297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3200 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3200  ribonuclease BN  100 
 
 
258 aa  488  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2446  ribonuclease BN  67.51 
 
 
263 aa  314  7e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.805614  hitchhiker  0.00565169 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2153  ribonuclease BN  50.4 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3484  ribonuclease BN  42.46 
 
 
378 aa  185  5e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1457  ribonuclease BN  39.36 
 
 
484 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2359  ribonuclease BN  44.4 
 
 
437 aa  181  8.000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.389707  normal  0.121008 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1631  ribonuclease BN  42.57 
 
 
397 aa  179  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3144  ribonuclease BN  40.89 
 
 
438 aa  179  4.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1535  ribonuclease BN  42.46 
 
 
469 aa  159  5e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3221  ribonuclease BN  41.11 
 
 
278 aa  159  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0865  ribonuclease BN  36.4 
 
 
342 aa  137  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.756909  normal  0.214041 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1009  ribonuclease BN  35.63 
 
 
301 aa  128  9.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2816  ribonuclease BN  33.98 
 
 
285 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2378  ribonuclease BN  34.4 
 
 
261 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0260  ribonuclease BN  32.8 
 
 
270 aa  102  7e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0257  ribonuclease BN  37.08 
 
 
391 aa  91.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  30.74 
 
 
333 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  23.66 
 
 
276 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  31.97 
 
 
374 aa  77  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  29.74 
 
 
330 aa  73.2  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  23.35 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  27.73 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  22.57 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  31.44 
 
 
324 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  29.69 
 
 
338 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  23.83 
 
 
277 aa  69.3  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  29.08 
 
 
338 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  29.08 
 
 
338 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  27.24 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19220  predicted membrane protein  26.67 
 
 
463 aa  66.2  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.234203  normal  0.518782 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  28.15 
 
 
451 aa  65.9  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  28.63 
 
 
311 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  26.69 
 
 
320 aa  65.5  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0964  ribonuclease BN  29.88 
 
 
285 aa  64.3  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  26.64 
 
 
276 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  27.8 
 
 
414 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  30.71 
 
 
300 aa  64.3  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  36.36 
 
 
316 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  26.95 
 
 
306 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  27.41 
 
 
445 aa  63.9  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  26.25 
 
 
365 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  24.02 
 
 
294 aa  63.9  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  25.78 
 
 
311 aa  62.8  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  27.82 
 
 
349 aa  62.8  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  26.12 
 
 
328 aa  62.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2678  ribonuclease BN  42.35 
 
 
266 aa  62.4  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00324748  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  27.03 
 
 
341 aa  62.4  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  27.45 
 
 
341 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  36.17 
 
 
318 aa  62  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  36.17 
 
 
319 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  26.04 
 
 
301 aa  62  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  36.17 
 
 
318 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0702  ribonuclease BN  28.73 
 
 
322 aa  62  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0014  putative ribonuclease BN  25.3 
 
 
450 aa  61.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  26.82 
 
 
328 aa  60.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  28.06 
 
 
331 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  30.24 
 
 
325 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  29.59 
 
 
443 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  29.63 
 
 
351 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  27.17 
 
 
322 aa  60.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  37.08 
 
 
289 aa  60.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  27.13 
 
 
314 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  27.13 
 
 
314 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  24.5 
 
 
289 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  27.06 
 
 
308 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  34.41 
 
 
321 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  27.38 
 
 
328 aa  59.7  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1515  ribonuclease BN-like family protein  21.88 
 
 
314 aa  59.7  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  26.15 
 
 
499 aa  59.3  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  36.05 
 
 
392 aa  59.3  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  24.51 
 
 
310 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  29.09 
 
 
317 aa  59.3  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  33.33 
 
 
323 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  27.53 
 
 
307 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  20.07 
 
 
363 aa  58.9  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  27.53 
 
 
307 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  27.53 
 
 
307 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  27.53 
 
 
304 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  27.53 
 
 
337 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  27.27 
 
 
311 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  25.1 
 
 
396 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  26.47 
 
 
316 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0732  ribonuclease BN  28.09 
 
 
439 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  24.62 
 
 
317 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  31.82 
 
 
317 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  25.61 
 
 
323 aa  58.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  27.69 
 
 
310 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  33.33 
 
 
317 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  27.53 
 
 
307 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0733  ribonuclease BN  27.35 
 
 
439 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  24.25 
 
 
328 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1576  ribonuclease BN-like family protein  24.09 
 
 
282 aa  57.4  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2776  putative ribonuclease BN  25.3 
 
 
417 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  27.69 
 
 
310 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0697  ribonuclease BN, putative  27.73 
 
 
429 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47498  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  32.95 
 
 
299 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02750  YihY family protein  27.72 
 
 
360 aa  56.2  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  23.41 
 
 
291 aa  56.6  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  23.94 
 
 
397 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  29.32 
 
 
411 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>