90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3967 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3967  ribonuclease BN  100 
 
 		 357 aa  695    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.565971 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25840  predicted membrane protein  36.39 
 
 		 375 aa  142  9e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  31.67 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2955  ribonuclease BN  34.69 
 
 		 389 aa  126  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00451533  decreased coverage  0.000148448 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5966  ribonuclease BN  31.47 
 
 		 390 aa  113  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172061 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1012  ribonuclease BN  35.51 
 
 		 344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1124  ribonuclease BN  32.52 
 
 		 329 aa  109  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  29.58 
 
 		 339 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  29.58 
 
 		 339 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0663  ribonuclease BN  32.26 
 
 		 411 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362248  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05300  ribonuclease, putative  29.5 
 
 		 366 aa  107  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0817  ribonuclease BN  31.52 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14240  predicted membrane protein  34.07 
 
 		 352 aa  103  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00629012  normal  0.0181744 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1198  ribonuclease BN  28.47 
 
 		 324 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000216425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  27.21 
 
 		 339 aa  97.1  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3957  ribonuclease BN  32 
 
 		 374 aa  96.3  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0986  ribonuclease BN  32.58 
 
 		 288 aa  95.9  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1295  ribonuclease  28.32 
 
 		 361 aa  90.9  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  27.87 
 
 		 347 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  25.29 
 
 		 346 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  30.82 
 
 		 311 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0143  hypothetical protein  29.86 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23892  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  26.28 
 
 		 361 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  25.96 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  25.32 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  24.92 
 
 		 338 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4744  putative ribonuclease  25.6 
 
 		 339 aa  82  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1240  putative ribonuclease  27.55 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35918 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  26.2 
 
 		 357 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1769  ribonuclease BN  24.92 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3927  putative ribonuclease  26.06 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4885  putative ribonuclease  26.06 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3826  putative ribonuclease  26.06 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4010  putative ribonuclease  26.06 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03323  hypothetical protein  25.4 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0191  ribonuclease  25.4 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0671  ribonuclease BN  31.39 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.157242 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3725  putative ribonuclease  25.4 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03370  conserved inner membrane protein  25.4 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0195  ribonuclease  25.4 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3886  ribonuclease  23.31 
 
 		 332 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3919  putative ribonuclease  24.3 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4073  ribonuclease  23.93 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  25.51 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0950  ribonuclease  22.6 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3880  putative ribonuclease  22.34 
 
 		 342 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3924  putative ribonuclease  22.34 
 
 		 342 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3815  putative ribonuclease  22.34 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3983  putative ribonuclease  22.34 
 
 		 342 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.344715 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3802  putative ribonuclease  22.34 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0799  ribonuclease BN  28.46 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13368  integral membrane protein  26.71 
 
 		 289 aa  57  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  22.71 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  24.92 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0743  ribonuclease BN  27.14 
 
 		 307 aa  54.3  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183226  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0898  ribonuclease BN  27.03 
 
 		 307 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0551761 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  23.18 
 
 		 336 aa  52.8  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4405  ribonuclease BN  27.12 
 
 		 343 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0362  ribonuclease BN  25.82 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0341  ribonuclease BN  25.82 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0352  ribonuclease BN  25.82 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.062974  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  25.25 
 
 		 304 aa  49.7  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5550  membrane protein-like protein  24.91 
 
 		 302 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.989573  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3429  ribonuclease BN  28.42 
 
 		 320 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  24.81 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  24 
 
 		 300 aa  48.5  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  24.22 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  24.22 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4548  ribonuclease BN  31.17 
 
 		 349 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  24.22 
 
 		 337 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  23.64 
 
 		 374 aa  47.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  24.57 
 
 		 295 aa  47  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  29.22 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  22.74 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2446  ribonuclease BN  30.23 
 
 		 263 aa  46.2  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.805614  hitchhiker  0.00565169 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2816  putative ribonuclease BN  23.83 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  22.3 
 
 		 291 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  24.39 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  20.34 
 
 		 321 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  23.23 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  24.04 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  24.57 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  20.9 
 
 		 322 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  24.04 
 
 		 323 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  23.23 
 
 		 310 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  24.04 
 
 		 323 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0653  ribonuclease BN  26.37 
 
 		 294 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  25.58 
 
 		 324 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0901  tRNA-processing RNAse BN  21.95 
 
 		 433 aa  43.5  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562692  decreased coverage  0.000000115397 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  23.32 
 
 		 285 aa  43.9  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>