62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2378 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2378  ribonuclease BN  100 
 
 
261 aa  499  1e-140  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0260  ribonuclease BN  53.05 
 
 
270 aa  245  4e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3484  ribonuclease BN  33.86 
 
 
378 aa  118  7.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2359  ribonuclease BN  35.5 
 
 
437 aa  115  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.389707  normal  0.121008 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2446  ribonuclease BN  36.21 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.805614  hitchhiker  0.00565169 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3200  ribonuclease BN  33.73 
 
 
258 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2153  ribonuclease BN  35.97 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1631  ribonuclease BN  30.28 
 
 
397 aa  96.7  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1457  ribonuclease BN  31.82 
 
 
484 aa  95.1  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1535  ribonuclease BN  34.27 
 
 
469 aa  87.4  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3144  ribonuclease BN  31.13 
 
 
438 aa  83.2  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3221  ribonuclease BN  32.23 
 
 
278 aa  78.2  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  27.5 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0865  ribonuclease BN  39.39 
 
 
342 aa  67  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.756909  normal  0.214041 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  24.11 
 
 
283 aa  58.9  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  27.31 
 
 
310 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  24.11 
 
 
283 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  29.24 
 
 
316 aa  56.6  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0257  ribonuclease BN  38.89 
 
 
391 aa  56.6  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  26.88 
 
 
337 aa  56.2  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  26.2 
 
 
276 aa  55.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  26.69 
 
 
301 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1009  ribonuclease BN  33.33 
 
 
301 aa  53.5  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  27.76 
 
 
445 aa  52.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  29.96 
 
 
401 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2623  putative ribonuclease BN  28.41 
 
 
278 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  25.94 
 
 
328 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  34.34 
 
 
313 aa  48.9  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  25.66 
 
 
384 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  24.23 
 
 
317 aa  48.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  26.92 
 
 
451 aa  48.5  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  22.73 
 
 
320 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  26.39 
 
 
316 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  33.64 
 
 
338 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1184  ribonuclease BN  27.51 
 
 
278 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2846  putative ribonuclease BN  27.51 
 
 
278 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  33.64 
 
 
338 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  33.33 
 
 
318 aa  47  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  23.32 
 
 
392 aa  46.6  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  28.87 
 
 
277 aa  46.2  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  27.48 
 
 
367 aa  45.8  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0964  ribonuclease BN  28.57 
 
 
285 aa  46.2  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  33.7 
 
 
396 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  23.59 
 
 
499 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  32.61 
 
 
397 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08810  predicted membrane protein  25.42 
 
 
417 aa  44.7  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0487855  normal  0.0524825 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  31.96 
 
 
397 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  33.73 
 
 
317 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  33.96 
 
 
363 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  24.05 
 
 
289 aa  43.9  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1994  ribonuclease BN  35.48 
 
 
306 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  30.91 
 
 
338 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3478  ribonuclease BN  29.41 
 
 
289 aa  43.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000152191  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2816  ribonuclease BN  26.15 
 
 
285 aa  43.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  25.1 
 
 
276 aa  42.7  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  26.22 
 
 
300 aa  42.7  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  23.88 
 
 
402 aa  42.4  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  32.91 
 
 
374 aa  42  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  28.42 
 
 
318 aa  42  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  28.42 
 
 
318 aa  42  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  28.42 
 
 
319 aa  42  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3558  ribonuclease BN, putative  31.03 
 
 
325 aa  42  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>