More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2359 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2359  ribonuclease BN  100 
 
 
437 aa  843    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.389707  normal  0.121008 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1457  ribonuclease BN  38.59 
 
 
484 aa  303  6.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3144  ribonuclease BN  40.23 
 
 
438 aa  294  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1535  ribonuclease BN  41.09 
 
 
469 aa  269  7e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2446  ribonuclease BN  47.26 
 
 
263 aa  204  3e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.805614  hitchhiker  0.00565169 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3484  ribonuclease BN  35.19 
 
 
378 aa  190  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3200  ribonuclease BN  44.44 
 
 
258 aa  180  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2153  ribonuclease BN  48.4 
 
 
260 aa  171  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1631  ribonuclease BN  37.15 
 
 
397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3221  ribonuclease BN  43.6 
 
 
278 aa  157  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0865  ribonuclease BN  38.55 
 
 
342 aa  145  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.756909  normal  0.214041 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0260  ribonuclease BN  34.78 
 
 
270 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2378  ribonuclease BN  37.6 
 
 
261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1009  ribonuclease BN  32.63 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2816  ribonuclease BN  36.43 
 
 
285 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0711  ribonuclease BN  52.63 
 
 
191 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.536334 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0257  ribonuclease BN  33.98 
 
 
391 aa  94.4  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  27.6 
 
 
276 aa  90.5  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  24.91 
 
 
363 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  28.08 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  25.72 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  27.78 
 
 
324 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  24.12 
 
 
283 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  25.97 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  22.71 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19220  predicted membrane protein  26.68 
 
 
463 aa  70.5  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.234203  normal  0.518782 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  26.1 
 
 
306 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  26.02 
 
 
299 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  25.82 
 
 
299 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  24.54 
 
 
451 aa  68.9  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  29.5 
 
 
384 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  25 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  27.82 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  26.29 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  25.4 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  26.21 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  26.94 
 
 
386 aa  66.6  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  26.21 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  26.29 
 
 
289 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  26.29 
 
 
289 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  26.29 
 
 
289 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  26.29 
 
 
289 aa  66.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  26.29 
 
 
289 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1979  hypothetical protein  24.37 
 
 
479 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  26.29 
 
 
289 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  30 
 
 
338 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  30 
 
 
338 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  23.95 
 
 
320 aa  64.7  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  25.1 
 
 
360 aa  64.3  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  24.57 
 
 
318 aa  64.3  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  25.58 
 
 
301 aa  64.3  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  30.77 
 
 
320 aa  63.9  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  28.85 
 
 
338 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  23.32 
 
 
337 aa  63.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  25.9 
 
 
289 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  26.05 
 
 
317 aa  62.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0739  putative ribonuclease BN  23.49 
 
 
434 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  23.03 
 
 
337 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01081  serum resistance locus BrkB-like protein  24.82 
 
 
313 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  22.71 
 
 
443 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2776  putative ribonuclease BN  24.01 
 
 
417 aa  63.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1819  putative ribonuclease BN  23.53 
 
 
442 aa  62.4  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.10172  normal  0.193645 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0014  putative ribonuclease BN  24.29 
 
 
450 aa  62  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0964  ribonuclease BN  27.64 
 
 
285 aa  61.6  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  23.08 
 
 
443 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  29.13 
 
 
300 aa  62.4  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  22.71 
 
 
443 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1463  serum resistance locus BrkB-like protein  26.57 
 
 
304 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01651  serum resistance locus BrkB-like protein  26.57 
 
 
304 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.596268  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  23.02 
 
 
291 aa  61.2  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5841  ribonuclease BN  26.52 
 
 
290 aa  61.6  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  22.34 
 
 
437 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0764  ribonuclease BN  23.85 
 
 
452 aa  61.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  30.8 
 
 
337 aa  60.8  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  22.34 
 
 
437 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  23.65 
 
 
402 aa  60.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  22.34 
 
 
437 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  22.34 
 
 
437 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0363  serum resistance locus BrkB-like  27.55 
 
 
332 aa  60.5  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  30.32 
 
 
349 aa  60.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  22.34 
 
 
437 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4548  ribonuclease BN  29.84 
 
 
349 aa  60.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  28.57 
 
 
341 aa  60.5  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2773  ribonuclease BN  22.26 
 
 
437 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  22.78 
 
 
446 aa  60.1  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  26.83 
 
 
301 aa  60.1  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0702  ribonuclease BN  24.75 
 
 
322 aa  59.7  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0931  putative ribonuclease BN  23.08 
 
 
459 aa  59.7  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  28.12 
 
 
292 aa  59.7  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  24.56 
 
 
316 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2779  ribonuclease BN  24.12 
 
 
453 aa  59.3  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00809939  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0818  ribonuclease BN  18.42 
 
 
405 aa  59.3  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  23.1 
 
 
442 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001900  ribonuclease BN  24.31 
 
 
314 aa  59.7  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.886374  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  27.02 
 
 
311 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  28.12 
 
 
292 aa  59.7  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  25.2 
 
 
297 aa  59.3  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1576  ribonuclease BN-like family protein  30.77 
 
 
282 aa  59.7  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  22.74 
 
 
337 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  25.27 
 
 
314 aa  59.7  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.290543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>