278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0865 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0865  ribonuclease BN  100 
 
 
342 aa  665    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.756909  normal  0.214041 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3484  ribonuclease BN  44.05 
 
 
378 aa  199  5e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1631  ribonuclease BN  40.43 
 
 
397 aa  171  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3221  ribonuclease BN  40.08 
 
 
278 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2446  ribonuclease BN  38.63 
 
 
263 aa  158  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.805614  hitchhiker  0.00565169 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1457  ribonuclease BN  35.2 
 
 
484 aa  156  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3200  ribonuclease BN  36.73 
 
 
258 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2359  ribonuclease BN  37.61 
 
 
437 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.389707  normal  0.121008 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3144  ribonuclease BN  36.63 
 
 
438 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0257  ribonuclease BN  43.77 
 
 
391 aa  139  7.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2153  ribonuclease BN  36.61 
 
 
260 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1535  ribonuclease BN  35.51 
 
 
469 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1009  ribonuclease BN  35.14 
 
 
301 aa  110  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2816  ribonuclease BN  32.82 
 
 
285 aa  90.9  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  29.77 
 
 
311 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  27.31 
 
 
324 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  27.24 
 
 
359 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2378  ribonuclease BN  30.91 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  29.35 
 
 
443 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  25.35 
 
 
363 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  27.8 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  28.57 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  28.74 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  24.82 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  28.57 
 
 
307 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  28.57 
 
 
307 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  28.57 
 
 
307 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  28.57 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0260  ribonuclease BN  28.38 
 
 
270 aa  77  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  24.72 
 
 
306 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  26.33 
 
 
370 aa  75.9  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  28.17 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  23.64 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  24.11 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  28.63 
 
 
310 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  28.63 
 
 
310 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  25 
 
 
294 aa  71.6  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  28.2 
 
 
436 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  28.46 
 
 
341 aa  72  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  23.36 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  22.79 
 
 
319 aa  69.7  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  27.73 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  29.43 
 
 
411 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  27.73 
 
 
314 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  27.73 
 
 
314 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  29.15 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  25.09 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  27.45 
 
 
311 aa  67  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  27.17 
 
 
286 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  24.72 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  22.3 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  23.19 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  24.51 
 
 
304 aa  65.1  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  27.82 
 
 
338 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  27.82 
 
 
338 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  24.56 
 
 
291 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  22.46 
 
 
283 aa  64.3  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  23.11 
 
 
360 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  21.69 
 
 
392 aa  63.9  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  24.81 
 
 
289 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  24.81 
 
 
289 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  24.81 
 
 
289 aa  63.9  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  24.81 
 
 
289 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  24.81 
 
 
289 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  24.81 
 
 
289 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  27.04 
 
 
384 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0874  hypothetical protein  72.34 
 
 
66 aa  63.2  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.178692 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  23.81 
 
 
299 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3886  ribonuclease  26.44 
 
 
332 aa  62.8  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  22.85 
 
 
347 aa  62.8  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  24.43 
 
 
289 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0034  ribonuclease BN  24.71 
 
 
294 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4186  ribonuclease BN  24.71 
 
 
294 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0030  ribonuclease BN  24.71 
 
 
294 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  22.9 
 
 
288 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  24.03 
 
 
328 aa  61.2  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  26.03 
 
 
546 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  27 
 
 
337 aa  60.8  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  22.9 
 
 
288 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  25.94 
 
 
316 aa  60.5  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  23.48 
 
 
311 aa  60.5  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  20.9 
 
 
321 aa  60.1  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  24.59 
 
 
499 aa  59.7  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  24.09 
 
 
313 aa  59.3  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  28.9 
 
 
305 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  26.77 
 
 
289 aa  59.3  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3115  ribonuclease BN  26.99 
 
 
321 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985292  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  23.53 
 
 
289 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  23.79 
 
 
374 aa  58.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  26.64 
 
 
375 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  28.12 
 
 
316 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5841  ribonuclease BN  23.72 
 
 
290 aa  57  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  22.89 
 
 
298 aa  57.4  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  24.01 
 
 
300 aa  56.2  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  22.19 
 
 
320 aa  56.2  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  26.32 
 
 
338 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  25.57 
 
 
301 aa  55.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  24.55 
 
 
386 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  25.58 
 
 
401 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  23.95 
 
 
359 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>