89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0260 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0260  ribonuclease BN  100 
 
 		 270 aa  531  1e-150  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2378  ribonuclease BN  53.05 
 
 		 261 aa  239  4e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3484  ribonuclease BN  32.94 
 
 		 378 aa  125  6e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1457  ribonuclease BN  34.5 
 
 		 484 aa  125  6e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1535  ribonuclease BN  35.57 
 
 		 469 aa  116  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2359  ribonuclease BN  34.82 
 
 		 437 aa  112  9e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.389707  normal  0.121008 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1631  ribonuclease BN  32.91 
 
 		 397 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2446  ribonuclease BN  32.76 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.805614  hitchhiker  0.00565169 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3200  ribonuclease BN  32.8 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3144  ribonuclease BN  31.92 
 
 		 438 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2153  ribonuclease BN  35.02 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3221  ribonuclease BN  33.2 
 
 		 278 aa  90.1  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0865  ribonuclease BN  28.74 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.756909  normal  0.214041 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1009  ribonuclease BN  29.43 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  26.55 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0964  ribonuclease BN  30.15 
 
 		 285 aa  62  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0529  YihY family protein  26.56 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  28.31 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  27.34 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  24.81 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  25.81 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  25.99 
 
 		 289 aa  57  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  27.9 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  27.9 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2623  putative ribonuclease BN  29.8 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  25.28 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  26.72 
 
 		 337 aa  55.8  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0504  ribonuclease BN  25.19 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0979638  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2816  ribonuclease BN  41.86 
 
 		 285 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  26.81 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  21.07 
 
 		 283 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  34.07 
 
 		 277 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0257  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 391 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  21.07 
 
 		 283 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  33.71 
 
 		 320 aa  53.5  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  24.91 
 
 		 289 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  24.91 
 
 		 289 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  24.91 
 
 		 289 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  24.91 
 
 		 289 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  24.91 
 
 		 289 aa  52.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  24.91 
 
 		 289 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  27.34 
 
 		 328 aa  51.2  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  25.19 
 
 		 424 aa  50.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3478  ribonuclease BN  26.73 
 
 		 289 aa  49.7  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000152191  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  24.91 
 
 		 384 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4768  ribonuclease BN  30.94 
 
 		 307 aa  49.3  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211591  normal  0.0891393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  23.9 
 
 		 316 aa  49.3  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1005  putative ribonuclease BN  25.51 
 
 		 318 aa  48.9  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  36.49 
 
 		 299 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  29.27 
 
 		 321 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  24.9 
 
 		 392 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  25 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  35.71 
 
 		 321 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  35.71 
 
 		 323 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  24.48 
 
 		 363 aa  47  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  22.86 
 
 		 292 aa  47.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  29.67 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  25.56 
 
 		 347 aa  46.2  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  24.29 
 
 		 291 aa  46.6  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1292  ribonuclease BN family protein  25.91 
 
 		 271 aa  46.2  0.0005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  33.33 
 
 		 318 aa  46.2  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  40.98 
 
 		 299 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  33.77 
 
 		 317 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1184  ribonuclease BN  27.27 
 
 		 278 aa  45.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2846  putative ribonuclease BN  27.27 
 
 		 278 aa  45.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  27.67 
 
 		 347 aa  45.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  24.54 
 
 		 321 aa  45.8  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  25.49 
 
 		 300 aa  44.7  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  33.33 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2672  ribonuclease BN  26.35 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.324554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  31.76 
 
 		 316 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  33.33 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  28.24 
 
 		 401 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  22.26 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  22.22 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08810  predicted membrane protein  25.17 
 
 		 417 aa  44.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0487855  normal  0.0524825 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  27.89 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  30.1 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0656  ribonuclease BN  25.68 
 
 		 355 aa  43.9  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.173698 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  25 
 
 		 330 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1323  ribonuclease BN  25.79 
 
 		 427 aa  43.5  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  32.69 
 
 		 356 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  30.39 
 
 		 386 aa  43.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  38.27 
 
 		 317 aa  43.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  34.18 
 
 		 319 aa  43.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  23.08 
 
 		 341 aa  42.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  31.4 
 
 		 351 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  26.67 
 
 		 306 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>