226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0257 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0257  ribonuclease BN  100 
 
 
391 aa  748    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0865  ribonuclease BN  43.77 
 
 
342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.756909  normal  0.214041 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3484  ribonuclease BN  38.19 
 
 
378 aa  163  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1631  ribonuclease BN  38.43 
 
 
397 aa  149  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3221  ribonuclease BN  40.37 
 
 
278 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1457  ribonuclease BN  33.56 
 
 
484 aa  137  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3200  ribonuclease BN  37.39 
 
 
258 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2446  ribonuclease BN  33.2 
 
 
263 aa  122  8e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.805614  hitchhiker  0.00565169 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2359  ribonuclease BN  32.91 
 
 
437 aa  117  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.389707  normal  0.121008 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3144  ribonuclease BN  31.88 
 
 
438 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2153  ribonuclease BN  37.5 
 
 
260 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1535  ribonuclease BN  35.36 
 
 
469 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1009  ribonuclease BN  29.41 
 
 
301 aa  88.2  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  31.85 
 
 
401 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  28.16 
 
 
349 aa  80.1  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2816  ribonuclease BN  32.33 
 
 
285 aa  79  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  24.61 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  24.73 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0260  ribonuclease BN  29.39 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2378  ribonuclease BN  33.78 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  25.37 
 
 
363 aa  73.6  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  25.19 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  23.55 
 
 
277 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  24.54 
 
 
299 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  28.15 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  29.5 
 
 
445 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  27.68 
 
 
348 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  23.7 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  24.28 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  24.28 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  27 
 
 
352 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  30.42 
 
 
328 aa  67.8  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  23.44 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  24.07 
 
 
386 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  23.44 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  25.71 
 
 
377 aa  67.4  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  23.08 
 
 
289 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  23.08 
 
 
289 aa  67  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  23.08 
 
 
289 aa  67  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  23.08 
 
 
289 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  23.08 
 
 
289 aa  67  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  23.08 
 
 
289 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  29.43 
 
 
359 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  27.68 
 
 
334 aa  66.2  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  26.57 
 
 
328 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  28.31 
 
 
351 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  23.91 
 
 
396 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  26.89 
 
 
347 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  30.08 
 
 
301 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  29.52 
 
 
371 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  26.59 
 
 
316 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  23.15 
 
 
337 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  25.54 
 
 
347 aa  64.3  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  23.9 
 
 
386 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  26.15 
 
 
446 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000174757 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  25 
 
 
446 aa  63.2  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  26.6 
 
 
384 aa  62.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  26.23 
 
 
330 aa  62.8  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1979  hypothetical protein  25.38 
 
 
479 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  28.22 
 
 
374 aa  62.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  26.46 
 
 
310 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  22.14 
 
 
289 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  22.22 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  26.89 
 
 
367 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  24.72 
 
 
340 aa  62  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  22.62 
 
 
337 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  25.18 
 
 
321 aa  61.2  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  23.37 
 
 
392 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19220  predicted membrane protein  27.57 
 
 
463 aa  60.8  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.234203  normal  0.518782 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  25.08 
 
 
386 aa  60.5  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0521  putative ribonuclease BN  28.69 
 
 
445 aa  60.5  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.623769 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  27.41 
 
 
350 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  27.41 
 
 
350 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  27.41 
 
 
350 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  25.94 
 
 
297 aa  60.1  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  26.04 
 
 
294 aa  59.7  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  22.1 
 
 
336 aa  59.7  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  25 
 
 
311 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5841  ribonuclease BN  28.69 
 
 
290 aa  59.7  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  24.44 
 
 
360 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  25.19 
 
 
317 aa  59.3  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  35.1 
 
 
338 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  26.62 
 
 
324 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  27.41 
 
 
300 aa  59.3  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  26.14 
 
 
375 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  23.74 
 
 
276 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  26.81 
 
 
317 aa  59.3  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  23.92 
 
 
289 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  22.39 
 
 
323 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  22.39 
 
 
323 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  22.39 
 
 
323 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4086  putative ribonuclease BN  26.42 
 
 
487 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  36.84 
 
 
338 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  25.09 
 
 
356 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  36.84 
 
 
338 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  23.13 
 
 
328 aa  57.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  22.01 
 
 
323 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  27.88 
 
 
347 aa  57  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  27.88 
 
 
347 aa  57  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  22.98 
 
 
295 aa  56.2  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>