 342 aa  700    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3924  putative ribonuclease  99.42 
 
 		 342 aa  700    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3802  putative ribonuclease  100 
 
 		 342 aa  702    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3815  putative ribonuclease  99.12 
 
 		 342 aa  698    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3983  putative ribonuclease  99.42 
 
 		 342 aa  700    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.344715 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3919  putative ribonuclease  86.26 
 
 		 341 aa  616  1e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431008  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0191  ribonuclease  85.34 
 
 		 337 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3826  putative ribonuclease  84.8 
 
 		 337 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0195  ribonuclease  85.34 
 
 		 337 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3725  putative ribonuclease  85.34 
 
 		 337 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03323  hypothetical protein  85.34 
 
 		 337 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03370  conserved inner membrane protein  85.34 
 
 		 337 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4010  putative ribonuclease  84.75 
 
 		 337 aa  609  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4885  putative ribonuclease  84.75 
 
 		 337 aa  609  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3927  putative ribonuclease  84.75 
 
 		 337 aa  609  1e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4744  putative ribonuclease  67.96 
 
 		 339 aa  476  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  68.45 
 
 		 338 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  68.14 
 
 		 338 aa  448  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  69.51 
 
 		 366 aa  444  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  69.18 
 
 		 361 aa  444  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  68.63 
 
 		 357 aa  435  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3886  ribonuclease  62.9 
 
 		 332 aa  412  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4073  ribonuclease  66.89 
 
 		 328 aa  401  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1295  ribonuclease  38.31 
 
 		 361 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  35.61 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05300  ribonuclease, putative  36.22 
 
 		 366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  35.02 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  33.92 
 
 		 339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  33.92 
 
 		 339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1769  ribonuclease BN  32.24 
 
 		 377 aa  172  5.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1240  putative ribonuclease  36.4 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  35.38 
 
 		 347 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0950  ribonuclease  31.71 
 
 		 332 aa  160  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  29.63 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13368  integral membrane protein  32.45 
 
 		 289 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3957  ribonuclease BN  32.49 
 
 		 374 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0663  ribonuclease BN  30.94 
 
 		 411 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362248  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5966  ribonuclease BN  29.93 
 
 		 390 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  29.72 
 
 		 311 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0898  ribonuclease BN  27.94 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0551761 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1198  ribonuclease BN  25.31 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000216425 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0671  ribonuclease BN  26.94 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.157242 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4405  ribonuclease BN  26.71 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0743  ribonuclease BN  24.65 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183226  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1124  ribonuclease BN  24.05 
 
 		 329 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0799  ribonuclease BN  23.96 
 
 		 367 aa  59.3  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0143  hypothetical protein  23.38 
 
 		 266 aa  53.5  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23892  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  22.74 
 
 		 337 aa  53.9  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1997  ribonuclease BN  21.58 
 
 		 350 aa  53.5  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  23.93 
 
 		 316 aa  53.1  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0653  ribonuclease BN  23.59 
 
 		 294 aa  53.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  19.57 
 
 		 360 aa  52.8  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1012  ribonuclease BN  22.86 
 
 		 344 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3967  ribonuclease BN  21.53 
 
 		 357 aa  52.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.565971 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4548  ribonuclease BN  21.69 
 
 		 349 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  21.75 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  24.5 
 
 		 321 aa  51.2  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2955  ribonuclease BN  25 
 
 		 389 aa  50.8  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00451533  decreased coverage  0.000148448 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  25.75 
 
 		 300 aa  49.3  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25840  predicted membrane protein  22.15 
 
 		 375 aa  48.9  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5550  membrane protein-like protein  25.55 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.989573  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  19.2 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  25.83 
 
 		 307 aa  46.6  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  23.62 
 
 		 306 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  20.14 
 
 		 299 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  26.77 
 
 		 329 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  24.53 
 
 		 350 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  24.53 
 
 		 350 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1654  ribonuclease BN  24.28 
 
 		 345 aa  43.9  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00658785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  24.56 
 
 		 546 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  24.53 
 
 		 350 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  25 
 
 		 322 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  25 
 
 		 322 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  23.42 
 
 		 322 aa  43.5  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  21.84 
 
 		 331 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>