More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0964 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0964  ribonuclease BN  100 
 
 
285 aa  566  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  28.04 
 
 
289 aa  106  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  29.39 
 
 
289 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  27.93 
 
 
289 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  27.93 
 
 
289 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  27.93 
 
 
289 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  27.93 
 
 
289 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  27.93 
 
 
289 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  27.93 
 
 
289 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  28.03 
 
 
286 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  28.72 
 
 
288 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  28.72 
 
 
288 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  27.04 
 
 
277 aa  86.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0935  ribonuclease BN  28.08 
 
 
432 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  31.37 
 
 
330 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  28.73 
 
 
277 aa  77  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  25.62 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1653  putative ribonuclease BN  28.09 
 
 
449 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.957488  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  31.65 
 
 
367 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  27.84 
 
 
352 aa  72.8  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  25.71 
 
 
374 aa  72.4  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  24.1 
 
 
411 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  24.1 
 
 
411 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  26.39 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1471  ribonuclease BN  25.97 
 
 
422 aa  70.1  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.604096 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0764  ribonuclease BN  27.27 
 
 
452 aa  69.3  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  29.51 
 
 
322 aa  69.3  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  27.6 
 
 
331 aa  68.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  27.21 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  24.91 
 
 
446 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  27.82 
 
 
388 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3954  ribonuclease BN  22.26 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  28.47 
 
 
322 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  27.82 
 
 
388 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  25.29 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  26.26 
 
 
408 aa  66.2  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  25.27 
 
 
283 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  23.83 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1323  ribonuclease BN  26.64 
 
 
427 aa  65.9  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  25.63 
 
 
283 aa  65.9  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  26.95 
 
 
328 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  26.05 
 
 
446 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000174757 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1005  putative ribonuclease BN  27.07 
 
 
318 aa  64.7  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  24.62 
 
 
386 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  28.2 
 
 
299 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1623  ribonuclease BN  27.59 
 
 
428 aa  64.3  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.722239  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  26.09 
 
 
311 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1457  ribonuclease BN  28.63 
 
 
484 aa  64.3  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  24.81 
 
 
310 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  24.82 
 
 
386 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04555  ribonuclease BN/unknown domain fusion protein  25.63 
 
 
425 aa  64.7  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  24.81 
 
 
310 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  25.53 
 
 
317 aa  63.9  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5841  ribonuclease BN  26.98 
 
 
290 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  29.3 
 
 
300 aa  63.5  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1521  ribonuclease BN  26.83 
 
 
441 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00169169  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  27.9 
 
 
324 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  27.61 
 
 
349 aa  63.9  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  25.9 
 
 
359 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  25 
 
 
308 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  26.09 
 
 
314 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  26.09 
 
 
314 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  25 
 
 
392 aa  63.2  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1636  ribonuclease BN  25.57 
 
 
447 aa  63.2  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  27.44 
 
 
386 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  26.48 
 
 
316 aa  62.4  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  26.14 
 
 
276 aa  62.4  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  27.04 
 
 
375 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  25.56 
 
 
311 aa  61.6  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  25.17 
 
 
451 aa  61.2  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  25.75 
 
 
341 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  26.96 
 
 
323 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  26.77 
 
 
347 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  29.01 
 
 
313 aa  60.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  28.84 
 
 
351 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  25.35 
 
 
384 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1013  ribonuclease BN  25.81 
 
 
427 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.58276 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2446  ribonuclease BN  31.05 
 
 
263 aa  60.8  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.805614  hitchhiker  0.00565169 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  22.54 
 
 
313 aa  60.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1765  YihY family protein  36.47 
 
 
278 aa  60.1  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  27.57 
 
 
347 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  27.57 
 
 
347 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  27.88 
 
 
320 aa  60.1  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5015  ribonuclease BN  23.79 
 
 
310 aa  60.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778134  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  26.07 
 
 
370 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0409  ribonuclease BN  36.47 
 
 
278 aa  60.1  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  25.46 
 
 
291 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  27.65 
 
 
318 aa  59.7  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  25.62 
 
 
414 aa  59.3  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  25.36 
 
 
330 aa  59.7  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4186  ribonuclease BN  24.91 
 
 
294 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  26.38 
 
 
333 aa  59.3  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0034  ribonuclease BN  26.16 
 
 
294 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3053  putative ribonuclease BN  26.98 
 
 
451 aa  59.3  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  32.38 
 
 
295 aa  59.3  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0030  ribonuclease BN  24.91 
 
 
294 aa  59.3  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  26.09 
 
 
298 aa  58.9  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4100  ribonuclease BN  27.14 
 
 
290 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4111  ribonuclease BN  27.14 
 
 
290 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235548  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  33.33 
 
 
298 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>