More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0703 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  100 
 
 
325 aa  639    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  91.36 
 
 
337 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  94.79 
 
 
307 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  94.79 
 
 
307 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  94.46 
 
 
307 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  94.46 
 
 
307 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  94.41 
 
 
304 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  78.4 
 
 
314 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  78.4 
 
 
314 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  74.92 
 
 
310 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  78.05 
 
 
311 aa  433  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  78.87 
 
 
308 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  74.27 
 
 
310 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  77 
 
 
341 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  73.17 
 
 
443 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  70.33 
 
 
436 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  79.05 
 
 
411 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  57.19 
 
 
324 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  54.01 
 
 
311 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  52.29 
 
 
305 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  56.09 
 
 
305 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  43.17 
 
 
300 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  39.71 
 
 
321 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  38.08 
 
 
316 aa  193  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  39.77 
 
 
299 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  37.92 
 
 
291 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  36.94 
 
 
306 aa  185  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  40 
 
 
321 aa  185  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  41.22 
 
 
329 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  35.64 
 
 
360 aa  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  36.3 
 
 
347 aa  176  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  39.86 
 
 
427 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  40.29 
 
 
329 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  40.29 
 
 
329 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  35.61 
 
 
311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  39.53 
 
 
324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  36.63 
 
 
321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  41.37 
 
 
326 aa  159  9e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  34.73 
 
 
322 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  30.88 
 
 
317 aa  155  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  35.5 
 
 
298 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  30.74 
 
 
424 aa  151  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  35.62 
 
 
312 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  32.59 
 
 
307 aa  149  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  36.71 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  35.48 
 
 
299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  30.41 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  34.48 
 
 
370 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  31.87 
 
 
305 aa  145  7.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  30.38 
 
 
299 aa  139  6e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  31.21 
 
 
323 aa  136  4e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  37.05 
 
 
301 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  34.65 
 
 
304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  33.33 
 
 
314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  34.77 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  34.77 
 
 
292 aa  130  3e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  34.23 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  32.35 
 
 
320 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  31.67 
 
 
302 aa  125  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  33.99 
 
 
331 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  33.46 
 
 
393 aa  120  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  37.37 
 
 
334 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  37.3 
 
 
306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  32.89 
 
 
321 aa  109  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  35.18 
 
 
309 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  34.84 
 
 
305 aa  102  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  24.53 
 
 
306 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  35.18 
 
 
305 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  27.61 
 
 
290 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  27.61 
 
 
290 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  27.61 
 
 
290 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4416  ribonuclease BN  27.61 
 
 
290 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4260  ribonuclease BN  27.61 
 
 
290 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  24.82 
 
 
322 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  24.82 
 
 
322 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03771  ribonuclease BN  25.84 
 
 
290 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4100  ribonuclease BN  25.84 
 
 
290 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4111  ribonuclease BN  25.84 
 
 
290 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235548  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4271  ribonuclease BN  25.84 
 
 
290 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03720  hypothetical protein  25.84 
 
 
290 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.664641  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4409  ribonuclease BN  25.84 
 
 
290 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5333  ribonuclease BN  25.84 
 
 
290 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.247154 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4132  ribonuclease BN  25.84 
 
 
290 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  28.67 
 
 
337 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4364  ribonuclease BN  25.84 
 
 
290 aa  88.2  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  27.62 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  28.32 
 
 
337 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  28.32 
 
 
337 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  29.39 
 
 
298 aa  86.3  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  31.06 
 
 
447 aa  83.2  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  27.76 
 
 
336 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  28.24 
 
 
285 aa  82  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  29.39 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  28.87 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  28.87 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  28.87 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  25.74 
 
 
368 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  23.19 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  28.52 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  28.57 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>