More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1631 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1631  ribonuclease BN  100 
 
 
397 aa  785    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3484  ribonuclease BN  61.96 
 
 
378 aa  465  9.999999999999999e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2446  ribonuclease BN  42.5 
 
 
263 aa  177  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.805614  hitchhiker  0.00565169 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3200  ribonuclease BN  41.3 
 
 
258 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3144  ribonuclease BN  33.6 
 
 
438 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1457  ribonuclease BN  28.19 
 
 
484 aa  171  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3221  ribonuclease BN  42.02 
 
 
278 aa  164  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0865  ribonuclease BN  39.86 
 
 
342 aa  162  7e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.756909  normal  0.214041 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2359  ribonuclease BN  41.18 
 
 
437 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.389707  normal  0.121008 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1535  ribonuclease BN  30.49 
 
 
469 aa  146  6e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2153  ribonuclease BN  38.24 
 
 
260 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1009  ribonuclease BN  39.68 
 
 
301 aa  117  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0257  ribonuclease BN  37.5 
 
 
391 aa  113  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0260  ribonuclease BN  32.91 
 
 
270 aa  112  8.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2378  ribonuclease BN  30.28 
 
 
261 aa  97.1  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  27.2 
 
 
443 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2816  ribonuclease BN  30.68 
 
 
285 aa  86.7  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  28.68 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  28.68 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  28.68 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  28.68 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  28.68 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  28.68 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  28.21 
 
 
289 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  28.03 
 
 
286 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  28.68 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  27.16 
 
 
317 aa  82  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  28.68 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  28.27 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  30.66 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  25.71 
 
 
363 aa  77  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  29.34 
 
 
325 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  30.86 
 
 
308 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  30.86 
 
 
314 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  29.93 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  30.86 
 
 
314 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  29.6 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  26.44 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  23.88 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  29.1 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  27.96 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  26.12 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  29.1 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  29.96 
 
 
341 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  23.88 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  29.1 
 
 
307 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  29.1 
 
 
307 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  29.1 
 
 
307 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19220  predicted membrane protein  26.88 
 
 
463 aa  72.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.234203  normal  0.518782 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  29.1 
 
 
304 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  26.34 
 
 
324 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  25.85 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  25.59 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  23.62 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  26.67 
 
 
396 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  25.2 
 
 
316 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  25.59 
 
 
397 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  25.1 
 
 
328 aa  70.1  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  26.23 
 
 
321 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  26.39 
 
 
359 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  24.83 
 
 
306 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  24.72 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  27.89 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  28.4 
 
 
436 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  26.67 
 
 
349 aa  67.4  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  26.19 
 
 
311 aa  67  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  24.35 
 
 
299 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.82 
 
 
428 aa  67  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000260717  hitchhiker  0.000176219 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5841  ribonuclease BN  26.54 
 
 
290 aa  66.6  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  27.4 
 
 
292 aa  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  25.84 
 
 
384 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  27.4 
 
 
292 aa  66.2  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  25.97 
 
 
299 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  23.3 
 
 
341 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  27.24 
 
 
316 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  26.02 
 
 
427 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  28.17 
 
 
386 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  27.31 
 
 
323 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1979  hypothetical protein  27.69 
 
 
479 aa  63.9  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2776  putative ribonuclease BN  25.37 
 
 
417 aa  63.5  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  27.24 
 
 
300 aa  63.5  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  25.1 
 
 
276 aa  63.5  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  26.72 
 
 
402 aa  63.5  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  26.37 
 
 
316 aa  63.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  26.77 
 
 
374 aa  63.5  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  23.77 
 
 
292 aa  63.2  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  27.27 
 
 
337 aa  62.4  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  26.1 
 
 
311 aa  62.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  27.27 
 
 
291 aa  62  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  26.42 
 
 
321 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  28.06 
 
 
388 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  24.62 
 
 
386 aa  60.8  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  24.9 
 
 
320 aa  60.8  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  25.45 
 
 
299 aa  60.8  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  29.07 
 
 
367 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  26.92 
 
 
347 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  22.76 
 
 
371 aa  60.1  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  24.29 
 
 
360 aa  60.1  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  27.05 
 
 
347 aa  59.7  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  34.68 
 
 
277 aa  60.1  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>