More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2153 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2153  ribonuclease BN  100 
 
 
260 aa  492  9.999999999999999e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2446  ribonuclease BN  50.22 
 
 
263 aa  218  8.999999999999998e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.805614  hitchhiker  0.00565169 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3200  ribonuclease BN  50.4 
 
 
258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3484  ribonuclease BN  42.86 
 
 
378 aa  183  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2359  ribonuclease BN  48.48 
 
 
437 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.389707  normal  0.121008 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1535  ribonuclease BN  45.15 
 
 
469 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1631  ribonuclease BN  38.24 
 
 
397 aa  159  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1457  ribonuclease BN  37.55 
 
 
484 aa  156  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3144  ribonuclease BN  39.02 
 
 
438 aa  148  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0865  ribonuclease BN  37.2 
 
 
342 aa  133  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.756909  normal  0.214041 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3221  ribonuclease BN  34.6 
 
 
278 aa  119  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0260  ribonuclease BN  35.02 
 
 
270 aa  115  8.999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2378  ribonuclease BN  35.97 
 
 
261 aa  113  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1009  ribonuclease BN  37.65 
 
 
301 aa  97.4  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0257  ribonuclease BN  36.4 
 
 
391 aa  90.5  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2816  ribonuclease BN  34.65 
 
 
285 aa  89.7  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  26.42 
 
 
283 aa  86.3  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  24.91 
 
 
283 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  27.41 
 
 
445 aa  73.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5841  ribonuclease BN  26.44 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  26.37 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  26.79 
 
 
386 aa  72.8  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  30.19 
 
 
349 aa  72.4  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  31.27 
 
 
300 aa  72  0.000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  24.14 
 
 
277 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  25 
 
 
359 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  25 
 
 
363 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  29.37 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  26.02 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  25.3 
 
 
316 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  32.09 
 
 
546 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  27.87 
 
 
304 aa  67  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  28.41 
 
 
314 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  28.41 
 
 
314 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  28.41 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  27.17 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  24.64 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  28.41 
 
 
341 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  27.34 
 
 
341 aa  65.5  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  27.34 
 
 
328 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  28.15 
 
 
301 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  28.03 
 
 
311 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  25.65 
 
 
384 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  27.24 
 
 
325 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  27.27 
 
 
310 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  30.47 
 
 
324 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  26.89 
 
 
310 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  24.42 
 
 
360 aa  63.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  26.42 
 
 
374 aa  62.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  28.2 
 
 
365 aa  62.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  28 
 
 
436 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19220  predicted membrane protein  29.82 
 
 
463 aa  62.8  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.234203  normal  0.518782 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  26.98 
 
 
333 aa  62.4  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  28.09 
 
 
371 aa  62.4  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  25.38 
 
 
320 aa  62.4  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  26.25 
 
 
276 aa  62  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  22.96 
 
 
397 aa  62  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  22.96 
 
 
397 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  28.12 
 
 
311 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  22.85 
 
 
317 aa  61.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  24.81 
 
 
299 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  26.57 
 
 
334 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  26.47 
 
 
289 aa  61.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3478  ribonuclease BN  26.17 
 
 
289 aa  61.2  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000152191  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  23.85 
 
 
294 aa  60.5  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  26.8 
 
 
299 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  24.54 
 
 
299 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  23.95 
 
 
299 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  27.56 
 
 
316 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  25.49 
 
 
321 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  27.31 
 
 
401 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  27.27 
 
 
377 aa  59.7  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  25.87 
 
 
317 aa  59.3  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  28.19 
 
 
381 aa  59.3  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  25.48 
 
 
320 aa  59.3  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  25.09 
 
 
316 aa  58.5  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  27.03 
 
 
318 aa  58.9  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  25.79 
 
 
298 aa  58.5  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0711  ribonuclease BN, putative  23.57 
 
 
422 aa  58.5  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0788126  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  25.99 
 
 
338 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  28.83 
 
 
350 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  25.99 
 
 
338 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  25.88 
 
 
336 aa  58.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  28.83 
 
 
350 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  26.67 
 
 
328 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0964  ribonuclease BN  29.25 
 
 
285 aa  58.5  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  24.81 
 
 
328 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  28.83 
 
 
350 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  25 
 
 
323 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  28.57 
 
 
277 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  25.65 
 
 
316 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  26.09 
 
 
367 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  23.79 
 
 
321 aa  57  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  26.27 
 
 
337 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  29.24 
 
 
310 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  26.27 
 
 
307 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  26.27 
 
 
307 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  23.6 
 
 
396 aa  57  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  25.42 
 
 
446 aa  57  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  22.43 
 
 
291 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>