More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2276 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  100 
 
 
337 aa  597  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  99.67 
 
 
307 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  100 
 
 
307 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  99.67 
 
 
307 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  99.35 
 
 
307 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  99.34 
 
 
304 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  94.46 
 
 
325 aa  528  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  78.52 
 
 
308 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  77.7 
 
 
314 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  77.7 
 
 
314 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  72.82 
 
 
310 aa  425  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  73.05 
 
 
311 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  76.22 
 
 
341 aa  423  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  72.17 
 
 
310 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  74.3 
 
 
443 aa  408  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  72.54 
 
 
436 aa  391  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  79.6 
 
 
411 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  55.84 
 
 
324 aa  317  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  53.16 
 
 
311 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  51.46 
 
 
305 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  54.93 
 
 
305 aa  222  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  42.6 
 
 
300 aa  196  6e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  39.34 
 
 
321 aa  191  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  36.46 
 
 
306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  39.01 
 
 
321 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  38.08 
 
 
316 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  38.73 
 
 
299 aa  186  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  37.63 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  36.88 
 
 
347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  36.65 
 
 
360 aa  179  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  40.58 
 
 
329 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  38.41 
 
 
427 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  34.77 
 
 
311 aa  165  9e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  38.04 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  35.79 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  39.93 
 
 
329 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  39.93 
 
 
329 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  33.69 
 
 
322 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  35.29 
 
 
298 aa  159  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  30.24 
 
 
317 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  39.87 
 
 
326 aa  155  6e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  30.71 
 
 
424 aa  155  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  32.41 
 
 
307 aa  153  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  33.45 
 
 
370 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  31.29 
 
 
305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  31.43 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  35.59 
 
 
312 aa  145  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  34.75 
 
 
299 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  35 
 
 
303 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  32.04 
 
 
323 aa  139  3.9999999999999997e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  37.55 
 
 
301 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  34.21 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  30.38 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  33.99 
 
 
314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  34.41 
 
 
292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  34.44 
 
 
294 aa  127  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  34.41 
 
 
292 aa  127  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  31.53 
 
 
302 aa  126  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  31.15 
 
 
320 aa  122  8e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  35.48 
 
 
331 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  35.14 
 
 
393 aa  120  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  37.37 
 
 
334 aa  112  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  37.74 
 
 
306 aa  112  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  33.71 
 
 
321 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  34.93 
 
 
309 aa  105  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  23.53 
 
 
306 aa  98.2  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4260  ribonuclease BN  28.28 
 
 
290 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  28.28 
 
 
290 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  28.28 
 
 
290 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  28.28 
 
 
290 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4416  ribonuclease BN  28.28 
 
 
290 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03771  ribonuclease BN  27.18 
 
 
290 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4100  ribonuclease BN  27.18 
 
 
290 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4111  ribonuclease BN  27.18 
 
 
290 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235548  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4409  ribonuclease BN  27.18 
 
 
290 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4271  ribonuclease BN  27.18 
 
 
290 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03720  hypothetical protein  27.18 
 
 
290 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.664641  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4364  ribonuclease BN  27.18 
 
 
290 aa  95.5  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4132  ribonuclease BN  27.18 
 
 
290 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5333  ribonuclease BN  27.18 
 
 
290 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.247154 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  35.47 
 
 
305 aa  93.6  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  35.77 
 
 
305 aa  92.4  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  28.67 
 
 
290 aa  92  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  23.89 
 
 
322 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  23.89 
 
 
322 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  28.32 
 
 
298 aa  85.9  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  27.86 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4878  ribonuclease BN  27.02 
 
 
296 aa  82.8  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000922798 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  26.05 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  29.01 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  28.63 
 
 
337 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  27.49 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  26.74 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  27.86 
 
 
285 aa  79  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4186  ribonuclease BN  27.08 
 
 
294 aa  79  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0034  ribonuclease BN  27.08 
 
 
294 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  23.19 
 
 
306 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0030  ribonuclease BN  27.08 
 
 
294 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1406  ribonuclease BN  23.95 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.573356  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  26.09 
 
 
368 aa  77  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>