298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0769 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  100 
 
 
411 aa  794    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  85.15 
 
 
443 aa  600  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  69.27 
 
 
436 aa  491  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  79.25 
 
 
307 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  79.25 
 
 
337 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  79.34 
 
 
325 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  79.25 
 
 
307 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  79.25 
 
 
304 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  79.25 
 
 
307 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  78.84 
 
 
307 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  74.7 
 
 
341 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  74.31 
 
 
310 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  73.91 
 
 
310 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  73.12 
 
 
314 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  73.12 
 
 
314 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  72.91 
 
 
308 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  71.54 
 
 
311 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  58.62 
 
 
324 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  57.14 
 
 
311 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  54.98 
 
 
305 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  48.26 
 
 
305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  42.75 
 
 
300 aa  189  5.999999999999999e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  40.66 
 
 
316 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  40 
 
 
306 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  38.64 
 
 
321 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  39.3 
 
 
299 aa  179  9e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  38.52 
 
 
291 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  42.63 
 
 
427 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  36.76 
 
 
360 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  41.11 
 
 
329 aa  170  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  37.96 
 
 
321 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  36.14 
 
 
311 aa  156  7e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  32.31 
 
 
424 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  37.15 
 
 
321 aa  153  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  34.12 
 
 
307 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  32.66 
 
 
317 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  37.24 
 
 
324 aa  150  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  37.2 
 
 
347 aa  149  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  44.76 
 
 
326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  34.77 
 
 
324 aa  146  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  35.56 
 
 
304 aa  146  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  32.81 
 
 
305 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  36.1 
 
 
298 aa  144  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  36.33 
 
 
312 aa  144  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  39.43 
 
 
329 aa  143  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  39.43 
 
 
329 aa  143  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  38.6 
 
 
303 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  32.17 
 
 
322 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  32.85 
 
 
370 aa  138  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  37.08 
 
 
301 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  36 
 
 
299 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  30.47 
 
 
299 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  29.23 
 
 
323 aa  130  5.0000000000000004e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  36.29 
 
 
292 aa  130  6e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  34.94 
 
 
320 aa  129  7.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  36.29 
 
 
292 aa  129  9.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  36.99 
 
 
314 aa  126  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  34.07 
 
 
302 aa  125  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  36.36 
 
 
306 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  32.8 
 
 
393 aa  117  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  34.8 
 
 
331 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  36.19 
 
 
294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  37.25 
 
 
334 aa  106  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  34.59 
 
 
321 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  33.72 
 
 
309 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  35.88 
 
 
305 aa  99.4  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  35.88 
 
 
305 aa  99  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  24.74 
 
 
322 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  24.74 
 
 
322 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  23.02 
 
 
306 aa  86.7  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  28.74 
 
 
336 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  28.36 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4026  ribonuclease BN  30 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.194003 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  28.68 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  28.68 
 
 
337 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  28.68 
 
 
337 aa  77  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  28.68 
 
 
323 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  28.68 
 
 
323 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  28.68 
 
 
323 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  31.13 
 
 
285 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  23.26 
 
 
306 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  24.7 
 
 
276 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  28.29 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  29.76 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03771  ribonuclease BN  27.21 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4100  ribonuclease BN  27.21 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03720  hypothetical protein  27.21 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.664641  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4132  ribonuclease BN  27.21 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4271  ribonuclease BN  27.21 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5333  ribonuclease BN  27.21 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.247154 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4364  ribonuclease BN  27.21 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4409  ribonuclease BN  27.21 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4111  ribonuclease BN  27.21 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235548  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  31.9 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  28.89 
 
 
443 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  28.89 
 
 
443 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  28.03 
 
 
330 aa  73.2  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  29.77 
 
 
447 aa  73.2  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1559  putative ribonuclease BN transmembrane protein  30.91 
 
 
441 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  27.73 
 
 
290 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>