More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2446 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2446  ribonuclease BN  100 
 
 
263 aa  496  1e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.805614  hitchhiker  0.00565169 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3200  ribonuclease BN  65.89 
 
 
258 aa  301  6.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2153  ribonuclease BN  50.2 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2359  ribonuclease BN  46.55 
 
 
437 aa  191  1e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.389707  normal  0.121008 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3484  ribonuclease BN  42.57 
 
 
378 aa  187  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1457  ribonuclease BN  40.65 
 
 
484 aa  178  7e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1631  ribonuclease BN  41.73 
 
 
397 aa  177  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1535  ribonuclease BN  45.74 
 
 
469 aa  172  6.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3144  ribonuclease BN  38.19 
 
 
438 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3221  ribonuclease BN  42 
 
 
278 aa  158  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0865  ribonuclease BN  36.69 
 
 
342 aa  149  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.756909  normal  0.214041 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1009  ribonuclease BN  33.95 
 
 
301 aa  121  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2378  ribonuclease BN  36.14 
 
 
261 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0260  ribonuclease BN  33.2 
 
 
270 aa  105  6e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2816  ribonuclease BN  33.33 
 
 
285 aa  103  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0257  ribonuclease BN  31.62 
 
 
391 aa  84.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  31.72 
 
 
333 aa  82.4  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  27.94 
 
 
341 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  25.39 
 
 
283 aa  77  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  32.2 
 
 
324 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  25.58 
 
 
283 aa  75.5  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  22.89 
 
 
363 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  27.37 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  28.87 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19220  predicted membrane protein  31.72 
 
 
463 aa  70.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.234203  normal  0.518782 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  27.59 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  27.44 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  24.91 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0964  ribonuclease BN  30.94 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  27.27 
 
 
301 aa  68.9  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  30.59 
 
 
300 aa  68.9  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  27.88 
 
 
300 aa  66.2  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  29.7 
 
 
341 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  27.27 
 
 
384 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  26.18 
 
 
445 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  27.11 
 
 
351 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  29.76 
 
 
325 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  25.63 
 
 
330 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0014  putative ribonuclease BN  26.42 
 
 
450 aa  63.5  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2460  ribonuclease BN, putative  28.34 
 
 
397 aa  62.8  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  29.6 
 
 
307 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  29.6 
 
 
304 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  29.6 
 
 
307 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  26.74 
 
 
328 aa  62.8  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  29.6 
 
 
307 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  29.48 
 
 
337 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  25.28 
 
 
316 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2776  putative ribonuclease BN  26.64 
 
 
417 aa  62.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  29.6 
 
 
307 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  30.85 
 
 
334 aa  62.4  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  24.81 
 
 
317 aa  62  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  29.69 
 
 
308 aa  62  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  23.98 
 
 
446 aa  62  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000174757 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  28.25 
 
 
298 aa  61.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  27.53 
 
 
328 aa  61.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  23.98 
 
 
446 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  33.16 
 
 
310 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2678  ribonuclease BN  43.04 
 
 
266 aa  60.5  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00324748  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  18.56 
 
 
277 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  29.3 
 
 
314 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0638  putative ribonuclease BN  24.39 
 
 
449 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00048226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  29.3 
 
 
314 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  24.54 
 
 
294 aa  61.2  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  26.14 
 
 
321 aa  60.1  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0764  ribonuclease BN  25.19 
 
 
452 aa  60.1  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  25.74 
 
 
313 aa  60.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  23.55 
 
 
311 aa  60.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3478  ribonuclease BN  23.61 
 
 
289 aa  59.7  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000152191  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  28.91 
 
 
311 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  26.34 
 
 
414 aa  59.7  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  25.29 
 
 
427 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  29.39 
 
 
411 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5841  ribonuclease BN  26.94 
 
 
290 aa  59.3  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  25.45 
 
 
386 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  27.84 
 
 
367 aa  58.9  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  24.16 
 
 
328 aa  58.9  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  28.69 
 
 
320 aa  58.9  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  27.34 
 
 
338 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  23.62 
 
 
392 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  23.97 
 
 
289 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  27.06 
 
 
289 aa  58.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  23.02 
 
 
320 aa  58.5  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1005  putative ribonuclease BN  28.47 
 
 
318 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1576  ribonuclease BN-like family protein  29.57 
 
 
282 aa  58.2  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  27.34 
 
 
338 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0732  ribonuclease BN  27.24 
 
 
439 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  23.46 
 
 
291 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  27.57 
 
 
338 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  28 
 
 
317 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  24.43 
 
 
424 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  32.03 
 
 
317 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  23.55 
 
 
365 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  22.14 
 
 
304 aa  58.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  28.88 
 
 
360 aa  57.4  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  29.28 
 
 
292 aa  56.6  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  27.49 
 
 
371 aa  57  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0697  ribonuclease BN, putative  26.85 
 
 
429 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47498  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  25.91 
 
 
443 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  29.28 
 
 
292 aa  57  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  28.04 
 
 
310 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>