210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3221 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3221  ribonuclease BN  100 
 
 
278 aa  545  1e-154  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3484  ribonuclease BN  42.74 
 
 
378 aa  179  4.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1631  ribonuclease BN  42.02 
 
 
397 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2446  ribonuclease BN  42.31 
 
 
263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.805614  hitchhiker  0.00565169 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0865  ribonuclease BN  40.08 
 
 
342 aa  161  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.756909  normal  0.214041 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1457  ribonuclease BN  37.55 
 
 
484 aa  159  5e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3200  ribonuclease BN  40.8 
 
 
258 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2359  ribonuclease BN  43.23 
 
 
437 aa  150  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.389707  normal  0.121008 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3144  ribonuclease BN  34.11 
 
 
438 aa  138  8.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1535  ribonuclease BN  34.22 
 
 
469 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2153  ribonuclease BN  34.34 
 
 
260 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0257  ribonuclease BN  38.89 
 
 
391 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0260  ribonuclease BN  31.75 
 
 
270 aa  98.2  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2816  ribonuclease BN  34.31 
 
 
285 aa  97.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1009  ribonuclease BN  36.41 
 
 
301 aa  92.4  8e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2378  ribonuclease BN  32.23 
 
 
261 aa  85.9  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  26.78 
 
 
363 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  29.24 
 
 
324 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  23.84 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  23.47 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  23.93 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  23.93 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  23.49 
 
 
289 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  23.49 
 
 
289 aa  67  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  23.49 
 
 
289 aa  67  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  23.49 
 
 
289 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  23.49 
 
 
289 aa  67  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  26.62 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  23.49 
 
 
289 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  23.49 
 
 
289 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  27.24 
 
 
310 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3053  putative ribonuclease BN  25.36 
 
 
451 aa  63.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  27.57 
 
 
337 aa  62.8  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  26.98 
 
 
359 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  27.24 
 
 
310 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  22.79 
 
 
317 aa  62.4  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  28.46 
 
 
341 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  24.32 
 
 
299 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  23.74 
 
 
299 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  24.32 
 
 
299 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  26.71 
 
 
311 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  20.45 
 
 
277 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  24.73 
 
 
306 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3478  ribonuclease BN  26.11 
 
 
289 aa  60.1  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000152191  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5841  ribonuclease BN  29.23 
 
 
290 aa  59.7  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  25.42 
 
 
317 aa  59.3  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  23.11 
 
 
290 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  23.11 
 
 
290 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4416  ribonuclease BN  23.11 
 
 
290 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4260  ribonuclease BN  23.11 
 
 
290 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  23.11 
 
 
290 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1381  putative ribonuclease BN  24.72 
 
 
296 aa  58.9  0.00000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.528846  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  32.73 
 
 
321 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  27.48 
 
 
341 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  21.9 
 
 
276 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  22.96 
 
 
290 aa  58.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03771  ribonuclease BN  22.02 
 
 
290 aa  57  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4100  ribonuclease BN  22.02 
 
 
290 aa  57  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03720  hypothetical protein  22.02 
 
 
290 aa  57  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.664641  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5333  ribonuclease BN  22.02 
 
 
290 aa  57  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.247154 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4271  ribonuclease BN  22.02 
 
 
290 aa  57  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4132  ribonuclease BN  22.02 
 
 
290 aa  57  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4364  ribonuclease BN  22.02 
 
 
290 aa  57  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4111  ribonuclease BN  22.02 
 
 
290 aa  57  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235548  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4409  ribonuclease BN  22.02 
 
 
290 aa  57  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0764  ribonuclease BN  24.73 
 
 
452 aa  56.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  24.63 
 
 
300 aa  56.2  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2655  ribonuclease BN  26.14 
 
 
439 aa  56.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0702  ribonuclease BN  24.73 
 
 
322 aa  56.2  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  23.13 
 
 
316 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4878  ribonuclease BN  24.2 
 
 
296 aa  55.8  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000922798 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  23.74 
 
 
291 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  26.92 
 
 
301 aa  55.8  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  27.13 
 
 
314 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  27.13 
 
 
314 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  33.96 
 
 
323 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  27.13 
 
 
308 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0711  ribonuclease BN, putative  29.63 
 
 
422 aa  54.7  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0788126  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  26.56 
 
 
320 aa  54.3  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  20.85 
 
 
392 aa  53.5  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  27.5 
 
 
289 aa  53.1  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0964  ribonuclease BN  26.2 
 
 
285 aa  53.1  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  28.12 
 
 
374 aa  53.1  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  34.74 
 
 
338 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19220  predicted membrane protein  23.53 
 
 
463 aa  52.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.234203  normal  0.518782 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  22.41 
 
 
321 aa  52.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  23.97 
 
 
328 aa  52.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0034  ribonuclease BN  23.21 
 
 
294 aa  52.8  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  34.74 
 
 
338 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4186  ribonuclease BN  23.21 
 
 
294 aa  52.4  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  32 
 
 
317 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  33.68 
 
 
338 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  22.11 
 
 
386 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  23.48 
 
 
451 aa  51.6  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  29.6 
 
 
319 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0030  ribonuclease BN  23.21 
 
 
294 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  24.81 
 
 
437 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  24.81 
 
 
437 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  23.17 
 
 
360 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  24.81 
 
 
437 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>